Luận văn thạc sĩ HUS nghiên cứu xác định hệ protein màng trong huyết thanh của bệnh nhân mắc hội chứng mạch vành cấp

ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN - - Trần Thái Thƣợng NGHIÊN CỨU XÁC ĐỊNH HỆ PROTEIN MÀNG TRONG HUYẾT THANH CỦA BỆNH NHÂN MẮC HỘI CHỨNG MẠCH VÀNH CẤP LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC Hà Nội – 2013 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com ĐẠI HỌC QUỐC GIA HÀ NỘI TRƢỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC TỰ NHIÊN - - Trần Thái Thƣợng NGHIÊN CỨU XÁC ĐỊNH HỆ PROTEIN MÀNG TRONG HUYẾT THANH CỦA BỆNH NHÂN MẮC HỘI CHỨNG MẠCH VÀNH CẤP Chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm Mã số: 60420114 LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC NGƢỜI HƢỚNG DẪN KHOA HỌC TS Lê Thị Bích Thảo PGS TS Trịnh Hồng Thái Hà Nội – 2013 LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng Luận văn Thạc sĩ LỜI CẢM ƠN Lời đầu tiên, xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới TS Lê Thị Bích Thảo PGS TS Trịnh Hồng Thái, người thầy tận tình bảo, hướng dẫn tơi suốt trình học tập, nghiên cứu khoa học thực luận văn Tôi xin trân trọng cảm ơn thầy giáo, cô giáo Khoa Sinh học, Trường Đại học Khoa học Tự nhiên tận tình giảng dạy, dìu dắt tơi thời gian học tập Trường Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới GS TS Phan Văn Chi, toàn thể anh chị làm việc Phịng Hóa sinh Protein, Phịng thí nghiệm Trọng điểm Cơng nghệ Gen, Viện Công nghệ sinh học, Viện Hàn lâm Khoa học Cơng nghệ Việt Nam hết lịng định hướng giúp đỡ thực thành công luận văn Tôi xin chân thành cảm ơn Viện Tim mạch, Bệnh viện Bạch Mai, Hà Nội cung cấp mẫu tạo điều kiện thuận lợi cho trình thực đề tài Cuối cùng, tơi vơ biết ơn gia đình bạn bè khích lệ, động viên, giúp đỡ chỗ dựa vững cho quãng thời gian qua Luận văn thực với hỗ trợ kinh phí từ Đề tài Độc lập cấp Nhà nước số 03/2011 PTNTĐ/HĐ-ĐTĐL Hà Nội, tháng 12 năm 2013 Học viên Trần Thái Thượng MỤC LỤC DANH MỤC CÁC BẢNG iv DANH MỤC CÁC HÌNH v BẢNG KÍ HIỆU CÁC CHỮ VIẾT TẮT i MỞ ĐẦU Chƣơng - TỔNG QUAN 1.1 HUYẾT THANH K20 – Sinh học thực nghiệm –i– Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng Luận văn Thạc sĩ 1.1.1 Khái niệm huyết 1.1.2 Đặc điểm, thành phần hệ protein huyết 1.1.3 Chức protein huyết 1.1.4 Phƣơng pháp proteomics ứng dụng nghiên cứu hệ protein huyết 1.2 PROTEIN MÀNG VÀ CÁCH TIẾP CẬN PROTEOMICS TRONG NGHIÊN CỨU 12 1.2.1 Vai trò protein màng 12 1.2.2 Ứng dụng proteomics nghiên cứu protein màng 15 1.3 HỘI CHỨNG MẠCH VÀNH CẤP 17 1.3.1 Bệnh động mạch vành hội chứng mạch vành cấp 17 1.3.2 Các phƣơng pháp chẩn đoán hội chứng mạch vành cấp 18 1.4 CÁC NGHIÊN CỨU GẦN ĐÂY VỀ PROTEIN MÀNG VÀ TIM MẠCH 19 1.4.1 Những nghiên cứu giới 19 1.4.2 Những nghiên cứu Việt Nam 20 Chƣơng - NGUYÊN LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP 21 2.1 NGUYÊN LIỆU 21 2.2.1 Đối tƣợng nghiên cứu 21 2.2.2 Hóa chất 21 2.1.3 Thiết bị 22 2.2 PHƢƠNG PHÁP 22 2.2.1 Loại albumin IgG huyết “Aurum™Serum Protein Mini Kit” 23 2.2.2 Xác định hàm lƣợng protein tủa để tinh mẫu 24 2.2.3 Điện di gel polyacrylamide có SDS (SDS-PAGE) 25 2.2.4 Thủy phân protein trypsin gel 26 2.2.5 Sắc kí đa chiều phân tích khối phổ 26 2.2.6 Nhận diện protein qua phổ khối lƣợng thu đƣợc 27 2.2.7 Nhận diện phân loại protein màng huyết bệnh nhân mạch vành cấp 29 Chƣơng - KẾT QUẢ VÀ THẢO LUẬN 31 3.1 KẾT QUẢ 31 3.1.1 Loại albumin IgG huyết 31 3.1.2 Tủa protein huyết 32 3.1.3 Phân tách protein huyết SDS-PAGE 34 3.1.4 Nhận diện protein màng huyết 35 3.1.5 