lecture-3-truy-tim-thong-tin

Truy tìm thơng tin y học Nguyễn Văn Tuấn, Nguyễn Đình Ngun Tổng quan • Thiết bị tìm kiếm • Pubmed • Chiến lược tìm kiếm thơng tin Thơng tin • • • • Giai đoạn khơng thể thiếu quy trình nghiên cứu khoa học NCKH hình thành từ ý tưởng nghiên cứu Ý tưởng nghiên cứu = “sáng tạo” tảng thông tin y văn hành Khởi cho NCKH từ câu hỏi: – Cái gì? – Vấn đề gì? – Tại sao? – Người ta biết gì? – Cịn chưa biết chưa nhắc đến? – Cần phải nghiên cứu gì? – Và mục tiêu tối hậu nghiên cứu gì? – Để trả lời câu hỏi đó, người nghiên cứu khoa học cần phải có thơng tin khơi mào Điện tử hóa thơng tin • Ngày nay, thông tin quản lý lưu trữ hệ thống điện toán liên mạng dễ dàng nhiều hiệu nhanh chóng • Dữ liệu thơng tin khoa học đồ sộ, vấn đề cần để phục vụ cho mục đích nghiên cứu lại khu trú hạn hẹp • Cần phải có kỹ tìm kiếm  tìm cần tìm cách có hiệu • Hệ thống quản trị liệu thông tin Thư viện PubMed? • Hệ thống truy tìm liệu tương tác Thư viện Y học Quốc gia Mỹ (National Library of Medicine) • Các liệu thuộc lĩnh vực Y khoa, điều dưỡng, nha khoa, dược khoa, di truyền, thông tin sinh học ngành thuộc lĩnh vực khoa học đời sống • Hơn 15 triệu tài liệu thơng tin trích dẫn từ nguồn liệu MEDLINE, PreMEDLINE nguồn liệu liên quan khác • Các thơng tin trích dẫn từ năm 1950 trở lại Tại PubMed? • Hệ thống quản trị thông tin cập nhật báo khoa học đăng tập san có thơng qua hệ thống bình duyệt nghiêm túc • Quan trọng hơn, cho phép truy tìm tài liệu đáng tin cậy mà lại miến phí • Tạo đường dẫn đến nơi để truy nhập tải xuống tài liệu cần tìm hữu hiệu • Để vào trang nhà PubMed sử dụng địa (http://www.pubmed.gov) Trình tự bước tìm kiếm thơng tin 1- Xác định thơng tin tìm kiếm • Cần hoạch định thơng tin cần tìm, theo cơng đoạn thiết lập mục tiêu nghiên cứu câu hỏi nên • Ngun tắc hình phễu • • • • 2- Các bước xác định thông tin Thông tin ý tưởng: Y tưởng nảy nghiên cứu để xác định mục tiêu tối hậu nghiên cứu Xác định từ, cụm từ chính: Nhóm cụ thể khơng cụ thể Nhóm thơng tin cụ thể: biết đích xác tác giả báo, tên báo, loại nghiên cứu, năm xuất tập san xuất Thông tin không cụ thể: thông tin không nằm mục Thông tin ý tưởng (brain storm) Tác giả Năm ấn Tiêu đề Tên tập san Thông tin cụ thể Xác định từ, cụm từ (key words) Từ Nhập thơng tin tìm kiếm Cụm từ Thơng tin liên quan Thơng tin khơng cụ thể Chu trình tìm kiếm thơng tin Sàng lọc thơng tin Labels “Nhãn” giới hạn tìm kiếm Nghĩa Affiliation [AD] Địa tác giả All Fields [ALL] Tất mục Author [AU] Tác giả Corporate Author [CN] Đồng tác giả EC/RN Number [RN] Số đăng Entrez Date [EDAT] Ngày liệu đăng lên mạng tìm kiếm Filter [FILTER] Lọc First Author Name [1AU] Tác giả đầu Full Author Name [FAU] Tên đầy đủ tác giả Bước 1: Xác định thơng tin tìm kiếm: tác giả Nguyen TV, thơng tin lỗng xương, tên đầu tên cuối Vào trang nhà có chứa liệu PubMed đường dẫn: http://www.pubmed.gov , gõ “enter” Bước 2: Tìm tác giả Nguyen TV Gõ vào cửa sổ tìm kiếm sau chữ “for”: Nguyen TV [Au] (tức Nguyen TV tác giả) Sau bấm GO xác định có 187 kết Cách