(Luận văn thạc sĩ) nghiên cứu sự lưu hành virus cúm gia cầm type ah5n6 tại một số chợ buôn bán gia cầm sống trên địa bàn các tỉnh hải phòng, lạng sơn và quảng ninh và ứng dụng kỹ thuật realtime rt

101 6 0
(Luận văn thạc sĩ) nghiên cứu sự lưu hành virus cúm gia cầm type ah5n6 tại một số chợ buôn bán gia cầm sống trên địa bàn các tỉnh hải phòng, lạng sơn và quảng ninh và ứng dụng kỹ thuật realtime rt

Đang tải... (xem toàn văn)

Tài liệu hạn chế xem trước, để xem đầy đủ mời bạn chọn Tải xuống

Thông tin tài liệu

HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAMC VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAMN NÔNG NGHIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAMP VIỆN NÔNG NGHIỆP VIỆT NAMT NAM PHẠM XUÂN TRƯỜNG NGHIÊN CỨU SỰ LƯU HÀNH VIRUS CÚM GIA CẦMU SỰ LƯU HÀNH VIRUS CÚM GIA CẦM LƯU HÀNH VIRUS CÚM GIA CẦMU HÀNH VIRUS CÚM GIA CẦMM TYPE A/H5N6 TẠI MỘT SỐ CHỢ BUÔN BÁN GIAI MỘT SỐ CHỢ BUÔN BÁN GIAT SỐ CHỢ BUÔN BÁN GIA CHỢ BUÔN BÁN GIA BUÔN BÁN GIA CẦMM SỐ CHỢ BUÔN BÁN GIANG TRÊN ĐỊA BÀN CÁC TỈNH HẢI PHÒNG,A BÀN CÁC TỈNH HẢI PHÒNG,NH HẢI PHÒNG,I PHỊNG, LẠI MỘT SỐ CHỢ BN BÁN GIANGSƠN VÀ QUẢNG NINH VÀỨNG DỤNG KỸN VÀ QUẢI PHÒNG,NG NINH VÀỨU SỰ LƯU HÀNH VIRUS CÚM GIA CẦMNG DỤNG KỸNG KỸ THUẬT REALTIME RT-PCR TRONG CHẨN ĐOÁNT REALTIME RT-PCR TRONG CHẨN ĐOÁNN ĐỐN BỆN NƠNG NGHIỆP VIỆT NAMNH Chun ngành : Thú y Mã số : : 60 64 01 01 Người hướng dẫn khoa học : PGS.TS Nguyễn Thị Lani hướng dẫn khoa học : PGS.TS Nguyễn Thị Lanng dẫn khoa học : PGS.TS Nguyễn Thị Lann khoa học : PGS.TS Nguyễn Thị Lanc : PGS.TS Nguyễn Thị Lann Thị Lan Lan NHÀ XUẤT BẢN ĐẠI HỌC NÔNG NGHIỆP - 2016 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan công trình nghiên cứu khoa học riêng tơi Các số liệu, kết nêu luận văn trung thực, xác chưa cơng bố cơng trình khác Tơi xin cam đoan giúp đỡ thực luận văn cảm ơn thơng tin trích dẫn luận văn rõ nguồn gốc Hà Nội, ngày 10 tháng 11 năm 2016 Tác giả luận văn Phạm Xuân Trường i LỜI CẢM ƠN Tôi xin chân thành cảm ơn Học viện Nông nghiệp Việt Nam, Ban Quản lý đào tạo, Khoa Thú y quan tâm tạo điều kiện thuận lợi cho chúng tơi q trình học tập thực đề tài Tôi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc tới hướng dẫn khoa học PGS.TS Nguyễn Thị Lan, người tận tình giúp đỡ hướng dẫn tơi q trình nghiên cứu hồn thành luận văn Tơi xin cảm ơn thầy, cô giáo môn Bệnh lý, khoa Thú y, Học viện