Phân tích liệu vị trí dƣới tế bào protein màng 40 3.1.6 Phân tích liệu chức protein màng 42 K20 – Sinh học thực nghiệm – ii – Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng Luận văn Thạc sĩ 3.1.7 Phân tích liệu q trình sinh học mà protein màng tham gia 44 3.1.8 Phân tích liệu khối lƣợng cải biến sau dịch mã protein màng 47 3.1.9 Dự đốn vùng xun màng qua chƣơng trình tin sinh học 49 3.2 THẢO LUẬN 55 TÀI LIỆU THAM KHẢO 61 PHỤ LỤC I Phụ lục Danh sách bệnh nhân I Phụ lục Danh sách protein màng nhận diện đƣợc huyết bệnh nhân ACS kết dự đoán số vùng xuyên màng III K20 – Sinh học thực nghiệm – iii – Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng Luận văn Thạc sĩ DANH MỤC CÁC BẢNG Bảng Các hóa chất đƣợc sử dụng nghiên cứu .21 Bảng Các thành phần tạo gel 25 Bảng Phân loại protein theo vị trí dƣới tế bào 40 Bảng Phân loại protein theo chức 42 Bảng Phân loại protein theo trình sinh học 45 Bảng Phân loại protein theo khối lƣợng 47 Bảng Phân loại protein theo cải biến sau dịch mã 48 Bảng Kết dự đoán vùng xuyên màng (TMD) 53 Bảng Kết dự đoán số lƣợng protein theo số vùng xuyên màng (TMD) 54 K20 – Sinh học thực nghiệm – iv – Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng Luận văn Thạc sĩ DANH MỤC CÁC HÌNH Hình Một số kiểu định vị protein màng 14 Hình Quy trình phân tích mẫu huyết 23 Hình Quy trình nhận diện protein màng từ liệu phổ khối lƣợng thu đƣợc 28 Hình Thơng số tra cứu liệu protein phần mềm Mascot 29 Hình Kết loại albumin IgG Aurum™ Serum Protein Mini Kit .32 Hình Hình ảnh điện di SDS-PAGE kết tủa protein acetone .33 Hình Hình ảnh điện di mẫu huyết bệnh nhân ACS sau tủa protein acetone 34 Hình Hình ảnh minh họa phân đoạn huyết bệnh nhân ACS đƣợc cắt gel SDS – PAGE 35 Hình Hình ảnh minh họa kết nhận diện protein phần mềm Mascot 37 Hình 10 Hình ảnh minh họa thông số protein đƣợc nhận diện phƣơng pháp khối phổ .37 Hình 11 Hình ảnh minh họa thông tin protein sở liệu UniProt 38 Hình 12 Hình ảnh minh họa kết tìm kiếm thơng tin protein từ sở liệu UniProt 38 Hình 13 Hình ảnh minh họa thơng tin chi tiết protein màng 39 Hình 14 Tỉ lệ phân bố dƣới tế bào protein màng huyết bệnh nhân mạch vành cấp 41 Hình 15 Tỉ lệ theo chức protein màng huyết bệnh nhân mạch vành cấp 43 Hình 16 Tỉ lệ tham gia vào trình sinh học protein màng huyết bệnh nhân mạch vành cấp 46 Hình 17 Tỉ lệ theo khối lƣợng protein màng huyết bệnh nhân mạch vành cấp 47 Hình 18 Tỉ lệ loại cải biến sau dịch mã protein màng huyết bệnh nhân mạch vành cấp 49 K20 – Sinh học thực nghiệm –v– Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng Luận văn Thạc sĩ Hình 19 Hình ảnh minh họa kết dự đốn vùng xuyên màng chƣơng trình TMHMM 50 Hình 20 Hình ảnh minh họa kết dự đốn vùng xuyên màng chƣơng trình SOSUI 51 Hình 21 Hình ảnh minh họa kết dự đốn vùng xun màng chƣơng trình Phobius .52 Hình 22 Hình ảnh so sánh kết dự đốn TMD chƣơng trình tin sinh học 53 Hình 23 Hình ảnh so sánh kết dự đoán số lƣợng TMD chƣơng trình tin sinh học 55 K20 – Sinh học thực nghiệm – vi – Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng Luận văn Thạc sĩ BẢNG KÍ HIỆU CÁC CHỮ VIẾT TẮT Kí hiệu Tên Tiếng Anh ACN Acetonitrile ACS Acute Coronary Syndrome Hội chứng mạch vành cấp amu Atomic mass unit Đơn vị khối lƣợng nguyên tử APS Ammonium persulfate BSA Bovine serum albumin CK Creatine kinase Da Dalton DTT Dithiothreitol ESI Electrospray Ionization FA Formic acid gi GenInfo Identifier GO Gen Ontology HBPP Human Brain Proteome Project Dự án Hệ protein Não Ngƣời H-FABP Heart-type fatty acid binding protein