Nguyên nhân chủ yếu do địa bàn hoạt động của trung tâm là khu vực miền Bắc nên việc bố trí thêm người là rất khó khăn, mặt khác lực lượng lao động trên 50 tuổi trong trung tâm còn khá đông mà chưa đến tuổi nghỉ hưu.
Nguyên nhân dẫn tới việc đáp ứng nguồn điện sử dụng trong khu vực phía Bắc trong sinh hoạt và trong sản xuất tại vùng nông thôn và thời kỳ cao điểm trong việc sử dụng điện, là do số lượng điện năng tiêu thụ điện quá lớn mà nguồn cung cấp điện còn thiếu chưa đủ.
Trong trung tâm lực lượng lao động cũng khá cao nhưng trình độ chuyên môn vẫn còn thiếu kinh nghiệm thực tiễn nên sẽ mất một khoảng thời gian để tìm hiểu và học tập thêm kinh nghiệm thực tế đó.
Trung tâm chưa có sự phân bố hợp lý giữa các đội ngũ lao động trong trung tâm.
Lực lượng lao động nữ trong trung tâm còn chiếm một tỷ lệ khá cao trong trung tâm và vậy ảnh hưởng tới khả năng đáp ứng công việc của trung tâm.
Công tác tuyển dụng của trung tâm còn phụ thuộc vào tập đoàn Điện lực Việt Nam nên việc phân bổ còn khó khăn chưa phù hợp với trung tâm. Mà chưa có quy chế chung thống nhất giữa các khu vực miền trung và miền nam. Mặt khác công tác tuyển dụng còn nặng về tính cá nhân, nể nang trong những trường hợp thân quen. Nhiều khi việc tuyển dụng lao động còn phụ thuộc nhiều vào sức ép của cấp trên, cấp dưới, quan hệ đối ngoại…Điều này dẫn đến việc thiếu chuyên gia giỏi, ảnh hưởng lớn đến việc năng suất, hiệu quả lao động của Trung tâm.
Miền Bắc (Đánh giá trạng thái, tính toán trào lưu công suất, phân tích chế độ đột biến v.v…) không phát huy hết được hiệu quả.
Do xuất phát từ các dự án độc lập, tách rời và ở các thời điểm khác nhau nên không có một thiết kế tổng thể cho toàn bộ các hệ thống, các nhà thắng thầu khác nhau có những phương thức thực hiện khác nhau, trong quá trình triển khai mới xem xét đến các hệ thống liên quan nên gặp nhiều khó khăn và khi thực hiện xong các dự án SCADA/EMS nên không đảm được độ thống nhất cao.
Hệ thống kênh truyền thông tin gồm nhiều chủng loại, phải ghép nối với nhiều đường cũ, chất lượng kém nên hay bị mất tín hiệu hoặc gián đoạn gây khó khăn trong việc điều hành và cũng là nguyên nhân không đưa được các ứng dụng điều khiển xa vào sử dụng (đóng - cắt từ xa, tự động điều khiển phát điện - AGC).
Hiện tại EVN không có các chuyên gia được đào tạo chuyên sâu về phần cứng cũng như phần mềm để có thể duy trì bảo dưỡng một cách độc lập các thiết của hệ thống SCADA/EMS.