Luận văn thạc sĩ phân tích đa dạng di truyền vùng siêu biến adn ty thể người việt nam thuộc 5 dân tộc kinh, thái, hmong, lolo và giarai

ơAND ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN Hà Nội - 2018 Nguyễn Bảo Trang PHÂN TÍCH ĐA DẠNG DI TRUYỀN VÙNG SIÊU BIẾN ADN TY THỂ NGƯỜI VIỆT NAM THUỘC DÂN TỘC KINH, THÁI, HMONG, LOLO VÀ GIARAI LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC Hà Nội - 2020 z ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN Nguyễn Bảo Trang PHÂN TÍCH ĐA DẠNG DI TRUYỀN VÙNG SIÊU BIẾN ADN TY THỂ NGƯỜI VIỆT NAM THUỘC DÂN TỘC KINH, THÁI, HMONG, LOLO VÀ GIARAI Chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm Mã số: 8420101.14 LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC NGƯỜI HƯỚNG DẪN KHOA HỌC: TS NGUYỄN THÙY DƯƠNG PGS TS NGUYỄN QUANG HUY Hà Nội - 2020 z LỜI CẢM ƠN Để thực thành công luận văn thạc sĩ này, xin gửi lời cảm ơn sâu sắc chân thành đến TS Nguyễn Thùy Dương (Trưởng phòng Hệ gen học người Viện Nghiên cứu hệ gen, Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam), người trực tiếp hướng dẫn, bảo tận tình suốt thời gian tơi thực đề tài Cô người tạo điều kiện truyền cho kinh nghiệm quý báu nghiên cứu khoa học Trong suốt thời gian học tập nghiên cứu vừa qua, nhận dạy dỗ, khích lệ hỗ trợ nhiều mặt PGS TS Nguyễn Quang Huy (Trưởng khoa Sinh học, Trường Đại học Khoa học tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội) Sự quan tâm, giúp đỡ thày góp phần khơng nhỏ giúp tơi hồn thành luận văn tốt nghiệp Tôi xin chân thành cảm ơn trợ giúp q báu Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn đến PGS TS Nơng Văn Hải (Chủ tịch Hội đồng Khoa học, Viện Nghiên cứu hệ gen), tập thể cán Phòng Hệ gen học người cán Viện Nghiên cứu hệ gen, Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam tạo điều kiện thuận lợi tận tình hướng dẫn, trợ giúp thực tốt đề tài nghiên cứu Tôi xin chân thành cảm ơn thầy cô thuộc Khoa Sinh học, Trường Đại học Khoa học tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội tạo điều kiện tốt cho tơi để hồn thành luận văn Luận văn thực khuôn khổ đề tài thuộc Bộ Khoa học Công nghệ mã số ĐTĐL.CN-05/15 đề tài cấp sở thuộc Viện Nghiên cứu hệ gen – Viện Hàn lâm Khoa học Công nghệ Việt Nam Hà Nội, ngày 30 tháng 12 năm 2019 Học viên cao học Nguyễn Bảo Trang z MỤC LỤC DANH MỤC CÁC HÌNH iv DANH MỤC CÁC BẢNG v MỞ ĐẦU Chương TỔNG QUAN 1.1 Đặc điểm ADN ty thể người 1.1.1 Cấu trúc ADN ty thể 1.1.2 Cấu trúc vùng điều khiển D-loop ADN ty thể 1.1.3 ADN ty thể, vùng D-loop hai đoạn siêu biến HV-I HV-II nghiên cứu di truyền quần thể người 1.1.4 Tình hình nghiên cứu di truyền quần thể người Việt Nam dựa hai đoạn siêu biến HV-I HV-II thuộc vùng D-loop ý nghĩa thực tiễn đề tài luận văn 1.2 Một số đặc điểm dân tộc học người Kinh, Thái, Hmong, Lolo Giarai Chương ĐỐI TƯỢNG VÀ PHƯƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .12 2.1 Đối tượng nghiên cứu .12 2.2 Hóa chất thiết bị 14 2.3 Phương pháp nghiên cứu 15 2.3.1 Phương pháp tách chiết ADN tổng số 15 2.3.2 Phương pháp điện di kiểm tra gel agarose 16 2.3.3 Phương pháp khuếch đại đoạn ADN PCR 16 2.3.4 Phương pháp giải trình tự ADN 17 2.3.5 Phương pháp phân tích số liệu 17 Chương KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN .19 3.1 Tách chiết tinh ADN tổng số từ mẫu máu 19 3.2 Khuếch đại đoạn gen chứa trình tự gen HV-I HV-II 19 