Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.

Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.Nghiên cứu tính đa hình một số gen trên bệnh nhân gút.v

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ - NCS NGUYỄN TRẦN MINH THẮNG NGHIÊN CỨU TÍNH ĐA HÌNH MỘT SỐ GEN TRÊN BỆNH NHÂN GÚT LUẬN ÁN TIẾN SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC Hà Nội – Năm 2023 BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO VIỆN HÀN LÂM KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ VIỆT NAM HỌC VIỆN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ - NCS NGUYỄN TRẦN MINH THẮNG NGHIÊN CỨU TÍNH ĐA HÌNH MỘT SỐ GEN TRÊN BỆNH NHÂN GÚT Chuyên ngành: Hoá sinh học Mã số: 9420116 LUẬN ÁN TIẾN SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: PGS TS Nguyễn Thùy Dương GS TS Nông Văn Hải Hà Nội – Năm 2023 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan: Luận án công trình nghiên cứu riêng tơi Nghiên cứu thực khuôn khổ đề tài Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam mã số VAST02.04/17-18, “Nghiên cứu đa hình nucleotide đơn (SNP) số gen liên quan đến bệnh gút người Việt Nam”, thời gian thực 2017 - 2018 PGS TS Nguyễn Thùy Dương làm chủ nhiệm đề tài Các số liệu kết trình bày luận án trung thực Một số công bố tạp chí khoa học chuyên ngành nước quốc tế với đồng ý cho phép đồng tác giả, số cịn lại chưa cơng bố cơng trình khác Hà Nội, ngày 13 tháng 04 năm 2023 Nghiên cứu sinh Nguyễn Trần Minh Thắng LỜI CẢM ƠN Đầu tiên, xin phép bày tỏ kính trọng lịng biết ơn sâu sắc đến PGS TS Nguyễn Thuỳ Dương, Trưởng phòng Hệ gen học người, Viện Nghiên cứu hệ gen, Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam, người tận tình hướng dẫn, giúp đỡ, tạo điều kiện thuận lợi cho tơi suốt q trình nghiên cứu hồn thành luận án Tơi xin gửi lời cảm ơn sâu sắc kính trọng đến GS.TS Nông Văn Hải, nguyên Viện trưởng Viện Nghiên cứu hệ gen, Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam, người tận tình giúp đỡ, đưa lời dẫn để tơi hồn thành tốt luận án Những lời nhận xét, góp ý Thầy hướng giải vấn đề suốt q trình nghiên cứu học vơ q giá tơi, khơng q trình học tập nghiên cứu, mà hoạt động chuyên môn sau Tôi xin trân trọng gửi lời cảm ơn tới Ban Giám đốc Học viện Khoa học Công nghệ Việt Nam, Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam tạo điều kiện để tơi hồn thành luận án Tôi xin trân trọng gửi lời cảm ơn tới GS TS Nguyễn Huy Hoàng, Viện trưởng Viện Nghiên cứu hệ gen Thầy Cô, Anh Chị Viện Nghiên cứu hệ gen Thầy Cơ, Anh Chị phịng Đào tạo Học viện Khoa học Công nghệ Việt Nam, Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam tận tình giúp đỡ, tạo điều kiện tốt để tơi hồn thành tốt luận án Tơi xin trân trọng gửi lời cám ơn đến lãnh đạo