Diện tích đất nông nghiệp toàn xã là 2.959,32 ha, chiếm 87,23 % tổng diện tích đất tự nhiên. Trong đó đất lúa có diện tích là 321,66 ha chiếm 10,87 % diện tích đất nông nghiệp và 32,11 % diện tích đất sản xuất nông nghiệp.
Cơ cấu giống cây trồng chính trên địa bà xã bao gồm:
Lúa: Khang dân 18, Hương thơm số 1, SH 2, và các giống lúa lai như: Syn 6, Q ưu số 1, Bio 404, Nhị ưu 838…
Ngô: CP999, NK66, LVN44, MX4… Lạc, đậu tương: giống địa phương
Khoai lang,sắn,củ đậu: giống địa phương Chè:
Hiện nay trên địa bàn xã Mỹ Yên cây chè là cây trồng khá thích hợp với đồng đất nơi đây. Diện tích đất vườn tạp có địa hình tương đối bằng phẳng thích hợp cho việc phát triển các giống chè cành. Mặt khác, có thể mở rộng diện tích đất đồi để trồng các giống chè thích hợp với địa hình. Tính trên toàn xã Mỹ Yên thì có 5 xóm có diện tích trồng chè lớn nhất là các xóm: Thuận Tính trên toàn xã Mỹ Yên thì có 5 xóm có diện tích trồng chè lớn nhất là các xóm: Thuận Yên, Việt Yên, Bắc Hà 1, Bắc Hà 2, Bắc Hà 3. Cây chè cũng là cây trồng lâu năm trên địa bàn xã, nếu có chính sách khuyến khích đầu tư, phát triển thì cây chè sẽ đem lại lợi ích kinh tế
lâu dài cho địa phương.
Bảng một số loại hình sử dụng đất chính xã Mỹ Yên:
STT Tên cây trồng Kiểu sử dụng
1 Lúa Chuyên canh (Lúa xuân, lúa mùa)
Luân canh (Lúa- ngô đông)
2 Ngô Luân canh (Lúa- ngô)
3 Chè Chuyên canh
Xen canh ( Chè – keo)
Cơ cấu vật nuôi trên địa bà xã bao gồm:
Tên vật nuôi
Gia súc Trâu, Bò, Lợn, Dê…
Gia cầm Gà, Vịt, Ngan,
Thủy sản Cá, tôm