Protein gắn acid béo tim HLPP Human Liver Proteome Project Dự án Hệ protein Gan Ngƣời HPPP Human Plasma Proteome Project Dự án Hệ protein Huyết tƣơng Ngƣời HPLC High Performance Liquid Chromatography Sắc kí lỏng hiệu cao K20 – Sinh học thực nghiệm Tên Tiếng Việt Albumin huyết bò Đan tơn (Đơn vị khối lƣợng) Ion hóa phun điện Số định danh protein –i– Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng Luận văn Thạc sĩ HUPO Human Proteome Organization IAA Indole-3-Acetic Acid KB Knowledgebase LC Liquid Chromatography Sắc kí lỏng LNCaP Lymph Node Carcinoma of Prostate Ung thƣ biểu mô hạch tuyến tiền liệt MDLC Multidimentional Liquid Chromatography Sắc kí lỏng đa chiều MS Mass Spectrometry Phổ khối lƣợng NCBI National Center for Biotechnology Information Trung tâm Thông tin Công nghệ sinh học Quốc gia NGEP_L New Gene Expressed in Prostate Long Gene đƣợc biểu tuyến tiền liệt Nr non reducdant PIR Protein Information Resource Nguồn Thông tin Protein PSI Proteomics Standards Initiative Sáng kiến Proteomics chuẩn RP Reversed Phase Ngƣợc pha SCX Strong Cation Exchange Trao đổi cation mạnh SDS Sodium Dodecyl Sulfate SDS-PAGE SDS-Polyacrylamide Gel Electrophoresis Điện di gel polyacrylamide có SDS SIB Swiss Institute of Bioinformatics Viện Tin sinh học Thụy Sĩ TEMED Tetramethylethylenediamine TFA Trifluroacetic acid K20 – Sinh học thực nghiệm – ii – Tổ chức nghiên cứu Hệ protein Ngƣời Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng 902 903 904 905 906 907 908 909 910 911 912 913 914 915 916 917 918 919 920 921 922 923 Luận văn Thạc sĩ Ataxin-2-like protein Stabilin-2 Sodium-dependent high-affinity dicarboxylate transporter T-complex 11 isoform ATP-binding cassette sub-family A member 10 ATP-binding cassette A5 Secretogranin III RecName: Full=G-protein coupled receptor 98; AltName: Full=Monogenic audiogenic seizure susceptibility protein homolog; AltName: Full=Very large G-protein NUANCE-N-33 Junctophilin type3 KIAA0902 protein RecName: Full=Mucin-16; Short=MUC-16; AltName: Full=Ovarian carcinoma antigen CA125; AltName: Full= Contactin associated protein-like HSSH-1L Transcription factor ELYS Roundabout homolog 4, magic roundabout RAPGEF4 protein Hydrogen/potassium-exchanging ATPase 4A [Xenopus laevis] KIAA0233 Lipin KIAA0209 Nucleoporin 205kDa K20 – Sinh học thực nghiệm – XLIV – Q8WWM7 Q8WWQ8 Q8WWT9 Q8WWU5 Q8WWZ4 Q8WWZ7 Q8WXD2 11 14 16 1 11 15 16 0 11 14 14 Q8WXG9 28 7 Q8WXH0 Q8WXH2 Q8WXI2 1 0 Q8WXI7 30 1 Q8WYK1 Q8WYL5 Q8WYP5 Q8WZ75 Q8WZA2 Q92126 Q92508 Q92539 Q92608 Q92621 16 20 15 0 32 0 1 0 1 39 0 1 0 0 31 0 Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng 924 925 926 927 928 929 930 931 932 933 934 935 936 937 938 939 940 941 942 943 944 945 946 947 Luận văn Thạc sĩ Ryanodine receptor Symplekin Golgin 97 NrCAM protein Signaling inositol polyphosphate phosphatase SIP-110 Neogenin RecName: Full=Amyloid beta A4 precursor protein-binding family B member 2; AltName: Full=Fe65-like Multidrug resistance protein (MRP2) Sub1.5 Golgi membrane sialoglycoprotein MG160 KIAA0387 Glutaryl-Coenzyme A dehydrogenase isoform b precursor KIAA0651 protein Sarco-/endoplasmic reticulum Ca-ATPase NKD2 protein RELT tumor necrosis factor receptor precursor SLC25A28 protein Mitogen inducible gene mig-2 SH3-domain kinase binding protein Serum/glucocorticoid regulated kinase isoform Interleukin-1 receptor-associated kinase Rhomboid homolog (Drosophila) Optineurin RASD family, member K20 – Sinh học thực nghiệm – XLV – Q92736 Q92797 Q92805 Q92823 Q92835 