i z 3.3 Xác định trình tự phân tích số liệu đoạn gen HV-I HV-II mẫu nghiên cứu 21 3.3.1 Xác định đa hình thuộc hai vùng siêu biến HV-I HV-II mẫu nghiên cứu 21 3.3.2 Phân tích thống kê đa hình thuộc hai vùng siêu biến HV-I HV-II dân tộc Kinh, Thái, Hmong, Lolo Giarai 24 3.4 Phân tích đa dạng di truyền mẫu nghiên cứu thuộc dân tộc Kinh, Thái, Hmong, Lolo Giarai sở trình tự vùng siêu biến ADN ty thể 35 KẾT LUẬN VÀ KIẾN NGHỊ 38 TÀI LIỆU THAM KHẢO 39 PHỤ LỤC 44 ii z DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT Chữ viết tắt Tiếng Anh Tiếng Việt bp Base pair Cặp bazơ ADN Deoxyribonucleic acid Axit Deoxyribonucleic ddNTP Dideoxynucleoside triphosphate Dideoxynucleoside triphosphate dNTP Deoxynucleoside triphosphate Deoxynucleoside triphosphate EDTA Ethylene acid EtOH Ethanol Etanol HV1 Hypervariable segment Đoạn siêu biến HV2 Hypervariable segment Đoạn siêu biến PCR Polymerase chain reaction Phản ứng chuỗi polymerase RNA Ribonucleic acid Axit ribonucleic TAE Tris – acetate – EDTA Tris – acetate – EDTA SNP Single nucleotide polymorphism Đa hình nucleotide đơn diamine tetra-acetic Axit ethylene diamine tetraacetic iii z DANH MỤC CÁC HÌNH Hình Cấu trúc ADN ty thể người .4 Hình Cấu trúc vùng D-loop ADN ty thể người Hình Sơ đồ mơ tả q trình di cư nhóm đơn bội ADN ty thể người Hình Ảnh điện di ADN tổng số gel agarose 0,8% 19 Hình Ảnh điện di sản phẩm PCR khuếch đại đoạn gen HV-I số mẫu đại diện gel agarose 1% 20 Hình Ảnh điện di sản phẩm PCR khuếch đại đoạn gen HV-II số mẫu đại diện gel agarose 1% 20 Hình Kết giải trình tự số mẫu đại diện chứa số đa hình đoạn HV-I 22 Hình Biểu đồ thống kê đa hình đoạn HV-I HV-II vùng D-loop phát dân tộc Kinh, Thái, Hmong, Lolo Giarai so sánh với trình tự tham chiếu rCRS .23 iv z DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng Mẫu nghiên cứu dân tộc Kinh, Thái, Hmong, Lolo Giarai .12 Bảng Các đa hình phổ biến có tần suất khác dân tộc Kinh Thái .24 Bảng Các đa hình phổ biến có tần suất khác dân tộc Kinh Hmong 25 Bảng Các đa hình phổ biến có tần suất khác dân tộc Kinh Giarai .…26 Bảng Các đa hình phổ biến có tần suất khác dân tộc Kinh Lolo 27 Bảng Các đa hình phổ biến có tần suất khác dân tộc Thái Hmong 28 Bảng Các đa hình phổ biến có tần suất khác dân tộc Thái Lolo .29 Bảng Các đa hình phổ biến có tần suất khác dân tộc Thái Giarai 30 Bảng Các đa hình phổ biến có tần suất khác dân tộc Hmong Lolo 31 Bảng 10 Các đa hình phổ biến có tần suất khác dân tộc Hmong Giarai 32 Bảng 11 Các đa hình phổ biến có tần suất khác dân tộc Lolo Giarai 33 Bảng 12 Tần suất nhóm đơn bội 182 mẫu nghiên cứu thuộc dân tộc Kinh, Thái, Hmong, Lolo Giarai 36 v z MỞ ĐẦU Việc giải mã ADN hệ gen người cho đóng vai trị quan trọng việc tìm hiểu q trình tiến hóa, ngun nhân gây bệnh tương tác môi trường di truyền người Chính điều có nhiều nhà khoa học phịng thí nghiệm lớn toàn giới tập trung giải mã ADN Một hướng nghiên cứu tập trung nhiều giải mã ADN ty thể ADN ty thể có đặc tính di truyền theo dịng mẹ, trao đổi chéo, số lượng lớn tế bào bị phân hủy theo thời gian Do đó, nghiên cứu liên quan đến ADN ty thể giải vấn đề then chốt q trình tiến hóa giải thích lịch sử di truyền quần thể người vùng địa lý khác khoảng thời gian khác [23, 33] Bên cạnh đó, có nhiều nghiên cứu cấu trúc hệ gen cá thể người tương đối giống (99,9%), khác biệt lên đến 0,1% Phần khác biệt chủ yếu đa