Ứng dụng tin học trong công nghệ sinh học

3/6/2011 B tảí kh i hồn tồn ngẫu nhiên – Randomized Complete Block Design (RCBD) Kh i Hoàn Toàn Ngẫu Nhiên Randomized Complete Block Design (RCBD) RCBD  Trong RCBD, đơn v thí nghiệm đ ợc tậạ hợạ thành kh i cho: - Các đơn v thí nghiệm kh i có tính chất đồng v i so v i tổng thể - S đơn v thí nghiệm kh i = s nghiệm thức (mỗi kh i có đầy đ tất c nghiệm thức)  Các nghiệm thức đ ợc b trí ngẫu nhiên vào đơn v thí nghiệm kh i  Đặc điểm: nghiệm thức đ ợc b trí m t điều kiện hoàn c nh lậạ l i m t điều kiện hoàn c nh khác  S kh i = s lần lặạ l i RCBD Chú ý Kỹ thuật bố trí khối:  Mục đích chủ yếu khối làm giảm sai số thí nghiệm cách loại trừ biến động nguồn biến động biết đơn vị thí nghiệm  Nhóm đơn vị thí nghiệm vào khối, biến động khối giảm thiểu biến động khối tăng lên Chỉ có biến động khối gây sai số thí nghiệm lớn Sự lặp lại khối hiệu diện tích thí nghiệm có biến động ước đoán trước RCBD Độ tự sai số: (t-1) x (r-1)  12 Trong đó: t : nghiệm thức r : lần lặp lại Bước 1: Phân diện tích thí nghiệm làm r khối giống nhau, r số lần lặp lại, sau thực kỹ thuật khối mô tả Chọn ngẫu nhiên bố trí thí nghiệm RCBD Trong ví dụ trên, diện tích thí nghiệm chia làm khối Giả thuyết có hướng biến động dọc theo chiều dài khu vực thí nghiệm, dạng khối thiết kế dạng chữ nhật vng góc với hướng biến động Hướng biến động (chỉ theo hướng) Việc chọn ngẫu nhiên RCBD áp dụng riêng lẻ độc lập cho khối TD: Thí nghiệm đồng với nghiệm thức A, B, C, D E, F lần lặp lại Khối I RCBD Khối II Khối III RCBD Khối IV 3/6/2011 Bước 2: Chia nhỏ khối làm t lơ thí nghiệm (t số nghiệm thức) bố trí t nghiệm thức ngẫu nhiên vào t lơ theo phương pháp bố trí ngẫu nhiên mơ tả phần CRD Trong ví dụ này, khối I chia nhỏ làm lơ có kích thước đánh dấu lơ từ xuống từ trái sang phải, bố trí nghiệm thức ngẫu nhiên vào lô Rồi thực cho khối C E A C F A E B D E D B D C A F A B F E C D B Khối III Khối IV Khối I Khối II Loại đầu đo (nghiệm thức) A B C D 9.3 9.4 9.2 9.7 9.4 9.3 Phân tích variance (ANOVA) Có nguồn biến động kiểu bố trí RCBD nghiệm thức, lặp lại (hay khối) sai số nghiệm thức Chú ý kiểu bố trí RCBD nhiều kiểu bố trí CRD nguồn biến động thể biến động khối Ví d : Phân tích đ cứng c a s n ạhẩm (N) ứng v i lo i đầu đo t i v trí khác bánh (cho Ftra = 3,86):  F RCBD Vị trí đo (khối)  9.4 CốC B 9.9 9.8 9.5 10.0 10.0 9.9 9.7 10.2 C PHÂN TÍCH B c 1: Nhóm s liệu theo nghiệm thức lặạ l i Tính tổng Ti c a nghiệm thức, tổng Ri c a lần lặạ l i, tổng toàn b G giá tả trung bình c a nghiệm thức Vị trí đo (khối) A B C D 9.3 9.4 9.2 9.7 9.4 9.3 9.4 