Tại công ty thì công việc kiểm kê NVL chủ yếu là do các xưởng tự kiểm tra. Thời gian kiểm tra cũng không cố định mà tuỳ theo yêu cầu của từng phân xưởng. Mục đích của việc kiểm kê vật tư là nhằm xác định một cách chính xác số lượng và giá trị của từng loại vật tư ở trong kho của công ty. Ngoài ra công tác kiểm kê vật tư còn có mục đích đôn đốc và kiểm tra tình hình bảo quản, phát hiện và xử lý các hao hụt, hỏng, mất… các vật tư tại các kho. Qua công tác này sẽ nâng cao ý thức trách nhiệm của từng người trong việc bảo quản, sử dụng vật tư cũng như việc quản lý NVL, CCDC phải có nề nếp.
Thông thường trước khi tiến hành kiểm kê phải xác định được lượng NVL tồn kho ở thời điểm kiểm kê trên sổ sách. Đồng thời tiến hành kiểm kê số vật tư còn lại trong các kho. Kết quả kiểm kê sẽ được ghi vào Biên bản kiểm kê vật tư. Trong biên bản này sẽ ghi rõ từng loại vật tư được kiểm kê về số lượng, đơn giá, lượng tồn thực tế và trên sổ sách cũng như mức chênh lệch giữa sổ sách và thực tế. Căn cứ vào kết quả kiểm kê để xác định các nguyên nhân thừa thiếu của NVL từ đây đưa ra các biệ pháp xử lý thích hợp.
Vật tư của công ty thiếu, thừa có thể do nhiều nguyên nhân nhưng nguyên nhân chủ yếu là do việc bảo quan chưa thật đúng theo qui định. Vì vạy khi phát hiện số vật tư chênh lệch so với sổ sách thường thì sẽ tiến hành tìm hiểu nguyên nhân và xử lý.
Trường hợp thiếu vật tư: Nếu là nguyên nhân khách quan thì được hạch toán vào chi phí. Kế toán ghi Nợ tài khoản chi phí và ghi Có tài khoản
NVL,CCDC. Nếu việc thiếu hụt này là do nguyên nhân chủ quan thì yêu cầu cá nhân đó phải bồi thường cho doanh nghiệp.
Trường hợp vật tư thừa trong kiểm kê: Sau khi tìm hiểu các nguyên nhân của việc thừa NVL, CCDC kế toán sẽ tiến hành hạch toán. Thường thì kế toán sẽ ghi giảm chi phí. Trong một số trường hợp đặcbiệt thì mới hạch toán vào Nợ TK 002- Hàng hoá nhận giữ hộ, nhận gia công sơ chế.