Q92859 30 12 7 0 2 0 1 0 1 Q92870 0 Q92887 Q92888 Q92896 Q92932 Q92947 Q92974 Q93084 Q969F2 Q969Z4 Q96A46 Q96AC1 Q96B97 Q96BR1 Q96C06 Q96CC6 Q96CV9 Q96D21 6 2 22 2 4 2 13 2 0 0 0 0 16 1 0 0 0 0 14 0 0 0 0 Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng 948 949 950 951 952 953 954 955 956 957 958 959 960 961 962 963 964 965 966 967 968 969 Luận văn Thạc sĩ RecName: Full=Protein FAM55B RAB3C, member RAS oncogene family Interleukin 17 receptor A Bicaudal D homolog isoform SRECRP-1 ERO1-like ATP-binding cassette transporter MRP8 Membrane glycoprotein LRIG1 Component of golgi transport complex Unnamed protein product Dachsous precursor G protein-coupled receptor 128 CLPTM1L protein SLC6A2 RecName: Full=Apoptosis-stimulating of p53 protein 1; AltName: Full=Protein phosphatase regulatory subunit 13B Potassium voltage-gated channel subfamily H member (Voltagegated potassium channel subunit Kv12 Potassium voltage-gated channel subfamily H member (Voltagegated potassium channel subunit Kv12 Kinesin-like motor protein C20orf23 Janus kinase and microtubule interacting protein isoform Leucine rich repeat containing KIAA0782 protein RecName: Full=Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoform K20 – Sinh học thực nghiệm – XLVI – Q96DL1 Q96E17 Q96F46 Q96G01 Q96GP6 Q96HE7 Q96J66 Q96JA1 Q96JB2 Q96JI7 Q96JQ0 Q96K78 Q96KA5 Q96KH8 15 12 13 1 11 12 0 11 0 12 Q96KQ4 0 Q96L42 Q96L42 26 Q96L93 Q96N16 Q96NW7 Q96P48 Q96PK2 5 0 0 0 0 0 0 0 Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng 970 971 972 973 974 975 976 977 978 979 980 981 982 983 984 985 986 987 988 989 990 991 992 993 Luận văn Thạc sĩ Soluble adenylyl cyclase CUB and sushi multiple domains protein Anion exchanger AE4 Solute carrier family (sodium/calcium exchanger), member isoform B precursor Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member Protocadherin 15 isoform CD1-4 precursor Bardet-Biedl syndrome type Anion transporter/exchanger-8 ERBB2 interacting protein isoform CTAGE-2 Pecanex-like protein Hemicentin Pex1pQ261Ter C4 complement C4d region, partial Glutamate receptor Protein phosphatase regulatory inhibitor subunit 16B La binding protein Notch4 Sphingosine-1-phosphate receptor Unnamed protein product RecName: Full=Plakophilin-4; AltName: Full=p0071 ATP-binding cassette, sub-family A member Put DNA binding protein Tpr K20 – Sinh học thực nghiệm – XLVII – Q96PN6 Q96PZ7 Q96Q91 6 11 11 2 11 Q96QG1 11 10 11 Q96QT4 Q96QU1 Q96RK4 Q96RN1 Q96RT1 Q96RT6 Q96RV3 Q96RW7 Q96S69 Q96SA8 Q96SC0 Q96T49 Q96T51 Q99466 Q99500 Q99550 Q99569 Q99758 Q99941 Q99968 12 11 13 30 1 10 17 12 0 13 0 0 0 13 12 15 0 0 0 0 12 11 10 0 0 0 0 11 0 Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng 994 995 996 997 998 999 1000 1001 1002 1003 1004 1005 1006 1007 1008 1009 1010 1011 1012 1013 Luận văn Thạc sĩ NIPSNAP1 protein SYT3 protein Hypothetical protein Apoptosis-inducing factor Trichoplein Ret proto-oncogene U5 snRNP 100 kD protein Unnamed protein product Katanin p80 subunit B KIFC3 protein PHD finger protein 20 Myosin, heavy polypeptide 10, non-muscle RecName: Full=Fanconi anemia group J protein; Short=Protein FACJ; AltName: Full=ATP-dependent RNA helicase BRIP1; AltName: Full=BRCA1-associated C-terminal helicase 1; AltName: Full=BRCA1-interacting protein C-terminal helicase 1; Short=BRCA1-intera SH3P12 protein Truncated transient receptor potential cation channel subfamily M member variant a Plasmalemma vesicle associated protein RAB11 family interacting protein (class