Báo cáo khoa học: Polysaccharide binding sites in hyaluronate lyase – crystal structures of native phage–encoded hyaluronate lyase and its complexes with ascorbic acid and lactose docx

... 339 2–3 402 ª 2009 The Authors Journal compilation ª 2009 FEBS Polysaccharide binding sites in hyaluronate lyase – crystal structures of native phage–encoded hyaluronate lyase and its complexes with ... respectively. The crystal structures of native HylP2 and its two complexes with ascorbic acid and lactose have been determined. HylP2folds into four distinct domains with a central core consisting of 16 ... side chains of Glu167 and Lys179 upon binding to ascorbic acid are shown by superimposing their binding regions of native structure (cyan) and that of complexed structure with ascorbic acid (yellow)...

Báo cáo khoa học: Carbohydrate binding sites in Candida albicans exo-b-1,3-glucanase and the role of the Phe-Phe ‘clamp’ at the active site entrance ppt

... of the protein).DiscussionExamination of the previously determined crystal structures of native and inhibited forms of Exg fromC. albicans revealed that this enzyme recruits the sameset of ... atlas of surfacetopography of proteins with structural and topographi-cal mapping of functionally annotated residues. NucleicAcids Res 34, W116–W118.W. M. Patrick et al. Carbohydrate binding sites ... themutant Exg proteins was induced in 50-mL cultures of min-imal medium [39] containing 1% (w ⁄ v) casamino acids and buffered to pH 6.0 with 100 mm potassium phosphate. Cul-tures were inoculated to...

Báo cáo khoa học: Autoregulatory binding sites in the zebraﬁsh six3a promoter region deﬁne a new recognition sequence for Six3 proteins potx

... DNA- binding properties of murine Six3, in vitro binding siteselection demonstrated high-afﬁnity binding tosequences containing the TAAT core motif, and clus-ters of these tetranucleotide sites ... 60 amino acid HD, which is a DNA -binding domain, has a conservedglobal fold consisting of three a-helices and a ﬂexibleN-terminal arm that becomes more ordered uponDNA binding [ 3–6 ]. Binding ... compared this with a previously reportedSix3 -binding sequence (TGATAC), we observed simi-lar binding afﬁnity, suggesting that the Six3 HD hasseveral binding modes with distinct DNA -binding speciﬁcities.Using...

Tài liệu Báo cáo khoa học: The unique sites in SulA protein preferentially cleaved by ATP-dependent Lon protease from Escherichia coli ppt

... peptidefragments obtained after 3 or 30 min of incubation in thepresence of ATP and after 3 h of incubation in the absence of ATP w ere also analyze d in the same way. The yields of the fragments ... y amino -acid analyses. Theresults are shown in Fig. 4. Twenty-seven cleavage sites wereidenti®ed with the sample incubated for 30 min in thepresence of ATP. During incubation for 3 min in t ... corresponding to that in Fig. 3.The numbers in parenthesis indicate the esti-mated percentage yields of each peptid e after3-min, 30-min, and 3-h incubations in thepresence of ATP and 3-h incubation...

Báo cáo khoa học: Starch-binding domains in the CBM45 family – low-afﬁnity domains from glucan, water dikinase and a-amylase involved in plastidial starch metabolism pptx

... 2011)doi:10.1111/j.1742-4658.2011.08043.xStarch -binding domains are noncatalytic carbohydrate -binding modulesthat mediate binding to granular starch. The starch -binding domains fromthe carbohydrate -binding module family ... b-cyclodextrin injection, and thebottom panel depicts the binding isotherm; open circles representthe integrated binding heat of the data in the top panel, and the fullline is the ﬁt of a one-site binding ... starch -binding ability of AtAMY3 in vitro. It cannot be precludedthat some binding may involve secondary binding sites in the catalytic domain, but the demonstrated starch- binding ability of different...

Tài liệu Báo cáo khoa học: An alternative isomerohydrolase in the retinal Muller cells of a cone-dominant species doc

... RPE65c was incubated with liposomes con-taining atRE (A), liposomes containing atRE in the presence of 1mM bipyridine (B) and liposomes containing atRE, in the presence of 1 mM bipyridine and 6 ... magniﬁcationimages of the boxed area in (B4) showing RPE65c staining (B5), GS staining (B6), merged RPE65c and GS staining (B7), and DAPI staining(B8), respectively. White arrows indicate overlapped signals in ... (green) and GS (Mu¨ller cell marker, red). (B 1–4 ) The images show immunostaining of RPE65c (B1), GS(B2), merged RPE65c and GS staining (B3), and 4¢,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) staining (B4),...

Tài liệu Báo cáo khoa học: Integral membrane proteins in the mitochondrial outer membrane of Saccharomyces cerevisiae docx

... identiﬁedno other inner membrane proteins in our vesicle pre-paration, we suggest that Gut2 is an outer membraneprotein with its N-terminal FAD -binding domainfacing the intermembrane space. ... reliableindicator of whether a protein is integral in the outermembrane [17,2 0–2 2].As a distinct means to separate integral and peri-pheral membrane proteins we undertook cloud pointextraction with ... size of proteins enriched in the lipid-rich pellet including the major 29 kDa protein Por1 and Tom40, identiﬁed by mass spectrometry and immunoblotting. (C). After in situ digestion with trypsin,...

