Luật ngân sách nhà nước đi vào thực tế nhưng việc thi hành còn nhiều thiếu sót hạn chế đặc biệt là công tác thanh tra chưa thực sự hoạt động hiệu quả . Chính sách đãi ngộ còn chưa thực sự thỏa đáng chưa đáp ứng được nhu cầu sống của cán bộ công chức còn tồn tại chế độ xin cho . Chế độ thi tuyển áp dụng cán bộ công chức còn chưa được áp dụng một cách đại trà . Công tác lập phương án phân bổ dự toán ngân sách và định mức thu các khoản thu đôi lúc còn chưa sát với thực tế của từng vùng còn mang tính chất áp đặt . Cơ chế quản lí các công trình xây dựng còn lỏng lẻo thiếu cá nhân phụ trách, các đoàn thanh tra còn chưa thực sự hoạt động hiệu quả, các khoản thu bổ sung không nhiều nên còn phụ thuộc vào các khoản chi cấp trên giao cho không mang tính chủ động ,các khâu tổ chức kế toán, giám sát kiểm tra và tổng hợp phan tích đánh giá về ngân sách huyện ảnh hưởng tới cán bộ cơ sở trong việc thẩm định năng lực cán bộ, nhiều nơi trình độ cán bộ công chức còn ở mức độ sơ cấp chưa qua đào tạo chưa đáp ứng được nhu cầu . Các cán bộ kế
toán thiếu cán bộ chuyên trách tồn tai đó là do hiện nay quy định các cán bộ tài chính kế toán của Huyện phải nằm trong bộ máy được nhân dân tính nhiệm bầu ra như vậy cứ sau một năm cùng với sự thay đổi của các cấp chính quyền sau mỗi lần bầu cử thì lại thay đổi gây khó khăn cho các cấp ngân sách đặc biệt là phòng tài chính kế hoạch . Đối với công tác giám sát quản lí ngân sách một bộ phận chưa nhận thức được đầy đủ ý nghĩa và tầm quan trọng của việc thực hiện quy chế dân chủ công khai ở cơ sở mà trước hết là quy chế dân chủ công khai về tài chính nên chưa tích cực qiám sát quá trình thực hiện quy chế dân chủ này trong công tác quản lí ngân sách