cấp đồng nghiệp Bệnh Viện Nguyễn Trãi Phịng khám đa khoa Đại Phước, Thành phố Hồ Chí Minh, tạo điều kiện để tơi hoàn thành nhiệm vụ học tập nghiên cứu Cuối cùng, tơi xin dành biết ơn sâu sắc tới bố, mẹ, vợ, con, gia đình bạn bè bên cạnh động viên, hỗ trợ để tơi hồn thành luận án Nghiên cứu sinh MỤC LỤC Trang Trang phụ bìa Lời cam đoan Lời cám ơn Mục lục Danh mục chữ viết tắt Danh mục bảng Danh mục hình MỞ ĐẦU .1 TÍNH CẤP THIẾT CỦA VẤN ĐỀ NGHIÊN CỨU MỤC TIÊU NGHIÊN CỨU NHỮNG ĐÓNG GÓP MỚI CỦA LUẬN ÁN .2 CHƯƠNG TỔNG QUAN .4 1.1 ĐẠI CƯƠNG VỀ BỆNH GÚT .4 1.1.1 Khái niệm 1.1.2 Dịch tễ học 1.1.3 Cơ chế bệnh sinh 1.1.4 Phân loại bệnh gút 1.1.5 Chẩn đoán bệnh gút 12 1.1.6 Khó khăn việc chẩn đoán bệnh gút giai đoạn sớm: 13 1.1.7 Điều trị bệnh gút .13 1.1.8 Dự phòng bệnh gút 15 1.2 TỔNG QUAN VỀ ĐA HÌNH NUCLEOTIDE ĐƠN (SNPS) 16 1.2.1 Đặc điểm đa hình nucleotide đơn (SNP) 16 1.2.2 Các phương pháp xác định đa hình đơn nucleotide đơn (SNP) 16 1.2.3 Tầm quan trọng ứng dụng đa hình nucleotide đơn (SNP) 20 1.3 NGHIÊN CỨU VAI TRÒ CỦA CÁC GEN ĐỐI VỚI BỆNH GÚT TRÊN THẾ GIỚI VÀ VIỆT NAM 23 1.3.1 Tình hình nghiên cứu tổng quát bệnh gút giới 23 1.3.2 Các nghiên cứu tương quan toàn nhiễm sắc thể với bệnh gút 24 1.3.3 Vai trò gen ABCG2 bệnh gút 26 1.3.4 Mối tương quan gen SLC22A12 bệnh gút .27 1.3.5 Tầm quan trọng gen SLC2A9 bệnh gút 28 1.3.6 Mối tương quan gen TNFa bệnh gút 30 1.3.7 Sự liên quan gen TLR4 bệnh gút 30 1.3.8 Gen SLC17A1 bệnh gút .31 1.3.9 Các nghiên cứu gút nước 31 CHƯƠNG ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 33 2.1 ĐỊA ĐIỂM THU MẪU VÀ THỜI GIAN NGHIÊN CỨU .33 2.1.1 Địa điểm thu mẫu nghiên cứu 33 2.1.2 Thời gian nghiên cứu 33 2.2 THIẾT KẾ NGHIÊN CỨU 33 2.3 ĐỐI TƯỢNG VÀ CỠ MẪU NGHIÊN CỨU 33 2.3.1 Đối tượng nghiên cứu .33 2.3.2 Cỡ mẫu .34 2.4 QUY TRÌNH CHỌN MẪU VÀ NGHIÊN CỨU 35 2.4.1 Nhóm bệnh .35 2.4.2 Nhóm chứng .35 2.5 DỤNG CỤ, TRANG THIẾT BỊ VÀ HOÁ CHẤT NGHIÊN CỨU 36 2.6 PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU 36 2.6.1 Quy trình thực nghiên cứu 36 2.6.2 Phương pháp thu thập số liệu 37 2.7 PHƯƠNG PHÁP VÀ KỸ THUẬT SỬ DỤNG 38 2.7.1 Phương pháp sinh hoá huyết học 38 2.7.2 Phương pháp thiết kế mồi cho PCR 38 2.7.3 Tách chiết DNA tổng số 39 2.7.4 Phương pháp định lượng DNA quang phổ kế 40 2.7.5 Nhân đoạn DNA PCR 41 2.7.6 Tinh sản phẩm PCR 43 2.7.7 Giải trình tự Sanger 44 2.7.8 Phân tích đa hình/đột biến gen 44 2.8 CÁC BIẾN SỐ TRONG NGHIÊN CỨU .44 2.8.1 Nhóm biến số đặc điểm chung đối tượng nghiên cứu 45 2.8.2 Nhóm biến số cận lâm sàng 46 2.8.3 Nhóm biến số gen 46 2.9 PHƯƠNG PHÁP XỬ LÝ VÀ PHÂN TÍCH SỐ LIỆU 46 2.9.1 Xử lý số liệu thô .46 2.9.2 Phân tích số liệu 47 2.10 VẤN ĐỀ ĐẠO ĐỨC TRONG NGHIÊN CỨU Y SINH HỌC .48 CHƯƠNG KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 