9.6 9.9 9.8 9.5 10.0 10.0 9.9 9.7 10.2 9.6 RCBD Loại đầu đo (nghiệm thức) Tổng Ri Tổng Ti Trung bình XTi Tổng chung G Trung bình chung RCBD CốC B B Nguồn biến thiên RCBD CốC B C PHÂN TÍCH c 2: Đ a b ng phân tích ạh ơng sai Đ tự (df) Tổng bình Trung bình bình ạh ơng ạh ơng (MS) (SS) F tính B 10 C PHÂN TÍCH c 3: Tính bậc tự (df) + Đ tự tổng c ng (dfT0) = r x t - F tra b ng + Đ tự nghiệm thức (dfT) = t - + Đ tự lặạ l i (dfR) = ả - Lặạ l i (R) + Đ tự sai s (dfE) = (ả - 1) x (t - 1) Nghiệm thức (T) Đ tự sai s đ ợc tính: Sai s (E) dfE = dfT0 - dfT - dfR Tổng c ng (T0) RCBD 11 RCBD 12 3/6/2011 CốC B C PHÂN TÍCH CốC B B c 4: Tính s hiệu ch nh (CF) lo i tổng bình ạh ơng (SS) CF  SSR   G2 r t r i 1 SST0   x  CF MST  Ri2  CF t SST dfT SSR MSR  dfR SSE MSE  dfE SSE  SST0  SST  SSR n i 1 C PHÂN TÍCH B c 5: Tính trung bình bình ạh ơng (MS) cho nguồn biến đ ng ij SST   Ti  CF i 1 r t 13 RCBD CốC B C PHÂN TÍCH CốC B B c 6: Tính tả s Fnghiệm thức để kiểm tra mức ý nghĩa khác công thức FT  B 14 RCBD C PHÂN TÍCH Bước 8: Điền giá trị tính vào bảng phân tích phương sai Nguồn biến thiên MST MSE Đ tự (df) Tổng bình Trung bình bình ạh ơng ạh ơng (MS) (SS) F tính F tra b ng Lặạ l i (R) Nghiệm thức (T) c 7: Tìm giá tả F(α,dfT, dfE) b ng F Sai s (E) Tổng c ng (T0) RCBD CốC B 15 C PHÂN TÍCH RCBD CốC B B c 9: So sánh giá tả FT v i F tra b ng mức ý nghĩa khác - Nếu FT>Fα,dfT,dfE có khác biệt nghiệm thức thí nghiệm ( mức ý nghĩa α) C PHÂN TÍCH B c 10: Tính trung bình tồn b hệ s biến đ ng CV% X G n CV %  RCBD 17 16 MSE x100% X RCBD 18 3/6/2011 CV% ch đ xác so sánh nghiệm thức m t giá tả ch tin cậy c a thí nghiệm Nó biểu th sai s thí nghiệm thơng qua ạhần tảăm c a trung bình, vậy, giá tả CV cao thí nghiệm có giá tả tin cậy CV% biến đ ng tuỳ theo lo i thí nghiệm, lo i tảồng, đặc tính ghi nhận XốC Đ NH NH H Tính Fkhối để kiểm tra khác khối: FR  Giá tả CV% chấạ nhận đ ợc v i: - thí nghiệm phịng - thí nghiệm chậu, v i, nhà l - suất lúa ≤ 1% i 6- 8% - thí nghiệm phân bón 10- 12% 13- 15% 13- 15% RCBD 19 NG C A KH I RCBD XốC Đ NH NH H 20 NG C A KH I - Nếu RE <  Bố trí thí nghiệm theo kiểu RCBD không hiệu - Nếu RE >  Hiệu phương pháp bố trí thí nghiệm theo kiểu RCBD tăng lên so với CRD (RE – 1).100% Khi bố trí khối tạo khác lớn khối  Xác định ý nghĩa việc làm giảm sai số thí nghiệm nhờ q trình lập khối thơng qua việc tính giá trị RE (relative efficiency) RE  MSR MSE Nếu FR>Fα,dfR,dfE có khác biệt khối thí nghiệm (ở mức ý nghĩa α) ≤ 5% - thí nghiệm thu c tảừ sâu - thí nghiệm thu c tảừ c XốC Đ NH NH H NG C A KH I (r  1).MSR  r (t  1).MSE (r t  1).MSE Nếu dfE