I) Caspase recruitment domain protein 14 isoform Caspase recruitment domain protein 11 RecName: Full=Periaxin K20 – Sinh học thực nghiệm – XLVIII – Q9BPW8 Q9BQG1 Q9BQS8 Q9BRQ8 Q9BT92 Q9BTB0 Q9BUQ8 Q9BV35 Q9BVA0 Q9BVG8 Q9BVI0 Q9BWG0 2 13 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 Q9BX63 0 Q9BX66 0 Q9BX84 Q9BX97 Q9BXF6 Q9BXL6 Q9BXL7 Q9BXM0 0 0 0 0 0 0 Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng 1014 1015 1016 1017 1018 1019 1020 1021 1022 1023 1024 1025 1026 1027 1028 1029 1030 1031 1032 1033 1034 1035 1036 Luận văn Thạc sĩ OSBP-related protein 1; ORP1 Chain A, Crystal Structure Of Human Pacsin F-Bar Domain SNF7-1 Neurolysin KIAA1058 protein KIAA1457 protein Cell recognition molecule CASPR3 ABC transporter ABCA2 OSBP-related protein isoform Uveal autoantigen with coiled-coil domains and ankyrin repeats isoform SNAP-25-interacting protein UDP-GlcNAc:betaGal beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase Meltrin-beta/ADAM 19 homologue Integrator complex subunit WW domain containing E3 ubiquitin protein ligase Cadherin 19, type preproprotein Kinesin-like protein RBKIN1 FYVE-finger-containing Rab5 effector protein rabenosyn-5 variant Mitochondrial carrier triple repeat Tetraspanin 10 RecName: Full=Cadherin-23; AltName: Full=Otocadherin; Flags: Precursor Spectrin, beta, non-erythrocytic isoform sigma1 ARV1 homolog (S cerevisiae) K20 – Sinh học thực nghiệm – XLIX – Q9BXW6 Q9BY11 Q9BY43 Q9BYT8 Q9BZ29 Q9BZ72 Q9BZ76 Q9BZC7 Q9BZF3 10 0 0 0 14 0 0 0 14 0 0 0 12 Q9BZF9 16 0 Q9C0H9 Q9C0J1 Q9H013 Q9H0H0 Q9H0M0 Q9H159 Q9H1H9 Q9H1K0 Q9H1U9 Q9H1Z9 14 2 2 0 0 1 0 0 0 0 Q9H251 1 Q9H254 Q9H2C2 4 Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng 1037 1038 1039 1040 1041 1042 1043 1044 1045 1046 1047 1048 1049 1050 1051 1052 1053 1054 1055 1056 1057 1058 1059 Luận văn Thạc sĩ Neuropilin-2b(5) Sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A Leucine zipper nuclear factor Solute carrier family 6, member 15 isoform Tankyrase, TRF1-interacting ankyrin-related ADP-ribose polymerase A disintegrin and metalloproteinase Zinc finger protein 106 homolog Pinin EHM2 Glycoprotein beta-Gal 3'-sulfotransferase Protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 23 RecName: Full=Semaphorin-6C; AltName: Full=Semaphorin-Y; Short=Sema Y; Flags: Precursor Arginyl aminopeptidase IRF4-binding protein Secreted modular calcium-binding protein isoform Oxysterol-binding protein-like protein isoform c PLEKHA4 protein Membrane glycoprotein gp140; CDCP1; SIMA135 MTHFD2L protein UDP glycosyltransferase family, polypeptide A7 precursor UDP glycosyltransferase family, polypeptide A10 precursor UDP glycosyltransferase family, polypeptide A8 precursor Pleckstrin homology domain containing, family A (phosphoinositide K20 – Sinh học thực nghiệm –L– Q9H2E3 1 Q9H2E6 1 Q9H2G9 Q9H2J7 Q9H2K2 Q9H2U9 Q9H2Y7 Q9H307 Q9H329 Q9H3Q3 Q9H3S7 2 10 18 13 11 0 0 12 0 0 0 12 0 Q9H3T2 2 Q9H4A4 Q9H4E7 Q9H4F8 Q9H4L5 Q9H4M7 Q9H5V8 Q9H903 Q9HAW7 Q9HAW8 Q9HAW9 Q9HB21 4 2 2 0 0 2 0 0 0 1 1 0 0 0 1 1 Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng 1060 1061 1062 1063 1064 1065 1066 1067 1068 1069 1070 1071 1072 1073 1074 1075 1076 1077 1078 1079 1080 Luận văn Thạc sĩ binding specific) member [Homo Transient receptor potential cation channel, subfamily V, member isoform b Solute carrier family 38, member 10 isoform b Otoferlin isoform a ATP-binding cassette, sub-family A, member isoform b Protocadherin isoform precursor Long transient receptor potential channel