hình nucleotide đơn (SNP) có ảnh hưởng đến nhân chủng học dân tộc Do đó, SNP ADN ty thể thích hợp để nghiên cứu mẫu ADN cổ đại, ứng dụng rộng rãi sinh học y học Trong phân tử ADN ty thể, dù mang chức quan trọng, vùng điều khiển (D-loop) lại có tỷ lệ đột biến cao gấp 10 lần so với vùng mã hóa Tuy nhiên, biến đổi vùng D-loop phân bố không đều, mật độ biến đổi cao vị trí đa hình tìm thấy hai đoạn siêu biến (HV-I HV-II) [11] HV-I HV-II chứa nhiều điểm đa hình, có trình tự thay đổi theo thời gian khác vùng địa lý, nên tập trung nghiên cứu nhiều [15] Nghiên cứu đa dạng di truyền dân tộc Việt Nam vấn đề chưa có nhiều cơng trình cơng bố Một số phịng thí nghiệm trọng điểm bắt đầu nghiên cứu vấn đề để hiểu rõ nguồn gốc tiến hóa bổ sung thêm liệu di truyền dân tộc Việt Nam Chính điều này, chúng tơi tập trung nghiên cứu đa hình nucleotide đơn (SNP) vùng siêu biến ADN ty thể dân tộc Kinh, Thái, Hmong, Lolo Giarai với nội dung bao gồm: z − Tách chiết ADN tổng số từ mẫu máu 182 cá thể thuộc dân tộc Kinh, Thái, Hmong, Lolo Giarai − Khuếch đại xác định trình tự hai đoạn gen HV-I HV-II ADN ty thể mẫu nghiên cứu − Phân tích trình tự phân loại theo nhóm đơn bội mẫu nghiên cứu thuộc dân tộc Kinh, Thái, Hmong, Lolo Giarai z 119 16300 HV-I A G 0 120 16301 HV-I C G 0 121 16304 HV-I T C 11 5 12 122 16305 HV-I A G 0 0 123 16309 HV-I A G 0 0 124 16311 HV-I T C 7 10 12 125 16327 HV-I C T 126 16335 HV-I A G 1 0 127 16354 HV-I C T 0 128 16355 HV-I C T 129 16356 HV-I T C 0 130 16357 HV-I T C 0 0 131 16362 HV-I T C 132 16381 HV-I T C 0 0 133 16390 HV-I G A 1 134 16391 HV-I G A 0 0 135 16399 HV-I A G 0 136 16465 HV-I C T 0 137 16482 HV-I A G 0 0 138 16519 HV-I T C 38 17 26 35 28 139 16527 HV-I C T 0 49 z Phụ lục Phân loại theo nhóm đơn bội 182 mẫu nghiên cứu thuộc dân tộc Kinh, Thái, Hmong, Lolo Giarai dựa vị trí đa hình vùng siêu biến từ vị trí 57-499 16024-16567 Đa hình Mẫu Kinh01 A73G, A263G, T310C, A16182C, A16183C, T16189C, T16304C, T16519C Nhóm đơn bội F1 A73G, C150T, A263G, T310C, C456T, T489C, Kinh02 A16182C, A16183C, T16189C, C16223T, G16273A, D5 T16362C A73G, G185A, A189G, A215G, A263G, T310C, Kinh03 T16086C, A16182C, A16183C, T16189C, T16311C, R1 G16390A, A16399G, T16519C Kinh04 A73G, T146C, T146A, A263G, T310C, T489C, T16519C M7 A73G, T199C, A263G, T310C, G499A, T16136C, Kinh05 C16147T, A16175G, A16182C, A16183C, T16189C, B4 T16217C, C16218T, T16311C, T16519C Kinh06 Kinh07 A73G, A210G, A263G, T16093C, T16140C, A16183C, T16189C, C16266A, C16295T, C16296T, T16519C A73G, A263G, T310C, T489C, T16093C, C16223T, T16298C, C16327T, T16519C B5 C7 A73G, T204C, A263G, T310C, T16136C, T16140C, Kinh08 A16183C, T16189C, T16243C, T16311C, C16354T, B5 T16356C, T16519C Kinh09 Kinh10 A73G, A210G, A263G, T16140C, A16183C, T16189C, C16266A, T16519C A73G, T204C, A263G, T310C, T489C, C16223T, T16311C, T16362C, T16519C 50 z B5 M7 Kinh11 Kinh12 A73G, A189G, G255A, A263G, T310C, G16129A, T16172C, T16304C, T16519C A73G, A263G, T310C, G16129A, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, C16261T, C16354T, F1 B4 A73G, T146C, A153G, A263G, T310C, T16093C, Kinh13 C16174T, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, B4 C16261T, T16519C Kinh14 Kinh15 A73G, A210G, A263G, T310C, T16140C, T16189C, C16266A, T16519C A73G, A263G, T310C, T489C, T16189C, C16223T, C16327T, T16519C B5 C7 