Báo cáo khoa học: Glutamic acid residues in the C-terminal extension of small heat shock protein 25 are critical for structural and functional integrity pptx

... Creutz-feldt–Jakob and Parkinson’s diseases [ 5–8 ]. Increasedlevels of sHsps, in particular aB-crystallin and Hsp27,are observed in the brains of sufferers of these diseases[9,10]. Hsp25 is the murine ... (2002)Role of the C-terminal extensions of a-crystallins: swap-ping the C-terminal extension of aA-crystallin to aB-crystallin results in enhanced chaperone activity. J BiolChem 277, 4582 1–4 5828.53 ... region of 8 0–1 00 amino acids, denoted the a-crystallin domain, which is ﬂanked byregions of variable sequence and length: the N-terminal domain and theC-terminal extension. Although the two domains...

Báo cáo khoa học: Alternative binding proteins: Anticalins – harnessing the structural plasticity of the lipocalin ligand pocket to engineer novel binding activities pdf

... MINIREVIEWAlternative binding proteins: Anticalins – harnessing thestructural plasticity of the lipocalin ligand pocket toengineer novel binding activitiesArne SkerraLehrstuhl ... bilin -binding protein (BBP) of Pieris brassi-cae [19] was employed to engineer an artiﬁcial binding site for ligands such as ﬂuorescein and digoxigenin, aswell as other small molecules and ... anticalins in com-plex with their ligands – and in one instance also asapo-protein – which were solved at resolutions of 2.0 A˚or better [20,23], provided interesting insight intothe mechanism and...

Báo cáo khoa học: D-Amino acids in the brain: the biochemistry of brain serine racemase potx

... binding areshown in orange and those involved in nucleotide binding are shown in red. Residues involved in the binding to the PLP moiety are shown in blue, whereas those involved in protein–protein ... PDZ interactions with the C-terminal amino acid triplet of serine werecrucial for binding, but instead, the interaction wasestablished with its N-terminal 66 residues. Binding of Golga3 increases ... domain-containing protein was found to interact with serineracemase, also requiring the C-terminal binding motif[30]. Protein interacting with C kinase 1 (PICK1) con-tains one PDZ domain that...

Xem thêm

Từ khóa: báo cáo khoa học mẫu báo cáo khoa học y học báo cáo khoa học sinh học báo cáo khoa học nông nghiệp báo cáo khoa học lâm nghiệp báo cáo khoa học thủy sản Nghiên cứu sự hình thành lớp bảo vệ và khả năng chống ăn mòn của thép bền thời tiết trong điều kiện khí hậu nhiệt đới việt nam Nghiên cứu tổ chức pha chế, đánh giá chất lượng thuốc tiêm truyền trong điều kiện dã ngoại Một số giải pháp nâng cao chất lượng streaming thích ứng video trên nền giao thức HTTP Nghiên cứu vật liệu biến hóa (metamaterials) hấp thụ sóng điện tử ở vùng tần số THz Nghiên cứu tổ chức chạy tàu hàng cố định theo thời gian trên đường sắt việt nam Biện pháp quản lý hoạt động dạy hát xoan trong trường trung học cơ sở huyện lâm thao, phú thọ Giáo án Sinh học 11 bài 13: Thực hành phát hiện diệp lục và carôtenôit Giáo án Sinh học 11 bài 13: Thực hành phát hiện diệp lục và carôtenôit Giáo án Sinh học 11 bài 13: Thực hành phát hiện diệp lục và carôtenôit Phối hợp giữa phòng văn hóa và thông tin với phòng giáo dục và đào tạo trong việc tuyên truyền, giáo dục, vận động xây dựng nông thôn mới huyện thanh thủy, tỉnh phú thọ Phát triển mạng lưới kinh doanh nước sạch tại công ty TNHH một thành viên kinh doanh nước sạch quảng ninh Nghiên cứu, xây dựng phần mềm smartscan và ứng dụng trong bảo vệ mạng máy tính chuyên dùng Nghiên cứu về mô hình thống kê học sâu và ứng dụng trong nhận dạng chữ viết tay hạn chế Nghiên cứu tổng hợp các oxit hỗn hợp kích thƣớc nanomet ce 0 75 zr0 25o2 , ce 0 5 zr0 5o2 và khảo sát hoạt tính quang xúc tác của chúng Nghiên cứu khả năng đo năng lượng điện bằng hệ thu thập dữ liệu 16 kênh DEWE 5000 Tổ chức và hoạt động của Phòng Tư pháp từ thực tiễn tỉnh Phú Thọ (Luận văn thạc sĩ)Kiểm sát việc giải quyết tố giác, tin báo về tội phạm và kiến nghị khởi tố theo pháp luật tố tụng hình sự Việt Nam từ thực tiễn tỉnh Bình Định (Luận văn thạc sĩ)BT Tieng anh 6 UNIT 2 Giáo án Sinh học 11 bài 14: Thực hành phát hiện hô hấp ở thực vật TÁI CHẾ NHỰA VÀ QUẢN LÝ CHẤT THẢI Ở HOA KỲ