8/18/2016 Giới thiệu môn học Danh pháp v Phân loại Vi sinh vËt H×nh thĨ, cÊu tróc, sinh lý VK, VR Phân bố vi sinh vật, Các đờng truyền bệnh Y2 BS-2016-2017 PGS TS Ngun Vị Trung Mơc tiªu Trình by đợc số khái niệm: Vi sinh vật, vi sinh vËt häc, vi sinh vËt y häc, vi khuẩn, vi rút Mô tả đợc đối tợng nghiên cøu cđa vi sinh vËt y häc, kh¸i niƯm vỊ danh pháp v phân loại vi sinh vật Trình bμy H×nh thĨ, cÊu tróc, sinh lý VK, VR Bé môn Vi sinh Bộ môn Vi sinh-Ký sinh trùng lâm sng Đại học Y H Nội Khoa Xét nghiệm, Bệnh viện BNĐTƯ Mô tả phân bố vi sinh vật, đờng truyền bệnh Ti liệu tham khảo Nội dung Vi sinh vËt y häc, NXBYH, 2007 Vi sinh-ký sinh trïng l©m sμng, NXBYH, 2014 Vi khuÈn y häc, NXBGDVN, 2009 Principles and Practice of Clinical Bacteriology 2nd Ed, Wiley, 2007 Virology: Principles and Applications, John Wiley and Sons, Ltd, 2007 Principles and Practice of Clinical Parasitology, Wiley, 2001 Sự đa dạng sinh giới Giới thiệu môn học Danh pháp v Phân loại Vi sinh vật Hình thể, cấu tróc, sinh lý VK, VR Ph©n bè vi sinh vật Các đờng truyền bệnh Vi sinh vật: lợi v hại ??? ã Lợi + Oxy, ni tơ + Bánh mì + Kháng sinh + Vắc xin + Công nghệ ã Hại 8/18/2016 Impact of Infectious Disease Smallpox of Infectious Disease SARS New coronavirus Caused two airborne virus variants, Variola major and Variola minor Severe acute respiratory syndrome caused by the SARS coronavirus, an enveloped RNA virus Deadly disease that, in survivors, can cause disfigurement and blindness Approx 500 million deaths worldwide in the 20th century Eradicated in 1979 though widespread vaccination One near pandemic to date, with 8,096 known infected cases and 774 deaths (fatality rate of 9.6%) Within a matter of weeks in early 2003, SARS spread from a province of China to infect individuals in 37 countries Majority of those who became sick were household contacts and health care workers In 2012, new coronavirus Now still possible weapon of bioterrorism Images: Girl with smallpox, James Hicks, CDC; Electron micrograph of smallpox virus, Magnus Manske; Smallpox vs Chickenpox Impact From the Virtual Microbiology Classroom on ScienceProfOnline.com H5N1, H1N1, H7N9 Images: Sars coronavirus, CDC “So s¸nh vi khuẩn v ngời Xut hin trái t Vi khuẩn 3,500,000,000 >< Ngời 4,000,000 S lng trái đất Vi khuÈn – 50,000 billion billion billion >< Ngưêi – 6,000,000,000 Trong lượng (tấn) Vi khuÈn – 50,000,000 billion >< Ngưêi – 300,000,000 Thời gian/thế hệ Vi khuÈn– 20 phút >< Ngời 20 năm Spellberg, B, et.al., Clinical Infectious Diseases 2008:46 Mét sè mèc quan träng - 1674: Anton van Leeuwenhock chÕ t¹o “KHV” (nhμ sinh häc Hμ Lan) - 1774: Otto Muller: Kh¸i niƯm gièng/chi