Từ khi thành lập, năm 1994, Kiểm toán nhà nước Việt Nam đã nhanh chóng ổn định, kiện toàn tổ chức, tuyển dụng và đào tạo kiểm toán viên... thực hiện các nhiệm vụ kiểm toán hàng năm do Chính phủ giao hay thực hiện các nhiệm vụ kiểm toán khác theo yêu cầu của Thủ tướng Chính phủ, Quốc hội.
Sau hơn mười năm hoạt động, Kiểm toán nhà nước Việt Nam đã đạt được những kết quả rất khả quan. Thông qua hoạt động kiểm toán của mình đối với những đơn vị có sử dụng ngân sách, tài sản quốc gia, Kiểm toán nhà nước đã góp phần tăng thu, tiết kiệm chi cho Ngân sách Nhà nước trên mười ngàn tỉ đồng.
Cụ thể, hoạt động của Kiểm toán nhà nước trên một số mặt chủ yếu trong những năm qua:
Kiểm toán nhà nước đã tiến hành kiểm toán lần thứ hai báo cáo quyết toán ngân sách trên địa bàn tỉnh, thành trên toàn quốc; các bộ ngành, cơ quan sử dụng Ngân sách Nhà nước; các quân khu, quân đoàn, quân chủng, tổng cục, một số doanh nghiệp thuộc các Bộ Công an, Bộ Quốc phòng và kinh tế Đảng. Kết quả, kiểm toán đã tăng thu, tiết kiệm chi cho Ngân sách hàng nghìn tỉ đồng. Nhưng quan trọng hơn, Kiểm toán nhà nước cũng đã chỉ ra những yếu kém trong quản lý, điều hành, sử dụng Ngân sách Nhà nước ở các cấp, đưa ra nhiều kiến nghị cụ thể, thực tế giúp tăng cường hiệu quả quản lý và sử dụng Ngân sách.
Đồng thời, trên cơ sở kết quả kiểm toán, Kiểm toán nhà nước cũng đã có kiến nghị, đề xuất với Bộ Tài chính và các bộ, ban ngành có chức năng trong việc sửa đổi và hoàn thiện Luật Ngân sách Nhà nước.
2.3.2.2. Kiểm toán chương trình đầu xây dựng cơ bản.
Kiểm toán nhà nước đã tiến hành kiểm toán mười bốn công trình trọng điểm quốc gia, nhiều chương trình mục tiêu của Chính phủ và công trình xây dựng cơ bản của các địa phương, kết quả đã thu hồi, giảm cấp phát cho Ngân sách hàng trăm tỉ đồng. Đồng thời, Kiểm toán nhà nước cũng phát hiện những tồn tại trong công tác quản lý các chương trình đầu tư xây dựng cơ bản, và đề ra những kiến nghị đối với đơn vị được kiểm toán và các cơ quan chức năng để khắc phục những tồn tại đó.
2.3.2.3. Kiểm toán doanh nghiệp nhà nước.
Trong những năm qua, Kiểm toán nhà nước đã tiến hành kiểm toán các Tổng công ty 90 và 91 cùng một số doanh nghiệp hạng đặc biệt; kết quả kiểm toán đã thu về thêm cho Ngân sách Nhà nước gần một nghìn tỉ đồng. Kiểm toán nhà nước cũng phát hiện ra những hạn chế trong công tác quản lý tài chính tại các doanh nghiệp, từ đó đề xuất những kiến nghị phù hợp với các doanh nghiệp và các cơ quan chức năng, nhằm nâng cao hiệu quả quản lý tài chính doanh nghiệp.
Kiểm toán nhà nước đã giúp Bộ Tài chính nghiên cứu, soạn thảo và ban hành các chuẩn mực kiểm toán, các quy trình kiểm toán chủ yếu, các cơ chế hoạt động kiểm toán trên cơ sở tiếp thu kinh nghiệm quốc tế và áp dụng phù