A73G, C150T, A263G, A384G, G16129A, T16140C, Kinh16 A16166G, A16183C, T16189C, T16217C, G16274A, B4 A16335G, T16519C Kinh17 Kinh18 Kinh19 A73G, A263G, T310C, C16108T, G16129A, T16172C, T16304C, T16311C, T16519C A73G, A263G, T318C, C463T, T489C, G16129A, C16223T, C16234T, C16261T, C16290T A73G, T146C, T199C, A263G, T310C, T489C, C16223T, C16295T, T16519C F1 M1 M7 A73G, T146C, T152C, T199C, A263G, T310C, T489C, Kinh20 T16075C, C16223T, C16278T, A16293T, C16295T, M7 T16519C Kinh21 A73G, C150T, T199C, G207A, A263G, T310C, T489C, G16129A, C16192T, T16297C M7 A73G, G103A, T131C, A263G, T310C, T16092C, Kinh22 C16111T, T16140C, A16183C, T16189C, C16234T, B5 T16243C, T16519C Kinh23 A73G, A263G, T310C, G16129A, A16183C, T16189C, T16209C, T16304C, G16390A, T16519C 51 z F1 Kinh24 Kinh25 Kinh26 Kinh27 A73G, A263G, T310C, A16183C, T16189C, T16304C, G16390A, T16519C A73G, 152C, A249G, A263G, T310C, T489C, T16140C, T16172C, T16189C, C16223T, C16278T A73G, G143A, T195C, T204C, A263G, T310C, T489C, C16223T, T16271C, T16362C, T16519C A73G, C150T, T199C, A263G, T310C, T489C, G16129A, T16189C, C16223T, T16297C F1 M5 M7 M7 A73G, C114T, C150T, T152C, G185A, A263G, T310C, Kinh28 C456T, T489C, T16092C, C16148T, A16183C, D5 T16189C, C16223T, T16362C, T16519C Kinh29 Kinh30 Kinh31 Kinh32 Kinh33 Kinh34 Kinh699 Kinh700 A73G, C150T, C151T, A263G, T310C, T16093C, T16157C, T16304C A73G, A210G, A263G, T16140C, A16183C, T16189C, C16266A, T16519C A73G, A234G, A263G, T279C, T310C, T16092C, T16093C, A16183C, T16189C, T16519C A73G, T152C, A263G, T310C, T489C, C16223T, T16298C, C16327T A73G, T146C, A263G, T310C, A16182C, A16183C, T16189C, C16261T, T16519C A73G, A263G, T310C, C16108T, G16129A, A16162G, T16172C, T16304C, T16519C A73G, C150T, T199C, T204C, A263G, T310C, T489C, C16223T, T16297C A73G, G207A, A263G, T310C, T16093C, C16260T, T16298C, C16355T, T16362C R9 B5 B6 C7 B4 F1 M7 F3 A73G, C150T, T199C, T204C, A263G, T310C, C456T, Kinh701 T489C, T16093C, G16129A, A16183C, T16189C, C16223T, T16297C 52 z M7 Kinh702 Kinh703 A73G, A263G, T310C, G523A, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, C16261T, C16294T, T16519C A73G, A263G, T310C, T489C, A574C, C16223T, T16297C, T16311C, C16327T, T16519C B4 C7 A73G, C150T, T199C, A263G, T489C, G16129A, Kinh704 C16192T, C16223T, T16297C, C16301T, C16301G, M7 G16391A, T16519C Kinh705 Kinh706 Kinh707 Kinh708 Kinh709 A73G, C150T, T199C, A263G, T489C, G16129A, T16189C, C16223T, T16297C, T16519C A73G, T152C A263G, T489C, T507C, G16129A, C16223T, T16263C, T16362C, T16519C A73G, C150T, T310C, C456T, T489C, A16183C, T16189C, C16223T, T16362C, T16519C A73G, C150T, T195C, A263G, A16183C, T16189C, T16249C, T16304C, A16305G, T16519C A73G, A263G, T310C, T504C, G16129A, T16304C M7 D4 D5 F1 F1 A73G, T199C, A263G, T310C, G499A, T16136C, Kinh710 A16175G, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, B4 C16218T, T16311C, T16519C Kinh711 Kinh712 A73G, T146C, A263G, T310C, T489C, T16519C A73G, A210G, T226C, A263G, T16140C, A16183C, T16189C, C16266A, A16482G, T16519C M7 B5 A73G, C150T, T195C, A263G, T310C, A16183C, Kinh713 T16189C, T16249C, A16300G, T16304C, A16305G, F1 T16519C Kinh714 Kinh715 Thai130 A73G, A263G, T310C, G16129A, T16172C, T16304C, T16519C A73G, C150T, C151T, T195C, A263G, T489C, C16223T, A16269G, T16271C A73G, C150T, A263G, T310C, C16223T, C16257A, 53 z F1 M7 N9 C16261T, G16390A