vμ loμi - 1840: Friedrich Henle (BÖnh häc Đức): “germ” - 1870-1880s: Rober Koch Louis Pasteur “Căn nguyên Bệnh nhiễm trùng” - 1910: Paul Ehrlich (Đức): antibacterial agent - 1928: Flemings: Penicillin (sulfonamide-1935, streptomycin-1943) - 1946: John Enders (Mỹ): Nuôi cấy vi rút - …………… Dựa vào cấu tạo tế bào + Eucaryotic cells + Procaryotic cells Dựa vào hình thể, chuyển hóa + Animalia: Động vật + Plantae: tế bào có nhân điển hình, quang hợp + Fungi: Eucaryotic, dinh dưỡng thẩm thấu, đa bào + Protista: Eucaryotic đơn đa bào, thiếu mô + Procaryotae: Procaryotic 8/18/2016 Néi dung Giới thiệu môn học Danh pháp v Phân loại Vi sinh vật số kháI niệm - Phân loại (Classsification) Xếp VSV vo nhóm có hệ thống dùa vμo mèi quan hƯ - Danh ph¸p (Nomenclasture) H×nh thĨ, cÊu tróc, sinh lý VK, VR ThiÕt kÕ tên cho nhóm phân loại Phân bố vi sinh vật - Định danh (Identification) Các đờng truyền bệnh Danh pháp Vi khuẩn - Danh pháp: Tên không thống (địa phơng) Tên khoa học Danh pháp vi rút Quá trình xác định VSV đợc phân lập thuộc nhóm? Danh pháp vi khuẩn - Lu ý: + Tên Latin (Chi-Loi) + Cách viết (Escherichia coli) + Tên không giá trị + Tên có khả chuyển sang ngôn ngữ khác, số nhiều Phõn loi vi sinh vt 8/18/2016 lịch sử Phân loại vi khuẩn phân loại vi khuẩn - 1653 H Lan: Kính hiển vi - 7/9/1674: Leeuwenhoek mô tả VK -> CK, TK, XK: Phân loại - Phân loại Cổ điển v Hiện đại lịch sử Phân loại vi khuẩn Phân loại Cổ điển - Chủ yếu dựa vo hình thể - Cha có nuôI cấy (R Kock 24/3/1882) Nhuộm soi Nhuộm soi Đặc điểm nuôi cấy Tính chất sinh vật hóa học Tính chất kháng nguyên Tính chất ly giải phage Tính chất gây bệnh thực nghiệm Vi sinh vật có hình thể, cách săp xếp, tính chất bắt mu, di động điển hình Giá trị: - Một số trờng hợp đặc biệt - Định hớng Hình thể, kích thớc vi khuẩn Cầu khuẩn loại lớn + Cầu khuẩn: Hình tròn, bầu dục, nến Kích thớc (đờng kính) khoảng m Đơn cầu, song cầu, tứ cầu, tụ cầu, liên cầu + Trực khuẩn: Hình que, đầu tròn hay vuông Kích thớc x 2-5 m Bacteria: Không sinh nha bo (VK đờng ruột) Bacilli: Sinh nha bμo, hiÕu khÝ (B anthracis) Clostridia: Sinh nha bo, kị khí (C tetani, C botulinum) + Xoắn khuẩn: Hình sợi, lợn sóng Kích thớc: Di tới 30 m 8/18/2016 Đặc điểm nuôi cấy Nhuộm soi Đặc điểm nu«i cÊy TÝnh chÊt sinh vËt hãa häc TÝnh chÊt kháng nguyên Tính chất ly giải phage Tính chất gây bệnh thực nghiệm Khuẩn lạc Vi sinh vật có tính chất phát triển đặc biệt Giá trị: - Một số trờng hợp đặc biệt - Vi hiếu khí, kị khí, hiếu kị khí tùy tiện, cần CO2, cần máu, cÇn vitamin TÝnh chÊt sinh vËt hãa häc Nhuém soi Đặc điểm nuôi cấy Tính chất sinh vật hóa học Tính chất kháng nguyên Tính chất ly giải phage Tính chất gây bệnh