Nông nghiệp Việt Nam nhiệt tình giúp đỡ tơi q trình hồn thành luận văn Tôi xin chân thành cảm ơn giúp đỡ tạo điều kiện Ban lãnh đạo Cơ quan Thú y vùng II, tập thể cán bộ, công nhân viên Phịng Dịch tễ, Trạm Chẩn đốn xét nghiệm bệnh động vật - Cơ quan Thú y vùng II; Phòng Dịch tễ - Cục Thú y; Chi cục Thú y tỉnh Hải Phòng, Lạng Sơn Quảng Ninh tạo điều kiện tốt giúp đỡ suốt thời gian nghiên cứu Nhân dịp này, tơi xin bày tỏ lịng biết ơn sâu sắc đến gia đình, người thân, bạn bè, người ln tạo điều kiện, động viên, giúp đỡ tơi q trình học tập, nghiên cứu hoàn thành luận văn Hà Nội, ngày 10 tháng 11 năm 2016 Tác giả luận văn Phạm Xuân Trường ii MỤC LỤC Lời cam đoan i Lời cảm ơn .ii Mục lục iii Danh mục chữ viết tắt v Danh mục bảng vi Danh mục sơ đồ, hình, đồ, biểu đồ vii Trích yếu luận văn viii Thesis abstract .x Phần Mở đầu 1.1 Đặt vấn đề .1 1.2 Mục tiêu đề tài 1.3 Ý nghĩa đề tài Phần Tổng quan tài liệu .3 2.1 Khái niệm bệnh cúm gia cầm .3 2.2 Tình hình bệnh cúm gia cầm giới .3 2.2.1 Tình hình chung .3 2.2.2 Tình hình dịch cúm H5N6 giới 2.3 Tình hình bệnh cúm gia cầm Việt Nam .10 2.3.1 Tình hình chung 10 2.3.2 Tình hình bệnh cúm gia cầm H5N6 12 2.4 Căn bệnh .15 2.4.1 Đặc điểm sinh học phân tử virus cúm gia cầm .15 2.4.2 Kháng nguyên virus cúm gia cầm 18 2.4.3 Tính thích ứng đa vật chủ virus cúm 21 2.4.4 Cơ chế xâm nhiễm gây bệnh virus cúm A tế bào vật chủ 22 2.4.5 Độc lực khả gây bệnh virus cúm gia cầm 23 2.4.6 Triệu chứng 24 2.4.7 Bệnh tích .24 2.4.8 Chẩn đoán bệnh 24 2.5 Sơ lược hoạt động giám sát cúm gia cầm Việt Nam .25 iii 2.5.1 Kết giám sát 25 2.5.2 Kết phân tích virus cúm gia cầm Việt Nam 26 2.6 Cơng tác phịng, chống bệnh cúm gia cầm 27 2.7 Nguyên lý kỹ thuật REALTIME PCR 28 Phần Nội dung, nguyên liệu phương pháp nghiên cứu 30 3.1 Đối tượng nghiên cứu 30 3.2 Nội dung nghiên cứu 30 3.3 Nguyên liệu 30 3.3.1 Mẫu thí nghiệm 30 3.3.2 Dụng cụ, hóa chất lấy mẫu, thiết bị, hóa chất xét nghiệm 30 3.4 Phương pháp nghiên cứu 32 3.4.1 Phương pháp dịch tễ học mơ tả, dịch tễ học phân tích 32 3.4.2 Phương pháp lấy mẫu 32 3.4.3 Phương pháp xét nghiệm virus cúm A/H5N6 32 3.4.4 Phương pháp xử lý số liệu 33 Phần Kết thảo luận 34 4.1 4.2 Tình hình chăn ni gia cầm tỉnh từ 2010 – tháng đầu năm 2016 34 Kết tiêm vaccine cúm gia cầm tỉnh từ 2010 – tháng đầu năm 2016 37 4.3 Tình hình dịch cúm gia cầm tỉnh từ 2010 – tháng đầu năm 2016 39 4.4 Kết giám