Do xã Vân Hà chỉ có 50% dân số của xã được sử dụng nước sạch theo tiêu chuẩn của bộ y tế, số còn lại người dân phải sử dụng nguồn nước chính là nước giếng khoan lấy từ hệ thống nước ngầm.
Vì vậy mà nước ngầm có vai trò quan trọng đến cuộc sống của người dân trong xã, qua con số khảo sát hiện xã Vân Hà có số giếng khoan là: 1990 giếng, trong đó số giếng khoan có bể lọc là: 1729 giếng, còn số giếng khoan không có bể lọc là: 261 giếng và số giếng đào là: 18 giếng. Điều đó có thể thấy 90% dân số trong xã được sử dụng nước hợp vệ sinh.
Chỉ có duy nhất thôn Vân Điềm môi trường chưa có dấu hiệu của sự xuống cấp. Tình hình môi trường nước của xã theo đánh giá chung của người dân là có sự ô nhiễm về mặt nước ngầm.
Theo chủ tịch xã Vân Hà ông Nguyễn Đình Chiến cho biết: “ Người dân chủ yếu sử dụng nước ngầm ở độ sâu 30 – 45m, còn mực nước ở độ sâu 10 - 15m thì bị ô nhiễm, không thể sử dụng được do ô nhiễm Mn và Fe”.
Môi trường nước mặt bao gồm các ao, hồ, đầm nuôi thủy sản, các kênh mương qua khảo sát điều tra có 20/30 phiếu điều tra cho rằng nguồn nước mặt đang bị ô nhiễm (chiếm 66,7% tổng số phiếu được hỏi), 9/30 phiếu điều tra cho rằng có ô nhiễm nhưng không đáng kể (chiếm 30% tổng số phiếu được hỏi), còn lại 1 phiếu không trả lời (chiếm 3,3% tổng số phiếu được hỏi). Ở xã Thiết Bình qua khảo sát 90% các ao hồ trong thôn đều có màu đen do người dân thải trực tiếp nước thải sinh hoạt ra ao, hồ và một phần là do việc đổ gỗ vụn, mùn cưa ra ao hồ đã làm các ao hồ này bị nhiễm bẩn chất hữu cơ.
Theo người phụ trách về mặt quản lý rác thôn Văn Điểm cho biết: “ Toàn bộ nước thải trong thôn đều được dẫn và xả trực tiếp ra cánh đồng” gây ra hiện tượng các con kênh, mương đều bị ô nhiễm, chủ yếu bị phú dưỡng do nồng độ các chất hữu cơ cao.
Ngoài ra sự ô nhiễm nước mặt ở các kênh mương còn do việc sử dụng bừa bãi các loại thuốc bảo vệ thực vật và phân bón hóa học đã gây nên tình trạng nước mặt ở kênh mương thường chứa các kim loại nặng như: Cu, Fe, Mn.
Về nước sinh hoạt theo báo cáo thực trạng môi trường của xã Vân Hà năm 2009 cho biết có tới 12000m3 nước thải sinh hoạt được thải ra trên ngày và 1700m3 nước thải dùng trong chăn nuôi và sản xuất thải ra trên ngày. Toàn bộ các lượng nước thải này đều không qua xử lý và bị đổ trực tiếp ra môi trường sống của người dân trong xã, khiến cho các ao, hồ trong xã dần trở thành các hồ chứa nước thải gây mất mỹ quan và ảnh hưởng trực tiếp đến sức khỏe người dân trong xã Vân Hà.