thực nghiệm ống sinh v lên men Đặc điểm chuyển hóa riêng vi sinh vật Giá trị: - Dùng để xác định - Phơ thc vμo c¸c Bé sinh vËt hãa häc - Tính chất kháng nguyên Nhuộm soi Đặc điểm nuôi cÊy TÝnh chÊt sinh vËt hãa häc TÝnh chÊt kh¸ng nguyên Tính chất ly giải phage Tính chất gây bệnh thực nghiệm Khả ngng kết với kháng thể đặc hiệu Giá trị: Tính chất ly giải phage Nhuộm soi Đặc điểm nuôi cấy Tính chất sinh vật hóa học Tính chất kháng nguyên Tính chất ly giải phage Tính chất gây bệnh thực nghiệm Khả bị ly giải phage đặc hiệu Giá trị: - Dùng để xác định - Dùng để xác định - Phụ thuộc vo Bộ kháng thể đặc hiệu - Phức tạp, không đủ phage 8/18/2016 Gây bệnh thực nghiệm Nhuộm soi Đặc điểm nuôi cấy Tính chất sinh vật hóa học Tính chất kháng nguyên Tính chất ly giải phage Tính chất gây bệnh thực nghiệm Khả vi sinh vật tạo tổn thơng đặc hiệu súc vật thí nghiệm Máy định danh ã Số lợng test chuyển hóa >= 30 ã Định danh dựa vo động học chuyển hóa Giá trị: - Dùng để xác định - Phức tạp, tốn kém, tốn thời gian lịch sử Phân loại vi khuẩn Phân loại Hiện đại - Số hóa tính chất - Dựa nhiều vo cấu trúc (SHPT) phân loại vi khuẩn Hinh thể phân loại vi rút Sinh lý TCSVHH Phân loại Cấu trúc ADN 8/18/2016 Vi rút - đơn vị sống ? Vol 455|4 September 2008| doi:10.1038/nature Một số đặc ®iĨm cđa vi rót - RÊt nhá - ADN, ARN (1 sợi) - Không chuyển hóa - ký sinh bắt buộc - Không có vận chuyển qua mng - Tự lắp ráp Phân loại vi rút - Phân loại Cổ điển v Hiện đại New, Emerging and Re-emerging Diseases, 2008 Néi dung Giíi thiƯu m«n häc Danh pháp v Phân loại Vi sinh vật Hình thĨ, cÊu tróc, sinh lý VK, VR Ph©n bè vi sinh vật Các đờng truyền bệnh 1992> J Lederberg, S Morse, R Shope, S Oaks, M Hamburg, M Smolinski, others development of the concept of New, Emerging and Re-emerging Infectious Diseases, the basis for rebuilding infectious disease research 8/18/2016 Hình thể v kích thớc ã ã ã ã ã Mỗi loại vi khuẩn có ht, kt định Do vách qui định Tiêu chuẩn quan trọng để xác định Đo mi-cro-met (m) loại hình thể Thế giới vi sinh vật ã Kích thớc vô nhỏ bé ã Đơn vị đo kích thớc 1m = 1000 mm mm = 1000 m m = 1000 nm nm = 10 A = 1000 pm Hình thể, kích thớc vi khuẩn loại lớn + Cầu khuẩn: Hình tròn, bầu dục, nến Kích thớc (đờng kính) khoảng m Đơn cầu, song cầu, tứ cầu, tụ cầu, liên cầu + Trực khuẩn: Hình que, đầu tròn hay vuông Kích thớc x 2-5 m Bacteria: Không sinh nha bo (VK đờng ruột) Bacilli: Sinh nha bμo, hiÕu khÝ (B anthracis) Clostridia: Sinh nha bμo, kị khí (C tetani, C botulinum) + Xoắn khuẩn: Hình sỵi, lưỵn sãng KÝch thưíc: Dμi tíi 30 m kÝnh hiển vi ã Microscope: Kính hiển vi ã Lịch sử Antony van Leeuwenhoek (1632-1723), Holand Kính hiển vi Hình ảnh vi