Đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu khi làm thủ tục hải quan được miễn kiểm tra thực tế hàng hóa thì không phải niêm phong hải quan. Đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu phải kiểm tra thực tế thì:
- Hàng phải được chứa trong container, hoặc trong phương tiện vận tải đáp ứng được yêu cầu niêm phong hải quan;
- Các lô hàng nhỏ, lẻ nếu không chứa trong container hoặc chứa trong phương tiện vận tải không đáp ứng yêu cầu niêm phong thì thực hiện niêm phong từng kiện hàng.
- Các lô hàng nhập khẩu nhỏ, lẻ thuộc các tờ khai nhập khẩu khác nhau nhưng cùng được đề nghị chuyển cửa khẩu về một địa điểm thì được vận chuyển chung trong một container/phương tiện vận tải nếu đáp ứng điều kiện: chủ hàng có văn bản đề nghị và container/phương tiện vận tải đáp ứng được yêu cầu niêm phong hải quan.
- Trường hợp hàng hóa chứa trong container, thùng, kiện hoặc chứa trong phương tiện vận tải không thể niêm phong hải quan thì làm thủ tục hải quan tại Chi cục Hải quan cửa khẩu hoặc hải quan cửa khẩu kiểm tra thực tế hàng hóa theo đề nghị của Chi cục Hải quan ngoài cửa khẩu.
Cần lưu ý rằng người khai hải quan sử dụng tờ khai hải quan điện tử in đã được cơ quan Hải quan cho phép chuyển cửa khẩu để làm chứng từ vận chuyển hàng hóa trên đường. Người khai hải quan chịu trách nhiệm bảo quản nguyên trạng hàng hóa, nguyên
niêm phong hải quan, niêm phong hãng vận tải và đi đúng tuyến đường, địa điểm, cửa khẩu, thời gian như đã đăng ký. Xuất trình và nộp bộ hồ sơ hải quan và hàng hóa chuyển cửa khẩu tại Chi cục Hải quan nơi có hàng chuyển cửa khẩu đến để làm thủ tục theo quy định.