gốc là DNA đích
Là DNA được tổng hợp bằng cách dùng đúng sản
phẩm khuếch đại của DNA đích nhưng cắt ngắn đi hay chèn một đoạn DNA nhỏ để làm cho nó dài hơn.
Sử dụng cùng mồi với DNA đích nên không cần thiết
kế mồi để cho thêm vào PCR mix
Nếu cho vào mẫu thử trước khi tách chiết với lượng
vừa đủ thì đạt được cả 3 mục đích kiểm soát: (1) kiểm soát được hệ thống tách chiết nucleic acid có tốt
không, (2) kiểm soát được ức chế có hay không, và (3) kiểm soát được độ nhạy của PCR mix khuếch đại DNA đích
Nếu cho vào mẫu chứng âm với lượng tối thiểu vừa đủ
để được tách chiết cùng với mẫu mẫu thử thì khiểm soát được (1) hệ thống tách chiết nucleic acid có tốt không, (2) kiểm soát được độ nhạy của PCR mix
khuếch đại DNA đích, (3) thao tác có ngoại nhiễm không
DNA chứng nội tại tổng hợp từ DNA đích được chèn một đoạn DNA ngắn
Chứng nội tại là DNA tổng hợp có nguồn gốc là DNA đích nguồn gốc là DNA đích
Chứng nội tại là DNA tổng hợp có nguồn gốc khác DNA đích nhưng sử dụng cùng mồi với DNA đích
Là DNA được tổng hợp bằng cách dùng sản phẩm khuếch đại của DNA khác biệt DNA đích nhưng chèn ở hai đầu các trình tự giống hệt trình tự mồi của DNA đích.
Sử dụng cùng mồi với DNA đích nên không cần thiết kế mồi để cho thêm vào PCR mix
Nếu cho vào mẫu thử trước khi tách chiết với lượng vừa đủ thì đạt được cả 3 mục đích kiểm soát: (1) kiểm soát được hệ thống tách chiết nucleic acid trên chính mẫu thử có tốt không, (2) kiểm soát được ức chế có hay không, và (3) kiểm soát được độ nhạy của PCR mix khuếch đại DNA đích
Nếu cho vào mẫu chứng âm với lượng tối thiểu vừa đủ để được tách chiết cùng với mẫu mẫu thử thì kiểm soát được (1) hệ thống tách chiết nucleic acid có tốt không, (2) kiểm soát được độ nhạy của PCR mix khuếch đại DNA đích, (3) thao tác có ngoại nhiễm không
DNA chứng nội tại tổng hợp từ DNA khác DNA đích được chèn 2 đầu trình tự giống mồi DNA đích
Chứng nội tại là DNA tổng hợp có nguồn gốc khác DNA đích nhưng sử dụng cùng mồi với DNA đích
Chứng nội tại là một hệ thống mồi và DNA khác biệt hoàn toàn với DNA đích
Được khuếch đại song song với DNA đích nhưng dùng mồi khác biệt DNA đích và DNA chứng nội tại có nguồn gốc khác biệt
hoàn toàn với DNA đích.
Để có thể khuếch đại được DNA chứng nội tại, phải cho thêm vào trong PCR mix một cặp mồi đặc hiệu với DNA chứng nội tại và nên thiết kế mồi sao cho nhiệt độ bắt cặp tương tự nhiệt độ bắt cặp của mồi dành cho DNA đích, và không tạo ra các dimer primer với mồi của DNA đích
DNA chứng nội tại nếu được cho vào mẫu thử trước khi tách
chiết với lượng vừa đủ thì (1) kiểm soát được hệ thống tách chiết nucleic acid trên chính mẫu thử có tốt không, (2) kiểm soát được ức chế có hay không
DNA chứng nội tại nếu được cho vào mẫu chứng âm với lượng tối thiểu vừa đủ để được tách chiết cùng với mẫu mẫu thử thì
kiểm soát được (1) hệ thống tách chiết nucleic acid có tốt không, (2) thao tác có ngoại nhiễm không
Bản chất giống như multiplex PCR nên khó thiết kế và không kiểm soát được độ nhạy của PCR mix khuếch đại DNA đích
DNA chứng nội tại có nguồn gốc khác biệt DNA đích
Mồi cho DNA chứng nội tại cũng khác biệt với mồi của DNA đích
Chứng nội tại là một hệ thống mồi và DNA khác biệt hoàn toàn với DNA đích
QF-PCR