khuẩn ban đầu Giới hạn quan sát ã Mắt thưêng: 0,1-0,2 mm • KÝnh hiĨn vi quang häc: 100 nm ã Kính hiển vi điện tử: 0,1 nm 8/18/2016 Cấu trúc v chức tế bo vi khuẩn CÊu tróc tÕ bμo vi khn • Cã cÊu tróc tế bo ã Gồm thnh phần ã Thực chức sống Cấu trúc Nhân tế bo vi khuẩn ã ã ã • • • • • Nh©n TÕ bμo chÊt Mμng nguyên sinh Vách Vỏ Lông Pili Nha bo Plasmid ã • • • ADN khÐp kÝn ngoμi nhiƠm s¾c thĨ Có nhiều Nhỏ NST 100-1000 lần Chứa gen quan trọng ã ã ã ã Không có nhân điển hình ADN di khoảng 1mm, khép kín ADN hoạt động giống tế bo khác ADN E coli cã 4,6 x 106 bp m· ho¸ cho 4288 protein Plasmid -L thnh phần mang thông tin di truyền ngoi NST - L phân tử ADN xoắn kép dạng vòng khép kín - Có khả tự chÐp - KÝch thíc thay ®ỉi tõ 1,5-400 Kb 8/18/2016 Plasmid loại - Plasmid tiếp hợp (tự trun): + plasmid lín (60-120 Kb), vÝ dơ c¸c R-factor, Ffactor + Mang bé gen tra (transfer gene) -> bé máy tiếp hợp -> gen plasmid từ vi khn nμy sang vi khn kh¸c (cã thĨ cïng loμi khác loi) chúng tiếp xúc trực tiếp với - Plasmid không tiếp hợp (không tự truyền) + plasmid nhá (1,5-15Kb), vÝ dô mang mét sè gen sinh bacteriocin, số định đề kháng Tế bo chất • RNA víi kho¶ng 20 000 ribosome • Ribosome 70 S có tiểu phần (30 v 50 S) ã Ribosome l nơi tổng hợp protein Tế bo chất ã 80% nớc, dạng gel ã Bao gồm thnh phần hßa tan protein, peptit, acid amin, vitamin, ARN, ribosom, c¸c muèi kho¸ng (Ca, Na, P ) vμ mét sè nguyên tố ã 50% trọng lợng khô l protein ã Không có: ty thể, lạp thể, lới nội bo v quan phân bo Mng nguyên sinh ã Xung quanh nguyên sinh chất, phía vách ã 60% protein, 40% lipit m đa phần l photpholipid ã Có cấu trúc chung mng ã Có nhiều vai trò quan trọng Vách tế bo vi khuẩn ã Có vi khuẩn trừ Mycoplasma ã Cấu tạo đại phân tử glycopeptid (peptidoglycan, mucopeptid, murein) ã Gram Dơng: bao gồm nhiỊu líp peptidoglycan (40 líp, 15-80nm) • Gram Âm: chØ bao gåm mét líp peptidoglycan, vμ protein, lipid A vμ polysaccarid ã Hình dạng, chức khác 60 10 8/18/2016 Vá tÕ bμo vi khn • Mét líp nhμy láng lẻo, sền sệt, không rõ rệt bao quanh vi khuẩn ã Tùy loại vi khuẩn có cấu trúc khác ã Bảo vệ vi khuẩn ã Độc lực Di động cđa vi khn (1) L«ng cđa tÕ bμo vi khn ã Sợi protein di v xoắn tạo thnh từ acid amin ã L quan vận động ã Vị trí, số lợng khác ã ng dụng định danh Pili cđa tÕ bμo vi khn • Pili cã cấu trúc nh lông nhng ngắn v mỏng ã Pili giíi tÝnh, pili chung • Chđ u cã chøc bám Nha bo Nha bo C tetani Cấu trúc ã ADN v thnh phần khác nguyên sinh chất nằm thể nguyên sinh (thể bản) với tỷ lệ nớc thấp ã Mng nha bo bao bên ngoi thể nguyên sinh ã Vách bao ngoi mng ã Líp vá (trong vμ ngoμi) bao bªn ngoμi mμng nha bo ã Hai lớp áo ngoi v bao hai lớp vách 11 8/18/2016 