Vấn đề đặt ra đối với các ứng dụng cộng tác trong mạng ngang hàng là khi một ứng dụng chia sẻ tài nguyên của mình cho những người sử dụng khác trong nhóm cộng tác thì ứng dụng này được đánh giá về sự cộng tác như thế nào, và khi các ứng dụng cùng muốn lấy tài nguyên tại một nút thì mỗi ứng dụng sẽ được xem xét thứ tự về quyền ưu tiên ra sao ?
Đảm bảo công bằng trong chia sẻ tài nguyên, đặc biệt khi có nhiều ứng dụng cùng muốn lấy tài nguyên từ một nguồn chia sẻ tài nguyên, thì ứng dụng phải nhận biết được nhau, tin cậy được với nhau, đồng thời phải có một cơ chế ưu tiên trong cấp phát nguồn tài nguyên chia sẻ (vì ứng dụng nào cũng muốn giành lấy tài nguyên chia sẻ đó). Tin cậy và quản lí được tin cậy là một vấn đề đặc biệt quan trọng trong môi trường P2P, nơi mà thường xuyên bắt gặp các agent chưa nhận biết được.
Đảm bảo công bằng cho các ứng dụng cộng tác ngang hàng theo nghĩa một ứng dụng lấy nhiều tài nguyên, thì phải có quyền khai thác từ nhiều nơi. Tuy vậy, quyền khai thác (giành lấy tài nguyên) và thứ tự ưu tiên sẽ được xem xét. Có rất nhiều các ứng dụng, đặc biệt là các trang Web trong thương mại điện tử sử dụng phương pháp định giá trị người sử dụng thông qua việc tính điểm trên trang Web của mình. Mỗi người sử dụng khi muốn lấy tài liệu trên Website sẽ được gắn một tài khoản với tên gọi “accountname” và được tính điểm, khởi đầu là 0. Nếu muốn lấy tài nguyên (downnload dữ liệu chẳng hạn), thì số điểm của “accountname” phải thỏa mãn ở mức tối thiểu nào đó (điều này phụ thuộc vào qui định ngưỡng tối thiểu và cách tính điểm của mỗi trang Website). Chẳng hạn nếu muốn download một tài liệu thì số điểm của “accountname” phải có ít nhất là 250 điểm, và khi upload một tài liệu thì người sử dụng có thể được cộng thêm 250-500 điểm vào tài khoản “accountname”. Càng nhiều điểm thì dung lượng hoặc số tập tin có thể được download sẽ càng lớn. Nếu số điểm ít thì chỉ có thể download được một số ít tập tin của Website hoặc không, lúc này người sử dụng được khuyến cáo nạp tiền hoặc upload dữ liệu vào tài khoản của mình (có thể qua tin nhắc SMS hoặc mua thẻ,…).
-38- Cũng có Website (như Thư viện số - www.thuvienso.info) tính giới hạn số ngày cho người sử dụng download tài liệu. Khi đăng kí tài khoản trên Website này, người sử dụng được cấp một tài khoản. Mỗi lần đăng nhập và muốn download tài liệu của Website này, người sử dụng được kiểm tra tài khoản và số ngày giới hạn còn lại để được download dữ liệu của Website. Nếu muốn nạp tiền cho tài khoản, người sử dụng có thể nhắn tin SMS theo cú pháp “TVS username” và gởi 8717 (mỗi tin nhắn 15000VNĐ và được 5 ngày download dữ liệu không hạn chế), hoặc Thanh toán 200.000 VNĐ (365 ngày sử dụng không giới hạn) bằng cách gửi tiền qua ngân hàng. Một số Website còn sử dụng thanh toán tiền để download tài liệu qua thẻ thanh toán điện tử trên mạng.
Trong các mạng ngang hàng, khi một ứng dụng chia sẻ tài nguyên và có bảo mật, đặt password cho thư mục chia sẻ chẳng hạn, thì các máy muốn lấy tài nguyên là thư mục chia sẻ này cần phải chứng minh được quyền hạn của mình với ứng dụng chia sẻ thông qua password của thư mục chia sẻ cấp. Điều này đặc biệt quan trọng trong các ứng dụng ngang hàng của các cơ quan, tổ chức, cá nhân sử dụng thương mại điện tử, vì nó liên quan đến vấn đề tài chính, danh tiếng, lợi ích,… của các đối tượng này.