Thai136 Thai248 Thai249 Thai250 Thai251 Thai252 A73G, A263G, C298T, T489C, C16169T, C16223T, C16266A, G16274A, T16311C, T16362C A73G, A263G, T310C, T489C, T16298C, C16327T, T16519C A73G, T146C, T199C, A263G, T310C, T489C, C16223T, C16295T, T16519C A73G, G207A, A263G, T310C, T489C, T16093C, T16172C, C16223T, T16298C, C16327T, T16519C A73G, C150T, C182T, T199C, T204C, A263G, T489C, G16129A, C16192T, C16223T, T16297C, T16311C A73G, A263G, C298T, T310C, T466C, T489C, C16223T, G16274A, T16362C D4 C7 M7 C7 M7 D4 A73G, T146C, A263G, T310C, C16168T, A16182C, Thai253 A16183C, T16189C, T16217C, C16261T, T16311C, B4 T16519C Thai254 A73G, T152C, T195C, A263G, T310C, T489C, C16223T, T16311C, C16355T, T16362C M7 A73G, T146C, A263G, T310C, C16168T, A16182C, Thai255 A16183C, T16189C, T16217C, C16261T, T16311C, B4 T16519C Thai257 Thai258 A73G, T152C, A263G, T310C, C16111T, G16129A, C16266A, T16304C, T16519C A73G, A263G, T310C, T489C, T16298C, C16327T, T16519C F1 C7 C64T, A73G, A244G, A263G, T310C, C340T, T499C, Thai262 T16093C, G16129A, C16134T, T16140C, C16150T, M5 T16189C, C16223T, T16271C, A16399G, T16519C Thai263 A73G, T152C, A263G, T310C, C16111T, G16129A, C16266A, T16304C, T16519C 54 z F1 A73G, T125C, T127C, C128T, T146C, T152C, A263G, Thai268 T318C, T499C, G16129A, C16223T, C16234T, M1 C16290T, T16311C A73G, A263G, T310C, A16180C, A16181C, A16182C, Thai269 A16183C, T16189C, G16213A, T16217C, C16261T, B4 C16292T, T16519C Thai270 Thai271 Thai272 Thai393 Thai55 A73G, C150T, T199C, T204C, A263G, T310C, T499C, G16129A, C16192T, C16223T, T16297C A73G, T146C, A263G, T310C, T499C, T16172C, C16223T, C16291T, T6311C, T16519C A73G, T152C, A263G, G16129A, A16162G, T16172C, T16304C, T16519C A73G, T16172C, T16304C, C16465T, T16519C A73G, T146C, T199C, T204C, A263G, T310C, T499C, T16519C A73G, Thai56 A263G, A263G, A16181C, A16182C, M7 M7 F1 F1 M7 A16183C, T16189C, G16213A, T16217C, C16261T, C16292T, B4 T16519C Thai57 Thai99 A73G, A263G, G16129A, T16172C, T16304C, T16519C A73G, A263G, T310C, C16108T, G16129A, A16162G, T16172C, C16256T, T16362C, T16519C F1 F1 A73G, C150T, T195C, A263G, T310C, C16108T, Hmong194 C16111T, G16129A, A16162G, T16172C, T16304C, F1 T16519C Hmong195 Hmong196 A73G, A263G, T310C, T489C, C16223T, T16356C, T16362C A73G, C150T, T195C, A263G, T310C, C16108T, C16111T, G16129A, A16162G, T16172C, T16304C, 55 z D4 F1 T16519C Hmong197 Hmong198 Hmong199 Hmong200 A73G, C150T, A263G, T310C, T16086C, C16223T, C16257A, C16261T, T16311C C64T, A73G, A210G, A263G, T310C, T16140C, A16183C, T16189C, C16262T, C16266A, T16519C A73G, A263G, T16093C, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, C16261T, T16357C, T16519C A73G, C150T, A263G, T310C, T16086C, C16223T, C16261T, T16311C N9 B5 B4 N9 A73G, A263G, A263G, T310C, T16093C, A16182C, Hmong201 A16183C, T16189C, T16217C, C16261T, T16357C, B4 T16519C Hmong202 Hmong203 A73G, C150T, A263G, T310C, T16086C, C16223T, C16257A, C16261T, T16311C A73G, C150T, A263G, T310C, T16086C, C16223T, C16257A, C16261T, T16311C N9 N9 A73G, T125C, T127C, C128T, A263G, T310C, T318C, Hmong204 T489C, C16223T, C16234T, C16257A, C16290T, M1 T16311C, T16362C A73G, A263G, T310C, T16093C, C16169T, A16182C, Hmong205 A16183C, T16189C, T16217C, C16261T, T16357C, B4 T16519C Hmong206 A73G, A263G, T310C, T16172C, T16304C, T16519C Hmong207 Hmong208 Hmong209 