Các yếu tố ảnh hởng đến sù ph¸t triĨn cđa vi khn Sinh lý cđa vi khuẩn ã Nhiệt độ ã pH ã Chất dinh dỡng ã Số lợng vi khuẩn ã Cạnh tranh Các yếu tố ảnh hởng đến phát triển vi khuẩn ã Nhiệt độ - Quan trọng (phản ứng tế bo, kiểu cách chuyển hoá, nhu cầu dinh dỡng, cấu tróc) - NhiƯt ®é tèi u hĐp Maximum tem for growth: 3-5 độ Minimum tem for growth: dới 20-40 ®é - E coli (21 phót/thÕ hƯ ë 36-42 ®é C) - 41h độ C Các yếu tố ảnh hởng đến phát triển vi khuẩn áp suÊt - at = 760 mm Hg = 101,325 kPa - 100 at ảnh hởng lớn Các yếu tố ảnh hởng đến phát triển vi khuẩn ã - pH 14 Khoảng pH hẹp, xung quanh Một số điều kiện khắc nghiÖt (extremophiles) Mäc ë pH thÊp (acidophiles), pH cao (alkaliphiles) - ứng dụng: Chỉ thị mu Các yếu tố ảnh hởng đến phát triển vi khuẩn Dinh dỡng - Chất dd: Hợp chất tham gia trao đổi chất nội bo - Ba loại: + Tham gia xây dựng + Trao đổi lợng + Vừa xây dựng, vừa trao đổi lợng - Một số yếu tố đặc biƯt 12 8/18/2016 Sinh lý cđa vi khn • Dinh dỡng ã Hô hấp ã Chuyển hóa Dinh dỡng vi khuẩn ã Cần nguồn dinh dỡng lớn ã Carbon, acid amin, ni-tơ ã Các enzyme phân hủy đại phân tử ã Phát triển ã Sinh sản Dinh dỡng vi khuẩn ã Cần nguồn dinh dỡng lớn ã Carbon, acid amin, ni-tơ ã Các enzyme phân hủy đại phân tử Sự phát triển vi khuẩn (2) Trong môi trờng lỏng Log số lợng vi khuẩn 1 ThÝch øng Sinh s¶n cđa vi khn Theo hμm sè mị Dõng tèi ®a Suy tn Sự phát triển liên cầu ã Theo kiểu phân đôi ã Khoảng 20 phút hệ ã Một số vi khuẩn chậm (Lao khoảng 30h) 13 8/18/2016 Hô hấp vi khuẩn ã L trình trao đổi chất tạo lợng v tổng hợp chất ã Hô hấp hiếu khí ã Hô hấp kị khí ã Hô hấp hiếu kị khí tùy tiện Hô hấp vi khuẩn ã Hô hấp kị khí Vi khuẩn không dùng oxy lm chất nhận điện tử cuối cùng, độc Hô hấp vi khuẩn ã H« hÊp hiÕu khÝ Vi khuÈn dïng oxy khÝ trêi để oxy hoá coenzyme khử Hô hấp vi khuẩn ã Hô hấp hiếu kị khí tùy tiện Vi khuẩn hiếu khí hô hấp theo kiểu lên men Chun hãa cđa vi khn • HƯ enzyme phøc tạp để chuyển hóa ã Chuyển hóa glucid, acid amin ã Tạo sản phẩm cuối, độc tố, chất gây sốt, kháng sinh, vitamin Phân loại vi rút Cấu trúc vi rút Phage Sự nhân lên vi rút Hậu tơng tác VR-TB 14 8/18/2016 Cấu trúc Cấu trúc Acid nucleic Capsid - Mà di truyền đặc trng cho vi rút - Quyết định khả gây nhiễm trùng vi rút tế bo cảm thụ - Quyết định chu kỳ nhân lên vi rút tế bo cảm thụ - Bán kháng nguyên đặc hiệu vi rút - Bao quanh AN - B¶n chÊt lμ protein - Đợc tạo capsomer (đơn vị), đặc thù - Chức năng: + Bảo vệ không cho enzym nuclease v c¸c u tè ph¸ hđy AN kh¸c + Tham gia vo bám vi rút vo vị trí đặc hiệu tế bo cảm thụ (với vi rút bao envelop) + Tính kháng nguyên đặc hiệu vi rút + Hình thái v kích thớc vi rút đợc ổn định Cấu trúc riªng