Bên cạnh thành tích khá khả quan đạt được trong ba năm qua thì chi nhánh vẫn còn những tồn tại, những hạn chế cần được khắc phục.
- Về vốn huy động từ dân cư ,có thể nói đây là một nguồn vốn có tính ổn định cao, chiếm một tỷ trọng lớn trong tổng nguồn vốn huy động vì thế nó có vai trò rất quan trọng với sự phát triển hoạt động của NH. Qua 3 năm ta thấy nguồn vốn huy động từ dân cư của chi nhánh có tăng nhưng không nhiều, và về tỷ trọng thì lại giảm dần qua từng năm. Nguyên nhân là do ngày càng có nhiều NH đã vào tỉnh hoạt động với các mức lãi suất, dịch vụ cạnh tranh , bên cạnh đó biến động về thị trường kinh tế những năm gần đây cũng là một vấn đề mà chi nhánh phải đối mặt.
- Nguồn vốn huy động từ doanh nghiệp chưa nhiều, chỉ chiếm một tỷ trọng nhỏ trong tổng nguồn vốn,
- Ngoài ra đây là chi nhánh mới nâng cấp nên thị phần hoạt động còn hạn chế. Khách hàng tại chi nhánh chủ yếu là các khách hàng doanh nghiêp vừa và nhỏ, các cá nhân; hộ gia đình và khách hàng lớn hầu như không có nên chi nhánh ít có cơ hội thu hút hay đầu tư vốn lớn và phát triển các dịch vụ về thanh toán xuất nhập khẩu, tài trợ thương mại...
- Số lượng cán bộ công nhân viên của chi nhánh đa số là những người có trình độ chuyên môn tốt nhưng số lượng cán bộ chưa đủ để đáp ứng hết yêu cầu công việc, đôi khi gây nên tình trạng quá tải.