thức để khu trú, giới hạn thơng tin • Sử dụng thuật ngữ logic: AND, OR NOT • Thí dụ osteporosis AND Women; hay osteoporosis OR low bone mineral density; osteoporosis NOT corticorsteroidinduced • ***Ghi chú: AND, OR NOT phải gõ chữ HOA • Mở rộng cụm từ tìm kiếm với từ tiền tố: dùng dấu * gõ sau tiền tố cần tìm – thí dụ: osteo*, hệ thống rà soát tất từ khởi đầu osteo: osteomalacia, osteoporosis, osteopenia, osteophyte vân vân • Để kết hợp hai nội dung tìm kiếm riêng biệt: sử dụng dấu # – Bằng cách bấm vào “History” – gõ dấu # trước set nội dung tìm kiếm nối với AND, thí dụ #1 AND #2 Mở rộng tìm kiếm Search osteo* 19:25:18 70918 Search osteoporosis 19:25:09 39609 Gõ cụm từ Diabetes History #5 Search #2 OR #3 #4 Search #2 AND #3 #3 Search Diabetes type #2 Search Diabetes type II #1 Search Diabetes 19:16:39 19:16:08 19:15:26 19:14:29 19:12:46 45914 45776 45859 45831 273597 Hướng dẫn tìm kiếm nâng cao • Tìm kiếm nâng cao nghiên cứu lâm sàng sử dụng hệ thống lọc Phương pháp nghiên cứu (Research Methodology Filters) • Có hai lựa chọn: Hoặc sau vào Pubmed.gov, vào mục lục bên trái để vào “Clinical queries” • vào theo địa http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query/static/clinical.html • Về lâm sàng có bốn mục nghiên cứu: điều trị, chẩn đoán, nguyên tiên lượng (therapy, diagnosis, etiology, prognosis) có khả trọng tìm kiếm độ nhạy độ đặc hiệu (sensitivity or specificity) Sử dụng số thuật ngữ qua hệ thống MeSH • Therapy Filter (các nghiên cứu trị liệu) research design [mh] clinical trials [mh] comparative study [mh] placebos [mh] multicenter study [pt] clinical trial [pt] random* [tiab] placebo*[tiab] clinical trial* [tiab] controlled clinical trial [pt] Therapy Filter String • Chỉ đơn giản gõ lại nguyên văn dòng lệnh vào lệnh tìm kiếm PubMed sau thực xong bước tìm kiếm thơng tin chủ điểm • research design [mh] OR clinical trials [mh] OR comparative study [mh] OR placebos [mh] OR multicenter study [pt] OR clinical trial [pt] OR random* [tiab] OR placebo*[tiab] OR clinical trial* [tiab] OR controlled clinical trial [pt] OR randomized controlled trial [pt] OR practice guideline [pt] OR feasibility studies [mh] OR clinical protocols [mh] OR single blind* [tiab] OR double blind* [tiab] OR triple blind* [tiab] OR treatment outcomes [mh] OR epidemiologic research design [mh] OR double blind method [mh] OR pilot projects [mh] Các chữ viết tắt hệ thống tìm kiếm hiểu ngầm Stopwords A a, about, again, all, almost, also, although, always, among, an, and, another, any, are, as, at B be, because, been, before, being, between, both, but, by C can, could D did, do, does, done, due, during E each, either, enough, especially, etc Vài điểm mấu chốt • Truy tìm thơng tin bước quan trọng nghiên cứu khoa học • Cần phải có kế hoạch tìm kiếm thơng tin ‘đề cương’ nhỏ • Cần phải xác định từ khố cụm từ liên quan để có kết • Nhưng quan trọng là… THUẬT NGỮ TIẾNG ANH Lời Cảm tạ • Chúng xin chân thành cám ơn Công ty Dược phẩm Bridge Healthcare, Australia tài trợ cho chuyến