CÊu tróc riªng Bao ngoμi Enzyme - Phức hợp: protein, lipid, carbohydrat, nói chung l lipoprotein glycoprotein NÕu chØ cã mμng (dilipid) NÕu cã gai nhó (spike) (glycoprotein) - Chức riêng envelop: + Bám VÝ dơ: gp120 cđa HIV hc hemagglutinin cđa vi rót cúm + Giai đoạn lắp ráp v giải phóng vi rót - ADN polymerase - ARN polymerase - Neuraminidase - Reverse transcriptase + Tính ổn định kích thớc v hình thái vi rút + Kháng nguyên đặc hiệu bề mặt vi rút Hình thể Một số khái niệm - Nhiều loại: Hình cầu, hình khối, hình sợi, hình que, hình chùy, hình khối phức tạp - Luôn ổn định loại vi rút - Tùy theo cách xếp acid nucleic v capsid m vi rút đợc chia lm hai loại đối xứng: + Hình xoắn ốc: hình lò xo hay không + Hình khối: capsomer virus đợc xếp thnh hình khối cầu đa diện + Phối hợp phần vi rút: đối xứng phøc t¹p - Virion: H¹t vi rót hoμn chØnh cã cấu trúc bản, số có cấu trúc riêng - Virus thiÕu hơt (Defective virus) H¹t vi rót khiÕm khuyết vi thnh phần cấu trúc trình chép Những hạt vi rút thiếu hụt ny giao thoa với hạt vi rút bình thờng (virion) để tạo hạt vi rút hon chỉnh - Giả virus (Pseudovirion) Trong trình trùng hợp capsid vi rút, lại bao bọc acid nucleic tế bo chủ khả tạo lại hạt vi rút có acid nucleic "nhầm lẫn" 15 8/18/2016 Phân loại vi rút Cấu trúc vi rút Phage Sự nhân lên vi rút Hậu tơng tác VR-TB Định nghĩa Bacteriophage l vi rút mμ tÕ bμo c¶m thơ lμ vi khn, nghÜa lμ có khả gây bệnh cho vi khuẩn, ®ã ngưêi ta cßn gäi bacteriophage lμ vi rót cđa vi khuẩn v thờng gọi tắt l phage Sự nhân lên - Giống vi rút Bacteriophage Cấu trúc Đầu - Khối, nhiêu capsomer - Acid nucleic (phần lớn l ADN) - Khoảng 65 x 95 nm Đuôi - Xo¾n, 95 nm - Hai èng trơ lång vμo (8n v 20 nm xoắn) - Tấm lông đuôi 35nm, cạnh Lông đuôi - cái, 150 nm, bám vo vi khuẩn Phân loại Phage độc lực -> Vi khuẩn -> nhân lên -> phá huỷ Phage ôn ho - Tiền phage (prophage) - AN gắn vo gen VK -> tồn tại, phân chia - Vi khn gäi lμ VK tiỊm tan hc tÕ bo sinh dung giải, bị phá huỷ phage phát triển 16 8/18/2016 Nghiên cứu Sự nhân lên v tơng tác VR-TB để lm gì? Phá huỷ vi khuẩn ã ã ã ã ã Vi rút - đơn vị sống ? Kiến thức Nghiên cứu chế, hậu tơng tác Lâm sng nhiễm vi rút Thuốc kháng vi rút Phòng bệnh Mở đầu - VR nhân lên đâu ? - Các giai đoạn nhân lên ? Vol 455|4 September 2008| doi:10.1038/nature Mở đầu - Hấp phụ (attachment/adsorption) - Xâm nhập (penetration) - Tổng hợp thnh phần (synthesis) - Lắp ráp (maturation) - Giải phãng h¹t vi rót (release) HÊp phơ cđa vi rót - Còn gọi l Sự bám - Nhờ vận chuyển virus dịch gian bo -> virus tìm tới tế bo cảm thụ - Vai trò: Protein b¸m dÝnh cđa vi rót - HIV: gp120; HA cđa vi rót cóm… - Receptor cđa tÕ bμo c¶m thơ: CD4, sialic