5. Phạm vi nghiên cứu
3.2 Vẽ cấu trúc phân tử
Ví dụ 1: Vẽ cấu trúc phân tử 2,4,6- tribromphenol
Bước 1: Vẽ vịng benzen
- Click chuột vào biểu tượng vịng benzen trên thanh cơng cụ (khi đĩ biểu tượng sẽ bị chìm xuống so với ban đầu), sau đĩ đưa con trỏ ra ngồi màn hình soạn thảo, click chuột vào vị trí cần vẽ:
Bước 2: Vẽ liên kết đơn
- Click chuột vào biểu tượng liên kết đơn sau đĩ đưa trỏ vào vị trí cần liên kết (thấy xuất hiện một ơ vuơng nhỏ bao quanh vị trí cần liên kết) và click chuột.
Bước 3: Vẽ nguyên tử hoặc nhĩm nguyên tử
- Click chuột vào biểu tượng text sau đĩ đưa trỏ vào vị trí cần liên kết và click chuột, gõ vào tên nguyên tử hoặc nhĩm nguyên tử (cần chú ý chữ hoa và chữ thường)
Sau khi vẽ xong, nên chọn font và size phù hợp. Nếu các liên kết dài quá, nhìn khơng đẹp thì cĩ thể co ngắn bằng cách chọn cụm chữ ở đầu liên kết và di ngắn lại là được.
Muốn copy sang word hoặc powerpoint ta thực hiện theo các bước sau:
- Click chuột vào một trong hai biểu tượng trên thanh cơng cụ để lựa chọn phân tử.
- Sau khi chọn phân tử cần copy, vào menu Edit chọn lệnh copy hoặc sử dụng tổ
hợp phím Ctrl + C
- Sau đĩ mở chương trình word hoặc powerpoint, đặt con trỏ vào vị trí cần dán trên màn hình soạn thảo, sau đĩ vào menu Edit chọn lệnh paste hoặc sử dụng tổ hợp phím Ctrl + V hoặc R-click rồi chọn paste
Ví dụ 2: Vẽ cấu trúc phân tử theo cách biểu diễn Fischer
- Chọn File/ Open special/ ACS Document 1996
- Chọn cơng cụ đưa vào màn hình làm việc kéo thẳng xuống vẽ liên kết thứ nhất và các liên kết tiếp theo bằng cách đưa trỏ vào cuối nguyên tử kéo thẳng xuống (tổng cộng 5
- Thêm liên kết nằm ngang của nguyên tử thứ hai trong mạch phân tử vừa tạo ra, click lần nữa để tạo liên kết đơi diện nằm ngang. Lặp lại các bước như ban đầu để vẽ các liên kết nằm ngang
- Gán thêm các nhĩm vào đầu và cuối của chuỗi mạch phân tử
Chọn cơng cụ click chọn nguyên tử cacbon ở dịng đầu tiên, text box xuất hiện và gõ vào CHO
CHO
CH2OH
Click vào nơi nguyên tử cacbon cần nguyên tử hidro, sau đĩ gõ H CHO CH2OH H CHO CH2OH H H CHO CH2OH H H H CHO CH2OH H H H H Click vào nguyên tử cịn lại, sau đĩ gõ OH
CHO CH2OH OH H H H H CHO CH2OH OH H H HO H H CHO CH2OH OH H H HO OH H H CHO CH2OH OH H H HO OH H H HO
- Để xem thơng tin cấu trúc cơ bản và đưa thong tin vào tài liệu , ta thực hiện các bước sau:
Click chọn cấu trúc vừa vẽ xong, chọn View/ show Analysis Window, click paste để đưa thơng tin chú thích vào cấu trúc
Ví dụ 3: Vẽ cấu trúc phân tử theo cách biểu diễn Newman
- Click chọn cơng cụ vẽ liên kết thứ nhất, thứ hai và thứ ba theo hình sau:
- Thực hiện lệnh copy và paste để cĩ thêm một cấu trúc tương tự, sau đĩ vẽ thêm một liên kết nối giữa hai cấu trúc
Chọn cấu trúc phía sau và xoay 1800
Click chọn cấu trúc phía sau chọn lệnh Object/ Bring to front, click chuột vào khung chữ nhật dến khi cĩ hình bàn tay sau đĩ rê vào chỗ cacbon được chọn ở trung tâm orbital
Ví dụ 4: Vẽ phân tử Stiren
HC CH2
Bước 2: Vẽ liên kết đơn (như ví dụ 1)
Bước 3: Vẽ nhĩm nguyên tử CH-chữ hoa, khơng dùng chữ thường (như ví dụ 1) Bước 4: Vẽ liên kết đơi
Click chuột vào biểu tượng liên kết đơi trên thanh cơng cu , khi đĩ chương trình sẽ tự động báo lỗi hĩa trị (nhĩm nguyên tử CH được bao quanh bởi một hình vuơng màu đỏ).
Đưa con trỏ vào vị trí cần liên kết và vẽ liên kết đơi.