Trên cơ sở những kết quả đạt đ−ợc của dự án 14EE5, một dự án hợp tác tiếp tục và mở rộng đã đ−ợc đề xuất và đ−ợc ghi vào Biên bản kỳ họp thứ 3 tại Hà Nội vào thời gian 21 - 22/11/2005 xác định ch−ơng trình giai đoạn 2006 - 2008. Trong Phụ lục IV của Biên bản này, dự án mới đề xuất đ−ợc xác định là 1 trong 9 dự án đ−ợc −u tiên (trong tổng số 21 dự án đ−ợc đề cập tới, mang mã số 12EE6 với tiêu đề “Đánh giá chất l−ợng môi tr−ờng, lịch sử và xu thế của một số thủy vực quan trọng làm cơ sở quản lý các đầm phá ven bờ miền Trung Việt Nam và một số hồ có liên quan - Assessing environment quality, history and trends of key water bodies as a way to management: coastal lagoons in the Centre of Vietnam and some related reservoirs”
Mở rộng và phát huy kết quả nghiên cứu tổng quan hệ thống đầm phá và trọng điểm Tam Giang - Cầu Hai trong Dự án 14EE5, dự án mới đề xuất 12EE6 nhằm mục đích:
(1). Kiến tạo bộ t− liệu môi tr−ờng hệ thống với những số liệu phân tích mới ch−a từng có trong lịch sử về các chất gây bẩn, độc tố vi l−ợng bền vững tích tụ trong cả môi tr−ờng n−ớc và trầm tích.
(2). Định h−ớng quản lý tài nguyên và môi tr−ờng hệ thống đầm phá ven bờ miền Trung Việt Nam và các hồ chứa có liên quan, h−ớng tới phát triển bền vững vùng bờ biển.
(3). Tiếp thu và nâng cao kỹ năng phân tích hiện đại, xử lý mô hình số trị mô phỏng các tr−ờng thuỷ động và phân tán vật chất chuyên dùng cho các thuỷ vực ven bờ biển.