acid - Khả bám xác định Host range” 17 8/18/2016 X©m nhËp cđa vi rót - Sù xâm nhập thnh phần quan trọng l acid nucleic theo chế sau: + Nhờ enzym cởi vỏ cđa tÕ bμo gióp vi rót cëi vá, gi¶i phãng acid nucleic nhê enzym decapsidase + Vi rót qua mμng tế bo qua chế ẩm bo nhờ phần vỏ capsid co bóp, bơm acid nucleic qua vách tế bo, xâm nhập vo tế bo cảm thụ Cởi vỏ (Uncoating) - Bộ gen đợc giải phóng khỏi nucleocapsid vo bo tơng tế bo - Liên quan chặt chẽ đến Xâm nhập Tổng hợp thnh phần vi rót ADN hai sợi: - Tõ khu«n mÉu ADN -> mARN -> ADN polymerase vμ ADN míi - ADN míi -> mARN -> protein capsid vμ c¸c cÊu tróc khác Xâm nhập - L trình VR qua mng tế bo vo bo tơng - trình + Xâm nhập trực tiếp qua mng bo tơng + Qua c¬ chÕ Èm bμo/thùc bμo - VR cã vỏ bao: liên quan hòa mng - VR vỏ bao: nghiên cứu - Vai trò đồng thụ cảm thể Tổng hợp thnh phần vi rút - Đây l giai đoạn phức tạp trình nhân lên vi rút v phơ thc lo¹i AN cđa vi rót - Nhưng kết cuối l để tổng hợp đợc AN v thnh phần cấu trúc khác vi rút - VÝ dơ vỊ ba lo¹i vi rót cã hai loại AN khác nhau: Tổng hợp thnh phần cđa vi rót ARN sợi dương: - §ång thêi lμ mARN - T¹o ARN -> ARN + - T¹o protein 18 8/18/2016 Tổng hợp thnh phần vi rút ARN si âm: - Tạo ARN + (nhờ ARN polymerase) - ARN + -> Protein -> ARN - Lắp ráp Enzym cÊu tróc cđa vi rót hc enzym cđa tÕ bo cảm thụ -> lắp ráp theo khuôn mẫu vi rút -> hạt vi rút Phân loại vi rút Cấu trúc vi rút Phage Sự nhân lên vi rút Hậu tơng tác VR-TB Tổng hợp thnh phần vi rút ARN v enzyme chÐp ngưỵc: - ADN polymerase phơ thc ARN (reverse transcriptase-RT) (vÝ dô virus HIV) - Tõ ARN -> ADN trung gian - ADN tÝch hỵp -> NST cđa TB - ADN -> ARN (mARN) -> cÊu tróc kh¸c cđa virus - ADN tích hợp nằm im dạng provirus v dẫn đến hậu khác Giải phóng hạt vi rút - Vi rút -> phá vỡ vách tÕ bμo sau vμi giê tíi vμi ngμy tuú chu kỳ nhân lên vi rút -> vi rút khái tÕ bμo ®Ĩ tiÕp tơc mét chu kú míi - Vi rót -> gi¶i phãng = nÈy chåi tõng h¹t vi rót khái tÕ bμo sau chu kỳ nhân lên Hậu tơng tác VR ®éng vËt trªn tÕ bμo 19 8/18/2016 Néi dung Giới thiệu môn học Danh pháp v Phân loại Vi sinh vËt H×nh thĨ, cÊu tróc, sinh lý VK, VR Phân bố vi sinh vật Các đờng truyền bệnh Vi sinh vật đâu ? Vì vi sinh vật gây bệnh đợc? Vi sinh vật tự nhiên trên/trong thể ngời Bệnh vi khuẩn, vi rút, ký sinh trùng? Đặt vấn ®Ị Vi sinh vËt tù nhiªn Vi sinh vËt thể ngời Vi sinh vật đa dạng Phân bố vi sinh vật: Môi trờng-Cơ thể Lợi v hại vi sinh vật Đối tưỵng cđa Vi sinh vËt y häc 20 8/18/2016 VSV m«i trưêng VSV m«i trưêng - Vi sinh vật đất Kho chứa vi sinh vật Điều kiện thuận lợi Phân bố theo địa lý Từ nguồn khác xâm nhập vo đất Lây truyền Clostridia, Pseudomonas, Actinomycetes Vi