- Tổ chức bộ máy:
Tổ chức bộ máy ngành thuế tuy đã được tăng cường về số lượng chất lượng nhưng trình độ nghiệp vụ quản lý thu thuế còn chưa đáp ứng được so với yêu cầu công tác đa dạng phức tạp trong quản lý thu thuế hiện nay, trong cơ chế thị trường định hướng xã hội chủ nghĩa có - sự quản lý Nhà nước. Một số cán bộ còn làm việc theo giờ giấc hành chính, thiếu đi sâu vào các xóm ngõ, tổ đường phố, cụm dân cư, đặc biệt là sáng sớm, đêm khuya để xác định doanh thu sát với thực tế kinh doanh. Cá biệt vẫn còn những cán bộ thiếu tu dưỡng rèn luyện thường xuyên, thiếu kiên quyết đấu tranh chống thất thu, bảo vệ pháp luật thuế.
Việc thực hiện các quy trình nghiệp vụ và biện pháp quản lý chỉ đạo của ngành chưa thực sự nghiêm túc. Nhiều nơi, nhiều lúc ngành thuế chưa
tham mưu tích cực cho chính quyền các cấp và chưa phối hợp tích cực để cùng chỉ đạo làm tốt công tác quản lý thu thuế.
- Sự hiểu biết pháp luật, ý thức chấp hành luật.
Mục tiêu của các cơ sở sản xuất kinh doanh thuộc khu vực kinh tế ngoài quốc doanh là lợi nhuận thu được, nhưng cơ quan thuế chưa tận dụng mọi cơ hội thuận lợi mọi hình thức sinh động tuyên truyền giải thích chính sách, từng bước nâng cao trình độ hiểu biết pháp luật và khơi dậy tinh thần tự giác thực hiện nghĩa vụ với ngân sách Nhà nước của các cơ sở sản xuất kinh doanh. Mặt khác, các vi phạm về không thực hiện đầy đủ nghĩa vụ khai báo, thực hiện chế độ hoá đơn chứng từ, sổ sách kế toán, các hình thức gian lận khác để trốn thuế, cố tình dây dưa chậm nộp tiền thuế ... có nhiều lúc, nhiều thời điểm chưa kịp thời xử lý nghiêm khắc dẫn đến tình trạng xem thường phép nước hay nói cách khác tính pháp lý cao của các sắc thuế chưa được thực hiện trong công tác quản lý thu.
- Sự phối hợp giữa cơ quan thuế và cơ quan chức năng, trong thực hiện các luật thuế.
Trong thời gian qua sự phối hợp giữa cơ quan thuế và các cơ quan chức năng liên quan để hoàn thành nhiệm vụ thu thuế đã được cải thiện một bước. Tuy nhiên ở một số nơi, một số địa phương, sự phối hợp này chưa chặt chẽ còn mang tính hình thức đã dẫn dến tình trạng thất thu thuế ở một số lĩnh vực nhất là trong quản lý thu thuế ngoài quốc doanh. Những trường hợp chống đối, vi phạm có tình tiết nặng về thuế chưa được các cơ quan chức năng phối hợp, xử lý kịp thời, đúng luật chưa tạo được chỗ dựa vững chắc cho cuộc đấu tranh kiên trì chống trốn lậu thuế đạt hiệu quả cao nhất.
Tóm lại, cùng với sự phát triển nhanh, mạnh của khu vực kinh tế ngoài quốc doanh ở Hà Tây những năm gần đây, ngành thuế Hà Tây đã từng bước cải tiến công tác quản lý thu thuế, bước đầu đã thu được những kết quả về nhiều mặt góp phần tăng thu ngân sách, tạo dựng môi trường kinh doanh lành mạnh, thực hiện bình đẳng và công bằng xã hội.
Tuy nhiên kết quả đạt được chưa tương xứng với tiềm năng thực có, mà nguyên nhân chủ yếu là: Tổ chức bộ máy còn nhiều bất cập, sự hiểu biết và ý thức chấp hành luật của ĐTNT chưa cao, sự phối hợp giữa ngành thuế và cơ quan chức năng còn lỏng lẻo...