49 3.1 KẾT QUẢ 49 3.1.1 Đặc điểm lâm sàng cận lâm sàng mẫu nghiên cứu 49 3.1.2 Tách chiết DNA tổng số 52 3.1.3 Đánh giá tương quan ABCG2 rs72552713 bệnh gút 53 3.1.4 Đánh giá tương quan rs12505410 gen ABCG2 bệnh gút .57 3.1.5 Đánh giá tương quan rs11231825 gen SLC22A12 bệnh gút 63 3.1.6 Đánh giá tương quan rs7932775 gen SLC22A12 bệnh gút 68 3.1.7 Đánh giá tương quan rs12510549 gen SLC2A9 bệnh gút 71 3.1.8 Đánh giá tương quan rs16890979 gen SLC2A9 bệnh gút 75 3.1.9 Đánh giá tương quan rs1800629 gen TNFa bệnh gút 79 3.1.10 Đánh giá tương quan rs2149356 gen TLR4 bệnh gút 83 3.1.11 Đánh giá tương quan rs1165196 gen SLC17A1 bệnh gút 89 3.1.12 Tương quan đặc điểm lâm sàng số cận lâm sàng với bệnh gút 93 3.2 THẢO LUẬN 98 3.2.1 Đặc điểm lâm sàng cận lâm sàng đối tượng nghiên cứu 98 3.2.2 Tương quan đa hình gen ABCG2 với bệnh gút 99 3.2.3 Tương quan đa hình gen SLC22A12 với bệnh gút 103 3.2.4 Tương quan đa hình gen SLC2A9 với bệnh gút .105 3.2.5 Tương quan đa hình gen TNFa với bệnh gút 110 3.2.6 Tương quan đa hình gen TLR4 với bệnh gút 111 3.2.7 Tương quan đa hình gen SLC17A1 với bệnh gút 113 3.2.8 Mối liên quan số cận lâm sàng với bệnh gút 114 KẾT LUẬN .115 KIẾN NGHỊ 117 TÀI LIỆU THAM KHẢO 118 DANH SÁCH CÁC CƠNG TRÌNH KHOA HỌC PHỤ LỤC DANH MỤC TỪ VIẾT TẮT ANOVA Analysis of variance Phân tích phương sai ALT Alanine aminotransferase Alanine aminotransferase AST Aspatate transaminase Aspatate transaminase ATP Adenosine triphosphate Adenosine triphosphate BMI Body mass index Chỉ số khối thể base pair Cặp base Blood urea nitrogen Urea nitrogen máu bp BUN Community COPCORD Program Oriented Chương trình Định hướng for Control of cộng đồng kiểm soát bệnh Rheumatic Diseases khớp CI95% Confident interval 95% Khoảng tin cậy 95% CREA Creatinine Creatinine C-reactive protein Protein phản ứng C CRP cs Cộng DBP Diastolic blood pressure Huyết áp tâm trương DNA Deoxy ribonucleic acid Deoxyribonucleic acid GLU Glucose Đường máu GWAS HDL-C HWE ILAR Kb LDL-C MSU Genome wide association Nghiên cứu tương quan toàn study nhiễm sắc thể High density lipoprotein – Cholesterol có lipoprotein tỉ cholesterol trọng cao Hardy – Weinberg equilibrium International League Against Rheumatism Cân Hardy - Weinberg Hội thấp khớp học giới Kilo base pair 1000 base Low density lipoprotein – Cholesterol có lipoprotein tỉ cholesterol trọng thấp Monosodium urate Muối urate natri n number Số lượng NST Nhiễm sắc thể OR Odd ratio Chỉ số odd PCR Polymerase chain reaction Phản ứng chuỗi polymerase SBP Systolic blood pressure Huyết áp tâm thu SNP TAE TG WBC Single nucleotide polymorphism Đa hình nucleotide đơn Tris – Acetate - EDTA Tris – Acetate - EDTA Triglyceride Chất béo trung tính White blood cells Bạch cầu