Chọn lọc nâng cao năng suất sinh trưởng của gà mía bằng chỉ thị phân tử

HỌC VIỆN NƠNG NGHIỆP VIỆT NAM HỒNG ANH TUẤN CHỌN LỌC NÂNG CAO NĂNG SUẤT SINH TRƯỞNG CỦA GÀ MÍA BẰNG CHỈ THỊ PHÂN TỬ LUẬN ÁN TIẾN SĨ NHÀ XUẤT BẢN HỌC VIỆN NÔNG NGHIỆP - 2023 HỌC VIỆN NƠNG NGHIỆP VIỆT NAM HỒNG ANH TUẤN CHỌN LỌC NÂNG CAO NĂNG SUẤT SINH TRƯỞNG CỦA GÀ MÍA BẰNG CHỈ THỊ PHÂN TỬ Ngành : Chăn nuôi Mã số : 62 01 05 Người hướng dẫn : PGS.TS Bùi Hữu Đoàn PGS TS Nguyễn Hoàng Thịnh HÀ NỘI - 2022 LỜI CAM ĐOAN Tôi xin cam đoan cơng trình nghiên cứu riêng tơi, kết nghiên cứu trình bày luận án trung thực, khách quan chưa dùng để bảo vệ lấy học vị Tôi xin cam đoan giúp đỡ cho việc thực luận án cám ơn, thơng tin trích dẫn luận án rõ nguồn gốc Hà Nội, ngày… tháng 01 năm 2023 Tác giả luận án Hoàng Anh Tuấn i LỜI CẢM ƠN Trong suốt thời gian học tập, nghiên cứu hoàn thành luận án, nhận hướng dẫn, bảo tận tình thầy giáo, giúp đỡ, động viên bạn bè, đồng nghiệp gia đình Nhân dịp hồn thành luận án, cho phép tơi bày tỏ lịng kính trọng biết ơn sâu sắc tới PGS.TS Bùi Hữu Đoàn PGS.TS Nguyễn Hoàng Thịnh, Thầy tận tình hướng dẫn, dành nhiều cơng sức, thời gian tạo điều kiện cho suốt trình học tập thực đề tài Tơi xin bày tỏ lịng biết ơn chân thành tới Ban Giám đốc, Ban Quản lý đào tạo, Bộ môn Chăn nuôi chuyên khoa, Khoa Chăn nuôi - Học viện Nơng nghiệp Việt Nam tận tình giúp đỡ tơi trình học tập, thực đề tài hồn thành luận án Tơi xin bày tỏ lời cám ơn đến PGS.TS Phạm Kim Đăng Ban Chủ nhiệm Đề tài “Chọn lọc nâng cao suất sinh trưởng gà Mía thị phân tử”, Mã số 01C06/62-2016-4 hỗ trợ kinh phí cho phép tơi sử dụng số liệu đề tài Xin chân thành cảm ơn cán Công nhân viên Công ty Hadinco, Hội Chăn ni gà Mía, Phịng thí nghiệm Bộ môn Di truyền - Giống gia súc - Khoa Chăn nuôi, Học viện Nông nghiệp Việt Nam, nhiều sinh viên, học viên cao học tận tình giúp đỡ thực đề tài Xin chân thành cảm ơn người thân, gia đình, bạn bè đồng nghiệp ln bên cạnh, động viên khuyến khích giúp đỡ tơi tinh thần, vật chất để hoàn thành luận án Hà Nội, ngày… tháng năm 2023 Nghiên cứu sinh Hoàng Anh Tuấn ii MỤC LỤC Trang Lời cam đoan i Lời cảm ơn ii Mục lục iii Danh mục chữ viết tắt vi Danh mục bảng .ix Danh mục hình xii Danh mục sơ đồ xiv Trích yếu luận án xv Thesis abstract .xvii Phần Mở đầu 1.1 Tính cấp thiết đề tài .1 1.2 Mục tiêu 1.3 Đối tượng phạm vi nghiên cứu đề tài 1.3.1 Đối tượng nghiên cứu 1.3.2 Phạm vi nghiên cứu 1.4 Những đóng góp đề tài 1.5 Ý nghĩa khoa học thực tiễn đề tài 1.5.1 Ý nghĩa khoa học 1.5.2 Ý nghĩa thực tiễn Phần Tổng quan tài liệu 2.1 Sự di truyền tính trạng số lượng 2.1.1 Bản chất di truyền tính trạng số lượng 2.1.2 Ước tính giá trị giống 2.1.3 Tính trạng số lượng 2.1.4 Hệ số di truyền 2.1.5 Một số thành phần phương sai 2.2 Cơ sở khoa học việc đánh giá suất gà 2.2.1 Một số tính trạng sinh trưởng iii 2.2.2 Một số tính trạng sinh sản 10 2.3 Gà địa 12 2.3.1 Cải tiến gà địa 12 2.3.2 Gà địa Việt Nam 13 2.4 Chọn lọc nhân giống gà .17 2.4.1 Lịch sử phát triển công tác chọn lọc gia cầm .17 2.4.2 Nhân dòng 18 2.4.3 Hệ thống công tác giống gà 20 