Trong thực tế việc gia công vỏ bao đang đựơc thực hiện theo tiêu chuẩn cơ sở (TCCS:26-2004) và hiên nay tổ vỏ bao không nằm trong HTQLCL. Vì vậy việc kiểm soát cha hợp lý, cha chặt chẽ và cha liên tục.
Điều này là không hợp lý vì chất lợng xi măng khi bảo quản chịu ảnh hởng rất lớn ở chất lợng vỏ bao. Theo kết quả nghiên cứu của TCty Xi măng Việt Nam trong điều kiện khí hậu nớc ta, xi măng PC30 sau 2 tháng bảo quản cờng độ nén giảm trung bình 10-14%, sau 3 tháng giảm 16-23%, sau 4 tháng giảm 23-26%. để đảm bảo an toàn xi măng xuất xởng cần phải có hệ số d mác không nhỏ hơn 20% và chỉ đợc dự trữ, lu kho không quá 2 tháng. Vì sản phẩm xi măng có những hoạt tính với nớc cao nên trong quá trình vận chuyển bảo quản nó tác dụng với hơi ẩm và khí CO2 trong không khí gây ra quá trình huỷ hoại ngoài ý muốn. Quá trình này riễn ra từ từ làm chất lợng xi măng suy giảm, xi măng bị vón cục, kết tảng thậm chí không sử dụng đợc. Xi măng có mác và độ mịn càng cao khí hậu càng nóng ẩm thì tốc độ suy giảm chất lợng khi bảo quản càng lớn Vậy nếu chất lợng vỏ bao mà không đợc quản lý chặt chẽ sẽ có thể ảnh hởng đến chất lợng xi măng thành phẩm.
Và hiện nay bộ phận thu hồi bụi khói lò nung cũng không nằm trong HTQLCL. Sản lợng của nhà máy sản xuất rất lờn nên cùng với nó khối lợng bụi thu đợc ngày càng tăng. Nếu quy trình thu hồi, xử lý lợng bụi này không đợc tổ chức một cách chặt chẽ thì chính lợng bụi này sau khi chế biến lại có thể sẽ là nguyên nhân làm giảm chất lợng xi măng.
Nguyên nhân của những hạn chế trên là do tính chất của những công việc này đơn giản, không phức tạp. Và trớc đây, sản lợng sản xuất của công ty nhỏ nên lợng lu kho thấp, xi măng thành phẩm sản xuất ra hầu nh đợc tiêu thụ ngay nên chất lợng vỏ bao không ảnh hởng nhiều đến chất lợng sản phẩm.
Còn bộ phận thu hồi bụi khói lò nung là một sáng kiến cải tiến kỹ thuật mới của công ty nên ban đầu khối lợng bụi thu đợc còn thấp không ảnh hởng nhiều đến chất lợng xi măng. Hiện nay, khối lợng bụi thu đợc lớn làm ảnh hởng đến chất lợng xi măng nhng hệ thống tài liệu của công ty lại cha thay đổi kịp cho phù hợp. Mặc dù, bộ phận này vẫn có một quy trình xử lý nhng không đợc đa vào hệ thống tài liệu của HTQLCL.