C64T, A73G, A210G, A263G, T310C, T16140C, A16183C, T16189C, C16262T, C16266A, T16519C A73G, C150T, A263G, T310C, T16086C, C16223T, C16257A, C16261T, T16311C A73G, T204C, G207A, A263G, T310C, C16260T, T16298C, C16355T, T16362C Hmong210 C64T, A73G, A210G, A263G, T310C, T16140C, 56 z F1 B5 N9 F3 B5 A16183C, T16189C, C16262T, C16266A, T16519C Hmong211 Hmong212 Hmong213 Hmong214 Hmong215 Hmong216 Hmong217 Hmong218 Hmong219 Hmong220 Hmong221 Hmong222 Hmong223 Hmong224 A73G, C150T, A263G, T310C, C16223T, C16257A, C16261T, T16311C A73G, A263G, T310C, G16129A, T16172C, T16304C, T16519C A73G, C114T, A210G, A263G, T16140C, A16183C, T16189C, C16266A, T16519C A73G, A263G, T310C, T489C, C16223T, T16288C, T16298C, A16300G, C16327T, T16519C A73G, T204C, G207A, A263G, T310C, C16260T, T16298C, C16355T, T16362C C64T, A73G, A210G, A263G, T310C, T16140C, A16183C, T16189C, C16262T, C16266A, T16519C A73G, C150T, A263G, T310C, T16086C, C16223T, C16257A, C16261T, T16311C A73G, A263G, T310C, T489C, C16223T, T16288C, T16298C, A16300G, C16327T, T16519C C64T, A73G, A210G, A263G, T310C, T16140C, A16183C, T16189C, C16262T, C16266A, T16519C A73G, A263G, T310C, T489C, C16223T, T16288C, T16298C, A16300G, C16327T, T16519C A73G, A210G, A263G, T16140C, A16183C, T16189C, C16266A, T16519C C64T, A73G, A210G, A263G, T310C, T16140C, A16183C, T16189C, C16262T, C16266A, T16519C C64T, A73G, A210G, A263G, T310C, T16140C, A16183C, T16189C, C16262T, C16266A, T16519C A73G, A263G, T310C, T489C, C16223T, T16356C, T16362C Hmong225 A73G, A263G, T310C, T489C, C16223T, T16356C, 57 z N9 F1 B5 C5 F3 B5 N9 C5 B5 C5 B5 B5 B5 D4 D4 T16362C T63C, C64T, G66A, A73G, A215G, A263G, T310C, Hmong226 T489C, T16093C, C16223T, T16311C, T16362C, M7 T16381C A73G, A263G, T16093C, C16169T, A16182C, Hmong227 A16183C, T16189C, T16217C, C16261T, T16357C, B4 T16519C Hmong228 Hmong229 Hmong230 Hmong231 A73G, A263G, T310C, T489C, C16223T, C16288T, T16298C, A16300G, C16327T, T16519C A73G, A263G, T310C, A16129G, A16183C, T16189C, T16304C, T16519C A73G, A263G, T310C, T489C, C16223T, C16288T, T16298C, A16300G, C16327T, T16519C A73G, A263G, T16093C, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, C16261T, T16357C, T16519C C5 F1 C5 B4 T63C, C64T, G66A, A73G, A215G, A263G, T310C, Hmong232 T489C, T16093C, C16223T, T16311C, T16362C, M7 T16381C Hmong233 Hmong234 A73G, A263G, T310C, T16093C, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, C16261T, T16357C, T16519C C64T, A73G, A210G, A263G, T310C, T16140C, A16183C, T16189C, C16262T, C16266A, T16519C B4 B5 A73G, T152C, A183G, A244G, A263G, T310C, Lolo458 A374G, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, B4 G16274A, A16289G, C16301T, T16519C Lolo459 Lolo460 Lolo461 A73G, A263G, T310C, C16108T, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, T16362C, T16519C A73G, A263G, T310C, C16108T, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, T16362C, T16519C A73G, A263G, T310C, C16108T, A16182C, A16183C, 58 z B4 B4 B4 T16189C, T16217C, T16362C, T16519C Lolo462 A73G, A263G, T310C, C16108T, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, T16362C, T16519C B4 A73G, A263G, T310C, G16129A, A16180C, A16181C, Lolo463 A16182C, A16183C, T16189C, G16213A, T16217C, B4 C16261T, C16292T, T16519C A73G, T152C, A183G, A244G, A263G, T310C, Lolo464 A374G, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, B4 