Synaptotagmin-like isoform c Roundabout, axon guidance receptor, homolog isoform ROBO2b Erythrocyte membrane protein band 4.1 like Cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor CGI-152 protein Myosin X X-linked interleukin-1 receptor accessory protein-like Intracellular membrane-associated calcium-independent phospholipase A2 gamma Protocadherin-12 precursor Immunoglobulin heavy chain variant Serine protease inhibitor Kazal type Phospholipase C beta RecName: Full=Anoctamin-2; AltName: Full=Transmembrane protein 16B Nogo-A protein short form Poliovirus receptor-related K20 – Sinh học thực nghiệm – LI – Q9HBA0 6 Q9HBR0 Q9HC10 Q9HC28 Q9HC56 Q9HCF6 Q9HCH5 Q9HCK4 Q9HCM4 Q9HCU4 Q9HD20 Q9HD67 Q9NP60 21 11 3 15 14 11 14 11 10 13 7 12 12 7 Q9NP80 Q9NPG4 Q9NPP6 Q9NQ38 Q9NQ66 11 14 14 1 0 0 Q9NQ90 8 Q9NQC3 Q9NQS3 2 Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng 1081 1082 1083 1084 1085 1086 1087 1088 1089 1090 1091 1092 1093 1094 1095 1096 1097 1098 Luận văn Thạc sĩ RecName: Full=Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3; Short=CNG channel beta-3; Short=Cyclic nucleotide-gated channel beta-3; AltName: Full=Cone photo RecName: Full=Baculoviral IAP repeat-containing protein 6; AltName: Full=Ubiquitin-conjugating BIR RecName: Full=Scavenger receptor cysteine-rich type protein M160; AltName: Full=CD163 antigen-like Mannosyl-oligosaccharide 1,2-alpha-mannosidase IC APC-stimulated guanine nucleotide exchange factor Carbohydrate sulfotransferase 12 RecName: Full=Spectrin beta chain, brain 4; AltName: Full=Spectrin, non-erythroid beta chain 4; AltName: Full=Beta-V spectrin; AltName: Full=BSPECV NADH/NADPH thyroid oxidase p138-tox Dual oxidase precursor Zinedin Vacuolar protein sorting Alpha1A-voltage-dependent calcium channel Receptor for egg jelly-like protein precursor RecName: Full=Probable phospholipid-transporting ATPase IB; AltName: Full=ATPase class I type 8A member 2; AltName: Full=ML-1 RecName: Full=Semaphorin-4G; Flags: Precursor Exocyst complex component isoform Transmembrane protein 30A isoform Phosphoprotein associated with glycosphingolipid microdomains K20 – Sinh học thực nghiệm – LII – Q9NQW8 4 Q9NR09 30 0 Q9NR16 2 Q9NR34 Q9NR80 Q9NRB3 1 1 1 Q9NRC6 30 0 Q9NRD8 Q9NRD9 Q9NRL3 Q9NRW7 Q9NS88 Q9NTG1 16 0 24 13 7 0 23 11 6 0 17 13 Q9NTI2 10 Q9NTN9 Q9NV70 Q9NV96 Q9NWQ8 3 2 1 1 Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng 1099 1100 1101 1102 1103 1104 1105 1106 1107 1108 1109 1110 1111 1112 1113 1114 1115 1116 1117 1118 Luận văn Thạc sĩ RecName: Full=Testis-expressed sequence 10 protein Unnamed protein product RecName: Full=SID1 transmembrane family member 1; Flags: Precursor Stabilin-1 Dipeptidyl-peptidase Toll-like receptor Cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor RecName: Full=Cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 3; AltName: Full=Flamingo homolog 1; Shor RecName: Full=Protocadherin Fat 2; Short=hFat2; AltName: Full=Multiple epidermal growth factor-like Pleckstrin Formin variant RecName: Full=Eukaryotic translation initiation factor 2-alpha kinase 3; AltName: Full=PRKR-like endoplasmic reticulum kinase; AltName: Full=Pancreatic eIF2-alpha kinase; Short=HsPEK; Flags: Precursor Myoferlin isoform a Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member Low density lipoprotein-related protein 1B precursor Brain protein KIAA1529 protein Phospholipase C, epsilon RecName: Full=Contactin-3; AltName: Full=Brain-derived immunoglobulin superfamily protein 1; Short= RecName: Full=Probable phospholipid-transporting ATPase VD; K20 – Sinh học thực nghiệm – LIII – Q9NXF1 Q9NXG0 13 0 Q9NXL6 11 11 11 Q9NY15 Q9NY33 Q9NYK1 Q9NYQ6 18 7 Q9NYQ7 12 Q9NYQ8 30 1 Q9NYT0 Q9NZ56 0 0 0 Q9NZJ5 1 Q9NZM1 Q9NZQ8 Q9NZR2 Q9P0K9 Q9P1Z9 Q9P212 28 6 2 1 1 1 Q9P232 1 Q9P241 10 11 11 Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng 1119 1120 1121 1122 1123 1124 1125 1126 1127 1128 1129 1130 1131 1132 1133 1134 1135 1136 1137 1138 1139 1140 1141 Luận văn Thạc sĩ Short=ATPVD; AltName: Full=ATPase class SEMA5B KIAA1417 protein ES/130 Immunoglobulin superfamily, member isoform b KIAA1255 protein Neurexin isoform alpha-1 precursor Epidermal growth factor receptor pathway substrate 15-like Brush border myosin-I Xenotropic and polytropic retrovirus receptor isoform Spastin isoform Gamma-aminobutyric acid (GABA) B receptor isoform c precursor Membrane protein CH1 X104 Klotho Macrophage receptor Calcium channel flower homolog isoform a Amiloride-sensitive cation channel isoform c TANK-binding kinase Transmembrane protein isoform a Leucyl/cystinyl aminopeptidase isoform NOV/plexin-A1 protein Cadherin 22 precursor Aralar2 K20 – Sinh học thực nghiệm – LIV – Q9P283 Q9P2D0 Q9P2E9 Q9P2J2 Q9P2R3 Q9P2S2 Q9UBC2 Q9UBC5 Q9UBH6 Q9UBP0 Q9UBS5 Q9UBS9 Q9UDY2 Q9UEF7 Q9UEW3 Q9UGQ2 Q9UHC3 Q9UHD2 Q9UHN6 Q9UIQ6 Q9UIW2 Q9UJ99 Q9UJS0 10 5 12 0 0 7 2 1 2 1 1 0 1 1 1 1 1 0 1 0 1 Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng 1142 1143 1144 1145 1146 1147 1148 1149 1150 1151 1152 1153 1154 1155 1156 1157 1158 1159 1160 1161 1162 1163 Luận văn Thạc sĩ RecName: Full=N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-Nacetylglucosaminidase; AltName: Full=Pho TRHDE Tenascin-M1 Transient receptor potential cation channel, subfamily C, member KIAA1288 protein Solute carrier family 39 (zinc transporter), member 10 KIAA1254 protein KIAA1250 protein KIAA1249 protein RecName: Full=Transmembrane and coiled-coil domains protein Hypothetical protein RecName: Full=Myosin-Vb RecName: Full=Neurogenic locus notch homolog protein 3; Short=Notch 3; Contains: RecName: Full=Notch extracellular truncation; Contains: RecName: Full=Notc Anaplastic lymphoma kinase Ki-1 variant Autoantigen Protocadherin 43 GM3 synthase; ST-I sialyltransferase; ST3Gal V Transferrin receptor protein isoform Component of oligomeric golgi complex Trabeculin-alpha Phospholipase C-like isoform b Exocyst complex component isoform K20 – Sinh học thực nghiệm – LV – Q9UK23 1 Q9UKU6 Q9UKZ4 Q9UL62 Q9ULD2 Q9ULF5 Q9ULG6 Q9ULH0 Q9ULH1 Q9ULS5 Q9ULU8 Q9ULV0 3 12 6 1 0 1 0 1 7 0 Q9UM47 Q9UM73 Q9UMD9 Q9UN70 Q9UNP4 Q9UP52 Q9UP83 Q9UPN3 Q9UPN4 Q9UPT5 1 27 14 2 1 0 0 1 1 0 0 1 1 0 0 Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng 1164 1165 1166 1167 1168 1169 1170 1171 1172 1173 1174 1175 1176 1177 1178 1179 1180 1181 1182 Luận văn Thạc sĩ Similar to sperm specifc protein RecName: Full=SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2; Short=Shank2; AltName: Full=Cortac RecName: Full=Regulating synaptic membrane exocytosis protein 2; AltName: Full=Rab3-interacting molecule 2; Short=RIM Mannosyl (alpha-1,3-)-glycoprotein beta-1,4-Nacetylglucosaminyltransferase, isoenzyme B SPG7 protein Multidrug resistance protein Voltage-gated sodium channel alpha subunit Structural maintenance of chromosomes Leucine zipper, putative tumor suppressor Myelin gene regulatory factor isoform Fibronectin type III domain containing 3A isoform KIAA0973 protein RecName: Full=FYVE finger-containing phosphoinositide