Chương III: Protein và amino acid potx

TS. ĐỖ HIẾU LIÊM TS. ĐỖ HIẾU LIÊM CHƯƠNG III CHƯƠNG III 1. ĐẠI CƯƠNG 2. AMINO ACID 2.1. Công thức cấu tạo-Danh pháp 2.2. Đồng phân 2.3. Tính lưỡng tính và điểm đẳng điện 2.4. Phân loại amino acid 2.4.1. Phân loại theo giá trị dinh dưỡng 2.4.2. Phân loại theo cấu tạo hoá học 3. PROTEIN 3.1. Cấu trúc 3.2. Các tính chất của protein 3.3. Phân loại protein 4. CHROMOPROTEIN-HEMOGLOBIN  Protein - “protos” là hợp chất liên quan đến sự sống của sinh vật, có 2 đặc tính hóa học: -Nitrogen (N) là nguyên tố thường trực, với tỉ lệ 16% -Trọng lượng phân tử rất lớn (đại phân tử protein)  Vai trò sự sống của protein (Chức năng sinh học) - Sự vận động - Sự đáp nhận những kích thích bên ngoài - Bảo vệ cơ thể - Sự sinh trưởng và phát dục - Sự di truyền và biến dị - Sự biến dưỡng nội tại và trao đổi với môi trường - Cung cấp 10-15% nhu cầu năng lượng cho cơ thể 1.ĐẠI CƯƠNG 1.ĐẠI CƯƠNG 2.1.Công thức cấu tạo - Danh pháp Amino acid là đơn vị cấu tạo của protein, dẫn xuất của acid hữu cơ; trong đó, một nguyên tử hydrogen (H) ở carbon α được thay thế bằng nhóm amin (NH 2 ), gọi là α- amino acid. 2.2. Đồng phân quang học NH 2 Acid hữu cơ α Amino acid H 2 N- H- CH 2 OH H-C- CHO CH 2 OH H-C- COOH CH 2 OH -C-H COOH OH NH 2 H 2 N L.Glyceraldehyde L.α.Serine D.α.Serine 2.AMINO ACID 2.AMINO ACID A Ala Alanine M Met Methionine B Asx Aparagine or Aspartic A N Asn Asparagine C Cys Cysteine P Pro Proline D Asp Aspartic acid Q Gln Glutamine E Glu Glutamic acid R Arg Arginine F Phe Phenylalanine S Ser Serine G Gly Glycine T Thr Threonine H His Histidine V Val Valine I Ile Isoleucine W Trp Tryptophan K Lys Lysine Y Tyr Tyrosine L Leu Leucine Z Glx Glutamine or Glutamic A 2.3. Tính lưỡng tính và điểm đẳng điện 2.4.Danh pháp Cation Zwitterion Anion R H 2 N-C- COOH [H + ] [OH - ] R H 3 N-C- COO R H 3 N-C- COOH R H 2 N-C- COO α Amino acid 2.5. Phân loại 2.5.1. Phân loại theo giá trị dinh dưỡng: 2 nhóm  Amino acid chủ yếu (Essential amino acid): PHILL MATT V  Amino acid không chủ yếu (Nonessential amino acid) 2.5.2. Phân loại theo chức hoá học gốc R: 7 nhóm Amino acid Mol Wt 3 ký tự 1 ký tự Amino acid nhỏ (Small amino acids) Glycine 57.05 Gly G Alanine 71.09 Ala A Serine 87.08 Ser S Threonine 101.11 Thr T Cystein 103.15 Cys C Amino acid kỵ nước (Hydrophobic amino acids) Valine 99.14 Val V Leucine 113.16 Leu L Isoleucine 113.16 Ile I Amino acid Mol Wt 3 ký tự 1 ký tự Amino acid kỵ nước (Hydrophobic amino acids) Methionine 131.19 Met M Proline 97.12 Pro P Amino acid nhân vòng (Aromatic amino acids) Phenylalanine 147.18 Phe P Tyrosine 163.21 Tyr Y Tryptophane 186.12 Trp W Amino acid có tính acid (Carboxylated amino acids) Aspartic acid 115.09 Asp D Glutamic acid 129.12 Glu E Amino acid có tính kiềm và dạng amide (Amino/amide-containing amino acids) Asparagine 114.11 Asn N Glutamine 128.14 Gln Q Histine 137.14 His H Lysine 128.17 Lys K Arginine 156.19 Arg R 3.1.Cấu trúc của protein 3.1.1.Liên kết peptide (CO-NH) • Cách biểu diễn peptide • Cách gọi tên peptide - Theo số lượng amino acid - Theo danh pháp amino acid OH OH H 2 O H Alanine Serine AlanylSerine Liên kết peptid 3.PROTEIN [...]