sinh vËt nưíc NhiỊu vi sinh vËt Điều kiện thuận lợi Phân bố theo địa lý Từ nguồn khác (đất, nớc, khác) xâm nhập - Lây truyền - Salmonella, Shigella, Vibrio cholerae - VSV m«i trưêng Vi sinh vËt kh«ng khÝ - Ýt vi sinh vật - Điều kiện không thuận lợi - Từ nguồn khác (đất, nớc, khác) - Lây truyền nhanh - Vi khuẩn lao, trực khuẩn bạch hầu, liên cầu tan máu nhóm A, tụ cầu vng, vi rút cúm, vi rót sëi Vi sinh vËt tù nhiªn Vi sinh vật thể ngời Nơi no ??? Human microbial world - Mô bên thể (mô kín): Máu, dịch nÃo tuỷ, dịch khớp, dịch mng phổi - Mô v quan tiếp xúc với môi trưêng 21 8/18/2016 Cã bao nhiªu vi sinh vËt ??? - Ngưêi b×nh thưêng: 300 – 400 loμi - Vi khuẩn chiếm đa số - Các yếu tố: + Di trun + Dinh dưìng + Ti + Stress + Giíi + Chế độ ăn Các vị trí vi sinh vật ký sinh - Trên da v niêm mạc - Trong đờng tiêu hoá - Trên đờng hô hấp - Trên đờng sinh dục, tiết niệu - Trên niêm mạc mắt - Trong mô, quan VSV ký sinh c¬ thĨ ngưêi Vi sinh vËt ký sinh c¬ thĨ ngưêi + Vi sinh vËt trªn da vμ niªm mạc Cầu khuẩn Gram (+) (tụ cầu có số vùng định thể, phần lớn da đầu, họng Trực khuẩn Gram (+)Corynebacterium hoffmanii, Corynebacterium xerosis, Corynebacterium minussinum Trong đờng tiêu hoá Miệng: - Nhiều chÊt dinh dưìng, tÕ bμo biĨu m« bong -> lý tởng cho vi sinh vật phát triển -> Lợi + Hại - Giúp cạnh tranh với vi sinh vật x©m nhËp - Streptococci, lactobacilli, staphylococci and corynebacteria, nhiỊu vi khuẩn kị khí VSV ký sinh thể ngời Vi sinh vËt ký sinh c¬ thĨ ngưêi + Vi sinh vật đờng tiêu hoá Miệng Điều kiện thuận lợi Hơn 400 loi Dạ dy Điều kiện không thuận lợi Có vi khuẩn Ruột Vi khuẩn xuất sau vi Nhiều loại, phân bố tuỳ vùng Trong đờng tiêu hoá Dạ dy: - pH thấp - Rất vi sinh vật tồn đợc - Helicobacter pylori - Sinh thái miệng thay đổi theo tuổi: Cha sinh: Vô khuẩn Vi sau đẻ: Có vi khuẩn Streptococcus salivarius 98% đến mọc Mọc răng: Streptococcus salivarius 22 8/18/2016 Nội dung Giới thiệu môn học Danh pháp v Phân loại Vi sinh vËt H×nh thĨ, cÊu tróc, sinh lý VK, VR Phân bố vi sinh vật Các đờng truyền bệnh Đờng truyền Chân thnh cảm ơn 23 ... sinh vật Các đờng truyền bệnh Vi sinh vật đâu ? Vì vi sinh vật gây bệnh đợc? Vi sinh vật tự nhiên trên /trong c¬ thĨ ngưêi BƯnh vi khn, vi rót, ký sinh trùng? Đặt vấn đề Vi sinh vật tự nhiên Vi. .. nhiên Vi sinh vật thể ngời Vi sinh vật đa dạng Phân bố vi sinh vật: Môi trờng-Cơ thể Lợi v hại vi sinh vật Đối tợng Vi sinh vËt y häc 20 8/18/2016 VSV m«i trưêng VSV môi trờng - Vi sinh vật đất... v niêm mạc - Trong đờng tiêu hoá - Trên đờng hô hấp - Trên đờng sinh dục, tiết niệu - Trên niêm mạc mắt - Trong mô, quan VSV ký sinh thể ngời Vi sinh vËt ký sinh c¬ thĨ ngưêi + Vi sinh vật da