kinase; AltName: Full=PIKfyve; AltName: Full= RecName: Full=Axin-2; AltName: Full=Axis inhibition protein 2; AltName: Full=Conductin; AltName: Fu LEM domain containing DNb-5 Hyperpolarization activated cyclic nucleotide-gated potassium channel ADAM metallopeptidase domain 18 preproprotein RecName: Full=Glutamate receptor-interacting protein 1; Short=GRIP1 protein K20 – Sinh học thực nghiệm – LVI – Q9UPT6 0 Q9UPX8 10 0 Q9UQ26 12 0 Q9UQ53 1 Q9UQ90 Q9UQ98 Q9UQD0 Q9UQE7 Q9Y250 Q9Y2G1 Q9Y2H6 Q9Y2H9 2 2 13 17 22 0 1 16 22 0 1 16 19 0 Q9Y2I7 29 0 Q9Y2T1 0 Q9Y2U8 Q9Y2W3 11 12 12 Q9Y3Q4 Q9Y3Q7 1 Q9Y3R0 0 Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng 1183 1184 1185 1186 1187 1188 1189 1190 1191 1192 1193 1194 1195 1196 1197 1198 1199 1200 1201 1202 1203 1204 Luận văn Thạc sĩ Hypothetical protein RecName: Full=Serine/threonine-protein kinase WNK2; AltName: Full=Protein kinase with no lysine 2; Talin Zonadhesin isoform Dishevelled-associated activator of morphogenesis RecName: Full=Plexin-D1; Flags: Precursor KIAA0614 protein FERM, RhoGEF, and pleckstrin domain protein isoform Talin Insulin receptor substrate Unnamed protein product RecName: Full=SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 1; Short=Shank1; AltName: Full=Somatostatin receptor-interacting protein; Short=SSTR-interactin Protocadherin beta 15 Protocadherin gamma subfamily C, isoform precursor Protocadherin gamma subfamily B, isoform precursor Protocadherin gamma subfamily A, isoform precursor Protocadherin gamma subfamily A, isoform precursor Protocadherin gamma subfamily A, 11 isoform precursor Protocadherin alpha isoform precursor KIAA1124 protein Heparan sulfate D-glucosaminyl 3-O-sulfotransferase 3B1 Dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferase isoform K20 – Sinh học thực nghiệm – LVII – Q9Y3R5 2 Q9Y3S1 10 0 Q9Y490 Q9Y493 Q9Y4D1 Q9Y4D7 Q9Y4D8 Q9Y4F1 Q9Y4G6 Q9Y4H2 Q9Y512 12 10 2 0 0 0 1 0 0 1 0 0 Q9Y566 14 0 Q9Y5E8 Q9Y5F6 Q9Y5F8 Q9Y5G6 Q9Y5G8 Q9Y5H2 Q9Y5H8 Q9Y5S2 Q9Y662 Q9Y673 3 2 16 2 2 2 0 1 1 1 1 1 1 1 0 1 Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com Trần Thái Thượng 1205 1206 1207 1208 1209 1210 1211 1212 1213 1214 1215 1216 Luận văn Thạc sĩ Patched Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2'-5'oligoadenylate synthetase Liver specific transporter Sodium bicarbonate cotransporter2 RecName: Full=Laminin subunit gamma-3; AltName: Full=Laminin 12 gamma subunit; Flags: Precursor Roundabout isoform a Cadherin-10 RecName: Full=Protein piccolo; AltName: Full=Aczonin Myosin heavy chain Myr Zinc fingers and homeoboxes Q9Y6C5 Q9Y6D5 Q9Y6D6 Q9Y6K5 Q9Y6L6 Q9Y6M7 12 13 0 11 10 13 0 12 11 11 0 11 11 Q9Y6N6 0 Q9Y6N7 Q9Y6N8 Q9Y6V0 Q9Y6X6 Q9Y6X8 27 2 0 1 0 0 0 *Ghi chú: n – Số mẫu mà protein xuất N – Tổng số mẫu nghiên cứu (N=30) K20 – Sinh học thực nghiệm – LVIII – Trường ĐHKHTN, ĐHQGHN LUAN VAN CHAT LUONG download : add luanvanchat@agmail.com ... Trần Thái Thƣợng NGHIÊN CỨU XÁC ĐỊNH HỆ PROTEIN MÀNG TRONG HUYẾT THANH CỦA BỆNH NHÂN MẮC HỘI CHỨNG MẠCH VÀNH CẤP Chuyên ngành: Sinh học thực nghiệm Mã số: 60420114 LUẬN VĂN THẠC SĨ KHOA HỌC NGƢỜI... Vai trò protein màng 12 1.2.2 Ứng dụng proteomics nghiên cứu protein màng 15 1.3 HỘI CHỨNG MẠCH VÀNH CẤP 17 1.3.1 Bệnh động mạch vành hội chứng mạch vành cấp ... Thượng Luận văn Thạc sĩ Chƣơng - NGUYÊN LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP 2.1 NGUYÊN LIỆU 2.2.1 Đối tƣợng nghiên cứu Mẫu nghiên cứu huyết 30 bệnh nhân mắc hội chứng mạch vành cấp đƣợc cung cấp từ Viện Tim mạch