G16274A, A16289G, C16301T, T16519C Lolo465 A73G, A263G, T310C, G16129A, T16172C, T16304C, T16519C F1 A73G, T152C, A183G, A244G, A263G, T310C, Lolo466 A374G, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, B4 G16274A, A16289G, C16301T, T16519C A73G, Lolo467 A263G, G16129A, A16180C, A16181C, A16182C, A16183C, T16189C, G16213A, T16217C, B4 C16261T, C16292T, T16519C A73G, T152C, A183G, A244G, A263G, T310C, Lolo468 A374G, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, B4 G16274A, A16289G, C16301T, T16519C A73G, T152C, A183G, A244G, A263G, T310C, Lolo469 A374G, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, B4 G16274A, A16289G, C16301T, T16519C A73G, T152C, A183G, A244G, A263G, T310C, Lolo470 A374G, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, B4 G16274A, A16289G, C16301T, T16519C Lolo471 Lolo472 A73G, A263G, T310C, G16129A, T16172C, T16304C, T16519C A73G, T152C, A183G, A244G, A263G, T310C, A374G, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, 59 z F1 B4 G16274A, A16289G, C16301T, T16519C A73G, A263G, T310C, G16129A, A16180C, A16181C, Lolo473 A16182C, A16183C, T16189C, G16213A, T16217C, B4 C16261T, C16292T, T16519C Lolo474 A73G, T152C, A263G, T310C, A16183C, T16189C, C16232A, T16249C, C16266A, T16304C, T16519C F1 A73G, T152C, A183G, A244G, A263G, T310C, Lolo475 A374G, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, B4 G16274A, A16289G, C16301T, T16519C Lolo476 Lolo477 A73G, T152C, A263G, T310C, A16183C, T16189C, C16232A, T16249C, C16266A, T16304C, T16519C A73G, A263G, T310C, G16129A, T16172C, T16304C, T16519C F1 F1 A73G, T152C, A263G, T310C, A16183C, T16189C, Lolo478 C16232A, T16249C, C16266A, C16278T, T16304C, F1 T16519C Lolo479 A73G, T146C, T199C, T204C, A263G, T310C, T489C, T16093C, T16519C A73G, Lolo480 A263G, G16129A, A16180C, M7 A16181C, A16182C, A16183C, T16189C, G16213A, T16217C, B4 C16261T, C16292T, T16519C Lolo481 Lolo482 Lolo483 Lolo484 Lolo485 A73G, A263G, T310C, C16108T, A16182C, A16183C, T16189C, T16217C, T16519C A73G, T152C, A263G, T310C, A16183C, T16189C, C16232A, T16249C, C16266A, T16304C, T16519C A73G, A263G, T310C, C16108T, A16183C, T16189C, T16217C, T16362C, T16519C A73G, A263G, T310C, G16129A, T16172C, T16304C, T16519C A73G, A263G, T310C, G16129A, T16172C, T16304C, 60 z B4 F1 B4 F1 F1 T16519C Lolo486 A73G, T146C, A210G, A263G, T16140C, A16183C, T16189C, C16266A, T16519C B5 A73G, A263G, T310C, G16129A, A16180C, A16181C, Lolo487 A16182C, A16183C, T16189C, G16213A, T16217C, B4 C16261T, C16292T, T16519C Lolo488 Lolo489 Lolo490 Lolo491 Lolo492 Lolo493 Giarai100 Giarai104 Giarai107 Giarai124 Giarai134 Giarai60 A73G, T146C, A210G, A263G, T310C, T16140C, A16183C, T16189C, C16266A, T16519C A73G, A263G, T310C, G16129A, T16172C, T16304C, T16519C A73G, A263G, T310C, G16129A, T16172C, T16304C, T16519C A73G, A263G, T310C, G16129A, T16172C, T16304C, T16519C A73G, T152C, G207A, A263G, T310C, T16249C, T16298C, C16355T, T16362C, G16390A, T16519C A73G, T146C, A210G, A263G, T310C, T16140C, A16183C, T16189C, C16266A, T16519C A73G, C151T, A263G, T310C, T489C, A16183C, T16189C, C16223T, T16271C, T16311C, T16519C A73G, T146C, C150T, A263G, T489C, T504C, G16129A, C16223T, C16256T, T16519C A73G, C151T, A263G, T310C, T489C, A16183C, T16189C, C16223T, T16271C, T16311C, T16519C A73G, T146C, C150T, A263G, T310C, T489C, T504C, G16129A, C16223T, C16256T, T16519C