2.4.4 Nội dung công tác nhân giống gà .21 2.5 Ứng dụng công nghệ sinh học phân tử chọn lọc giống gà 22 2.5.1 Công nghệ gen 22 2.5.2 Một số thành tựu nghiên cứu SNPs công tác giống gà 23 2.5.3 Phươngpháptiếpcậngen ứngviên (Candidate Gene) .25 2.5.4 Kiểu gen GH INS liên quan đến tính trạng sản xuất gà 26 2.6 Tình hình nghiên cứu đa hình gen ngồi nước .30 2.6.1 Tình hình nghiên cứu đa hình gen gà giới 30 2.6.2 Tình hình nghiên cứu đa hình gen giống gà địa Việt Nam 33 2.6.3 Một số thơng tin gà Mía - đối tượng nghiên cứu 34 2.7 Ứng dụng số hàm số tốn học chăn ni gà thịt 35 Phần Nội dung phương pháp nghiên cứu 38 3.1 Nội dung nghiên cứu 38 3.1.1 Đối tượng nghiên cứu .38 3.1.2 Nội dung nghiên cứu 38 3.2 Phương pháp nghiên cứu 38 3.2.1 Nội dung 1: Đặc điểm hóa chi tết ngoại hình giống gà Mía 38 3.2.2 Nội dung 2: Xác định tần số kiểu gen đa hình gen INS, GH; ảnh hưởng kiểu gen đến khả tăng khối lượng gà Mía .39 3.2.3 Nội dung 3: Tạo dịng gà Mía sinh trưởng nhanh 42 3.2.4 Nội dung 4: Đánh giá khả sản xuất thịt xác định tuổi giết thịt thích hợp gà Mía thương phẩm (được sinh từ hệ 2) 51 Phần Kết thảo luận .55 iv 4.1 Đặc điểm ngoại hình gà mía 55 4.1.1 Tiêu chuẩn hóa đặc điểm ngoại hình gà Mía 55 4.2 Đa hình gen insulin (ins), growth hormone (gh) ảnh hưởng chúng đến khả sinh trưởng gà mía 66 4.2.1 Xác định đa hình gen, kiểu gen, tần số kiểu gen, alen gen INS GH đàn gà Mía 66 4.2.2 Ảnh hưởng kiểu gen gen INS GH đến khối lượng gà Mía 70 4.3 Chọn tạo dịng gà mía mang kiểu gen GG gen GH có khả sinh trưởng nhanh 79 4.3.1 Khả sinh sản gà Mía dịng trống có gen sinh trưởng nhanh, hệ xuất phát hệ 80 4.3.2 Tần số xuất kiểu gen GG đàn gà Mía hệ 87 4.3.3 Tỷ lệ nuôi sống, khối lượng thể hiệu sử dụng thức ăn gà Mía mang kiểu gen GG hệ hệ 87 4.3.4 Kết phân tích số tham số di truyền trình chọn lọc gà Mía qua hệ .95 4.4 Khả sản xuất gà mía thương phẩm thịt mang kiểu gen GG 98 4.4.1 Khối lượng thể .98 4.4.2 Chất lượng thân thịt tỷ lệ số nội quan gà Mía mang kiểu gen GG 101 4.4.3 Xác định hàm sinh trưởng phù hợp thời điểm giết thịt thích hợp cho gà Mía thương phẩm sinh trưởng nhanh .104 Phần Kết luận đề nghị 113 5.1 Kết luận 113 5.2 Đề nghị 114 Danh mục cơng trình cơng bố có liên quan đến luận án 115 Tài liệu tham khảo .116 Phụ lục 129 v DANH MỤC CHỮ VIẾT TẮT Chữ viết tắt ADN Tiếng Anh Tiếng Việt Deoxyribonucleic acid - Best Linear Unbiased Prediction Mơ hình tuyến tính tốt khơng thiên vị Bp Base pair Cặp bazơ BW Body Weight Khối lượng thể BW36 Body Weight at 36 days Khối lượng thể 36 ngày tuổi BW39 Body Weight at 39 days Khối lượng thể 39 ngày tuổi BW46 Body Weight at 46 days Khối lượng thể 46 ngày tuổi cGH Chicken growth hormone BLUP cGHR cGHSR Gen mã hóa hooc mơn sinh trưởng gà Gen mã hóa thụ thể hooc mơn sinh Chicken growth hormone receptor trưởng gà Chicken growth hormone secretagogue Thụ thể tiết hormone tăng trưởng receptor gà cs and others Cộng Cv % Coefficient of variation Hệ số biến thiên D-loop Displacement loop Vùng điều khiển ADN ty thể dNTP Deoxynucleotide Deoxynucleotid Đvt - Đơn vị tính ĐC - Đối