sát virus cúm a/h5n6 12 chợ 44 4.4.1 Kết lấy mẫu tỉnh 44 4.4.2 Tỷ lệ nhiễm virus cúm type A mẫu bệnh phẩm 45 4.4.3 Tỷ lệ nhiễm virus cúm subtype H5 mẫu bệnh phẩm 47 4.4.4 Tỷ lệ nhiễm virus cúm subtype N6 mẫu bệnh phẩm 50 4.4.5 Lưu hành virus cúm A/H5N6 qua vòng lấy mẫu 53 4.4.6 Lưu hành virus cúm A/H5N6 chợ lấy mẫu 56 Phần Kết luận đề nghị 60 5.1 Kết luận 60 5.2 Đề nghị 60 Tài liệu tham khảo 62 Phụ lục 67 iv DANH MỤC CÁC CHỮ CÁI VIẾT TẮT Từ viết tắt Dịch nghĩa AI Avian Influenza BNNPTNT Bộ Nông nghiệp Phát triển nông thôn cs Cộng Ct Cycle of threshold DNA Deoxyribo Nucleic Acid GP Glycoprotein HA Hemagglutination HEF Hemagglutinin Esterase Fusion HI Hemagglutination Inhibition HPAI Highly pathogenic avian influenza LPAI Low pathogenic avian influenza M Matrix NA Neuraminidase OIE Office International des Epizooties PB1 Polymerase basic protein PB2 Polymerase basic protein PBS Phosphate Buffered Saline PCR Polymerase Chain Reaction RNA Ribonucleic Acid RNP Ribonucleoprotein Tp Thành phố WHO World Health Organization v DANH MỤC BẢNG Bảng 2.1 Tình hình dịch cúm gia cầm giới giai đoạn 2004 - 2016 Bảng 2.2 Tình hình bệnh cúm H5N1 người giai đoạn 2003 - 2016 Bảng 2.3 Tóm tắt chủng virus cúm gia cầm Việt Nam, 2003 - 2016 27 Bảng 3.1 Trình tự đoạn mồi đoạn dò để phát virus H5N6 31 Bảng 4.1 Tình hình dịch cúm gia cầm tỉnh giai đoạn 2010 - 2016 40 Bảng 4.2 Kết lấy mẫu tỉnh 45 Bảng 4.3 Tỷ lệ nhiễm virus cúm type A mẫu bệnh phẩm 46 Bảng 4.4 Tỷ lệ nhiễm virus cúm subtype H5 mẫu bệnh phẩm 48 Bảng 4.5 Tỷ lệ nhiễm virus cúm subtype N6 mẫu bệnh phẩm 50 Bảng 4.6 Lưu hành virus cúm A/H5N6 qua tháng lấy mẫu 55 Bàng 4.7 Lưu hành virus cúm A/H5N6 chợ lấy mẫu 57 vi DANH MỤC SƠ ĐỒ, HÌNH, BẢN ĐỒ, BIỂU ĐỒ Sơ đồ 2.1 Lịch sử đại dịch cúm người Sơ đồ 2.1 Cơ chế hoạt động Taqman probe 29 Sơ đồ 3.1 Quy trình xét nghiệm phát virus cúm A/H5N6 33 Hình 2.1 Cấu trúc bên virus cúm gia cầm 15 Hình 2.2 Cấu trúc hệ gen virus cúm type A 18 Hình 2.3 Mơ hình chế xâm nhiễm nhân lên virus cúm A tế bào chủ .23 Biểu đồ 2.1 Tình hình dịch cúm gia cầm giới giai đoạn 2004 – 2016 Biểu đồ 2.2 Tình hình bệnh cúm H5N1 người giai đoan 2003 - 2016 Bản đồ 2.1 Phân bố không gian ổ dịch H5N1 từ năm 2007 đến 2011 13 Bản đồ 2.2 Phân bố không gian ổ dịch H5N10 từ năm 2012 đến 2014 13 Bản đồ 2.3 Dịch cúm gia cầm năm 2015 – 2016 .14 Bản đồ 4.1 Phân bố ổ dịch cúm GC tỉnh giai đoạn 2010 – 2011 41 Bản đồ 4.2 Phân bố ổ dịch cúm GC tỉnh giai đoạn 2012 – 2013 41 Bản đồ 4.3 Phân bố ổ dịch cúm GC tỉnh năm 2014 42 Bản đồ 4.4 Phân bố ổ dịch cúm H5N6 tỉnh giai đoạn 2015 – 2016 42 Biểu đổ 4.1 Tổng đàn gia cầm tỉnh giai đoạn 2010 – 2016 34 Biểu đồ 4.2 Tỷ lệ tiêm phòng cúm tỉnh giai đoạn 2010 – 2016 38 Biểu đồ 4.3 Phân bố ổ dịch cúm GC năm giai đoạn 2010 – 2016 43 Biểu đổ 4.4 Tỷ lệ nhiễm virus cúm type A mẫu bệnh phẩm 47 Biểu đổ 4.5 Tỷ lệ nhiễm virus cúm subtype H5 mẫu bệnh phẩm 48 Biểu đổ 4.6 Tỷ lệ nhiễm virus cúm subtype N6 mẫu bệnh phẩm 51 Biểu đồ 4.7 Lưu hành virus cúm A/H5N6 qua tháng lấy mẫu 55 Biểu đồ 4.8 Lưu hành virus cúm A/H5N6 chợ lấy mẫu 58 vii TRÍCH YẾU LUẬN VĂN Tên tác giả: Phạm Xuân Trường Tên luận văn: “Nghiên cứu lưu hành virus cúm gia cầm type A/H5N6 số chợ buôn bán gia cầm sống địa bàn tỉnh Hải Phòng, Lạng Sơn Quảng Ninh ứng dụng kỹ thuật Realtime RT-PCR chẩn đoán bệnh” Chuyên ngành: Thú y Mã số: 60 64 01 01 Cơ sở đào tạo: Học viện Nơng nghiệp Việt Nam Mục đích nghiên cứu Xác định lưu hành chủng virus cúm gia cầm A/H5N6 địa bàn tỉnh nghiên cứu nhằm cảnh báo sớm dịch cúm gia cầm điều chỉnh biện pháp phòng, chống dịch cho phù hợp Ứng dụng kỹ thuật Realtime RT-PCR chẩn đoán bệnh Phương pháp nghiên cứu Sử dụng phương pháp dịch tễ học mô tả, dịch tễ học phân tích điều tra tình hình chăn ni gia cầm, cơng tác tiêm phịng vaccine phịng cúm, tình hình dịch cúm gia cầm tỉnh giai đoạn từ năm 2010 đến tháng đầu năm 2016 Sử dụng quy trình TYV2-HDPP-VR-54 -TCCS 16:2016/TYV2-CĐ Cơ quan Thú y vùng II để xét nghiệm virus cúm A/H5N6 mẫu bệnh phẩm thu Kết nghiên cứu Tình hình chăn ni gia cầm tỉnh từ 2010 – tháng đầu năm 2016 Kết tiêm vaccine cúm gia cầm tỉnh từ 2010 – tháng đầu năm 2016 Tình hình dịch cúm gia cầm tỉnh từ 2010 - tháng đầu năm 2016 Nghiên cứu lưu hành virus cúm A/H5N6 - Nghiên cứu tỷ lệ nhiễm virus cúm type A mẫu bệnh phẩm - Nghiên cứu tỷ lệ nhiễm virus cúm subtype H5 mẫu bệnh phẩm - Nghiên cứu tỷ lệ nhiễm virus cúm subtype N6 mẫu bệnh phẩm - Nghiên cứu lưu hành virus cúm A/H5N6 qua vòng lấy mẫu - Nghiên cứu lưu hành virus cúm A/H5N6 chợ lấy mẫu Kết luận Các tỉnh Hải Phịng, Lạng Sơn Quảng Ninh Lạng Sơn có tổng đàn gia cầm cao nhiên hình thức chăn nuôi chủ yễu chăn nuôi nhỏ lẻ, mang tính chất nơng hộ, chăn ni gia trại; viii

Ngày đăng: 23/11/2023, 08:49

Tài liệu cùng người dùng

  • Đang cập nhật ...