... keo •Tính di truyền của sinh vật 3.3 Phân loại protein 3.3.1 Protein đơn giản - Protein huyết thanh: Albumin và Globulin - Histone, Protamine, Albuminoid (scleroprotein) 3.3.2 Protein phức tạp Phosphoprotein: Protein + hợp chất hữu cơ có P Glycoprotein: Protein + Glucid Lipoprotein: Protein + lipid Nucleoprotein: Protein + nucleic acid Chromoprotein: Protein + nhóm chất hữu cơ có màu 4.HEMOGLOBIN (Huyết... keo -Sự sa lắng và biến tính o Monomer (Subunit) 3.1.5.Cấu trúc bậc IV Cấu trúc không gian 3D do các đơn vị monomer liên kết bằng các liên kết không bền như - Liên kết hydrogen - Liên kết tĩnh điện - Liên kết kị nước Enzyme- cấu trúc bậc 4 - chức năng xúc tác các phản ứng sinh hoá học 3.2 Các đặc tính của protein •Trọng lượng phân tử •Tính lưỡng tính và điểm đẳng điện: protein (+) và protein (-) •Trạng... dạng enol Gốc R tự do, tạo các cấu trúc không gian phức tạp (bậc 3, 4) Trình tự sắp xếp các cấu tử amino acid tính di truyền Tính đa chủng loại protein 3.1.3 Cấu trúc bậc II o Cấu trúc không gian 2D o Hình thành do liên kết hydrogen (O từ CO và H từ NH trong khoảng cách 2,79 ± 0,12 A0) o Dạng α-Helix và β sheet o Ý nghĩa: Thụ thể (receptor) trên bề mặt tế bào, domain cấu trúc 3.1.4 Cấu trúc bậc III... gốc methyl (-CH3) ở các vị trí 1, 3, 5, 8 - 2 gốc vinyl (-CH=CH2) ở các vị trí 2, 4 - 2 gốc propionic acid (-CH2-CH2-COOH) ở các vị trí 6, 7 * 4 Nitrogen ở đỉnh pyrrol liên kết với Fe2+, trong đó 2 liên kết phối trí và 2 liên kết cộng hoá trị • Cấu tạo của globin - 4 chuỗi polypeptid: 2 chuỗi α (141 AA) và 2 chuỗi β (146 AA) Fe2+ nhân heme liên kết phối trí với N (vòng imidazol) của histidine trong phân... GLOBIN CH2 His Myoglobin (Sắc tố của cơ): 1 Heme + 1 polypeptid globin 4.2 Chức năng sinh học của Hemoglobin Vận chuyển và trao đổi chất khí O2 và CO2 Hệ thống đệm - Hệ thống đệm trong huyết tương (1) HT đệm Phosphat H3PO4/NaH2PO4 H3PO4/Na2 HPO4 (2) HT đệm Bicarbonate H2CO3/NaHCO3 (3) HT đệm proteinate -Hệ thống đệm trong hồng cầu HT đệm Hb HHb/BHb ĐỘNG MẠCH PHỔI HHb HHb HCO33HCO- TĨNH MẠCH HCO HOÀN TUẦN . 186.12 Trp W Amino acid có tính acid (Carboxylated amino acids) Aspartic acid 115.09 Asp D Glutamic acid 129.12 Glu E Amino acid có tính kiềm và dạng amide (Amino/ amide-containing amino acids) Asparagine. L Isoleucine 113.16 Ile I Amino acid Mol Wt 3 ký tự 1 ký tự Amino acid kỵ nước (Hydrophobic amino acids) Methionine 131.19 Met M Proline 97.12 Pro P Amino acid nhân vòng (Aromatic amino acids) Phenylalanine. dưỡng: 2 nhóm  Amino acid chủ yếu (Essential amino acid) : PHILL MATT V  Amino acid không chủ yếu (Nonessential amino acid) 2.5.2. Phân loại theo chức hoá học gốc R: 7 nhóm Amino acid Mol Wt 3