chứng EAAP The European Federation of Animal Science Hiệp hội chăn nuôi Châu Âu EDTA Ethylene Diamine Tetraacetic Acid - F Forward Mồi xuôi FAO Food and Agriculture Organization of Tổ chức lương thực nông nghiệp the United Nations Liên hiệp quốc FCR Feed conversion ratio Hệ số chuyển hóa thức ăn GLM General Linear Models Mơ hình tuyến tính tổng quát GTG Breeding value Giá trị giống GWAS Genome wide association study Nghiên cứu liên kết toàn hệ gen INFPD International Network for vi Family Mạng lưới quốc tế phát triển chăn Chữ viết tắt Tiếng Anh Tiếng Việt Poultry Development nuôi gia cầm nông hộ INS Insuline gene Gen Insulin Kb Kilo base pair 1000 cặp bazơ kDa Kilodalton - LHQ The United Nations Liên hiệp quốc LSM Least Square Mean Trung bình bình phương nhỏ mARN Messenger RNA ARN thông tin ME Metabolizable Energy Năng lượng trao đổi MHC Major Histocompatibility Complex Phức hợp tương thích mơ MLM Mixed linear model Mơ hình tuyến tính hỗn hợp mtDNA Mitochondrial DNA DNA ty thể Mx Myxovirus resistant gen Mx gene NADH Nicotinamide adenine dinucleotide - NST - Năng suất trứng OD Optical density Mật độ quang OECD The Organisation for Cooperation Development PCR Polymerase Chain Reaction PCR-RFLP Polymerase chain reaction - Restriction Đa hình chiều dài đoạn cắt giới hạn fragment length polymorphism PCR PN Production Number Chỉ số sản xuất p-value Probability value Giá trị xác suất QTL Quantitative Trait Loci Cụm gen tính trạng số lượng R Reverse Mồi ngược RBI Rare Breeding International Tổ chức quốc tế giống RE Restriction Enzyme Enzym cắt giới hạn RFI Residual feed intake Lượng thức ăn dư thừa SCN AD Sau Công nguyên SD Standard deviation Độ lệch chuẩn SE Standard error Sai số chuẩn SLT - Sản lượng trứng SNPs Single-nucleotide polymorphism Đa hình nuclêơtit đơn Economic Tổ chức Hợp tác Phát triển Kinh tế Phản ứng chuỗi polymerase vii Chữ viết tắt Tiếng Anh Tiếng Việt TĂ - Thức ăn TCN BC Trước công nguyên TCVN - Tiêu chuẩn Việt Nam THXP - Thế hệ xuất phát TLNS - Tỷ lệ ni sống TN - Thí nghiệm TT - Tuần tuổi TTTĂ - Tiêu tốn thức ăn VN - Vòng ngực DT - Dài thân VN/DT - Vòng ngực/ Dài thân UNEP WCU The United Nations Environment Programme United Nations Educational Scientific and Cultural Organization World Conservation Union Cơ quan bảo vệ môi trường Liên hợp quốc Tổ chức giáo dục, khoa học văn hóa Liên Hiệp Quốc Hiệp hội Bảo tổn thiên nhiên giới WWF World Wide Fund for Nature Quỹ Quốc tế thiên nhiên - Trung bình mẫu UNESCO viii ... HỒNG ANH TUẤN CHỌN LỌC NÂNG CAO NĂNG SUẤT SINH TRƯỞNG CỦA GÀ MÍA BẰNG CHỈ THỊ PHÂN TỬ Ngành : Chăn nuôi Mã số : 62 01 05 Người hướng dẫn : PGS.TS Bùi Hữu Đoàn PGS TS Nguyễn Hoàng Thịnh HÀ NỘI... án: Chọn lọc nâng cao suất sinh trưởng gà Mía thị phân tử Chuyên ngành: Chăn nuôi Mã số: 62 01 05 Tên sở đào tạo: Học viện Nơng nghiệp Việt Nam Mục đích nghiên cứu: sử dụng kỹ thuật phân tử để chọn. .. 4.14 Kẽ ngón chân gà Mía có màu hồng nhạt .60 4.15 Đàn gà Mía sinh sản trưởng thành 60 4.16 Gà Mía 01 ngày tuổi 61 4.17 Đàn gà Mía 01 ngày tuổi 61 4.18 Gà Mía trống 04 tuần