A73G, C150T, T199C, A263G, T310C, C322T, T489C, G16129A, T16189C, C16223T, T16297C A73G, C151T, A263G, T310C, T489C, A16183C, T16189C, C16223T, T16271C, T16311C, T16519C 61 z B5 F1 F1 F1 F3 B5 M7 M2 M7 M2 M7 M7 Giarai67 Giarai716 Giarai717 A73G, C151T, A263G, T310C, T489C, A16183C, T16189C, C16223T, T16271C, T16311C, T16519C A73G, A263G, T310C, T489C, A16206G, C16223T, T16311C, T16362C, T16519C A73G, G143A, T146C, A183G, T204C, A263G, T310C, T16288C, T16304C, A16309G, G16390A, T16519C M7 M7 R9 A73G, G143A, T152C, G255A, A263G, T310C, G316A, Giarai718 T489C, T16086C, G16129A, T16209C, C16223T, M2 A16272G, T16519C A73G, G143A, T152C, G255A, A263G, T310C, G316A, Giarai719 T489C, T16086C, G16129A, T16209C, C16223T, M2 A16272G, T16519C Giarai720 Giarai721 Giarai722 Giarai723 Giarai724 Giarai725 Giarai726 A73G, A263G, T310C, T489C, T16189C, C16223T, A16284G, C16291T, T16298C, C16327T, T16519C A73G, C151T, A263G, T310C, T489C, A16183C, T16189C, C16223T, T16271C, T16311C, T16519C A73G, C151T, A263G, T310C, T489C, A16183C, T16189C, C16223T, T16271C, T16311C, T16519C A73G, T152C, A263G, T310C, T16172C, T16304C, T16311C, T16362C, T16519C A73G, C150T, T195C, A263G, T310C, G16129A, C16193T, C16223T, T16519C, C16527T A73G, A263G, T310C, T489C, A16206G, C16223T, T16311C, T16362C, T16519C A73G, C150T, T195C, A263G, T310C, G16129A, C16193T, C16223T, T16519C A73G, Giarai727 C151T, T152C, A263G, T310C, M7 M7 M7 F1 N2 M7 N2 T489C, A16183C, T16189C, C16223T, T16271C, T16311C, M7 T16519C Giarai728 A73G, A263G, T310C, G16129A, A16162G, T16172C, 62 z F1 T16304C, A16399G, T16519C Giarai729 A73G, C151T, A263G, T310C, T489C, A16183C, T16189C, C16223T, T16271C, T16311C, T16519C M7 A73G, T152C, A210G, A263G, T310C, T16140C, Giarai730 A16182C, A16183C, T16189C, A16240G, C16261T, B5 C16266A, T16519C Giarai731 Giarai732 Giarai733 Giarai734 A73G, C150T, T195C, A263G, T310C, G16129A, C16193T, C16223T, T16519C A73G, C150T, T199C, A263G, T310C, C332T, T489C, G16129A, A16183C, T16189C, C16223T, T16297C A73G, C151T, A263G, T310C, T489C, A16183C, T16189C, C16223T, T16271C, T16311C, T16519C A73G, T199C, A263G, T310C, T489C, C16223T, C16278T, C16354T, G16390A, T16519C N2 M7 M7 M7 A73G, G143A, T152C, G225A, A263G, T310C, G316A, Giarai735 T489C, T16086C, G16129A, T16209C, C16223T, M2 A16272G, T16519C A73G, G143A, T152C, T195C, G225A, A263G, T310C, Giarai81 G316A, T489C, T16086C, G16129A, T16209C, M2 C16223T, A16272G, T16519C Giarai91 Giarai93 A73G, T146C, C150T, A263G, T310C, T489C, T504C, G16129A, C16223T, C16256T, T16519C A73G, C151T, A263G, T310C, T489C, A16183C, T16189C, C16223T, T16271C, T16311C, T16519C 63 z M2 M7 ... Trang PHÂN TÍCH ĐA DẠNG DI TRUYỀN VÙNG SIÊU BIẾN ADN TY THỂ NGƯỜI VIỆT NAM THUỘC DÂN TỘC KINH, THÁI, HMONG, LOLO VÀ GIARAI Chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm Mã số: 8420101.14 LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA... hình thuộc hai vùng siêu biến HV-I HV-II dân tộc Kinh, Thái, Hmong, Lolo Giarai 24 3.4 Phân tích đa dạng di truyền mẫu nghiên cứu thuộc dân tộc Kinh, Thái, Hmong, Lolo Giarai sở trình tự vùng. .. Lolo4 68, Lolo4 69, Lolo4 70, Lolo4 71, Lolo4 72, Lolo4 73, Lolo4 74, Lolo4 75, Lolo4 76, Lolo4 77, Lolo4 78, Lolo4 79, Lolo4 80, Lolo4 81, Lolo4 82, Lolo4 83, Lolo4 84, Lolo4 85, Lolo4 86, Lolo4 87, Lolo4 88, Lolo4 89, Lolo4 90,