gồm đường pentose và gốc phosphat • Ưa nước • Các gốc OH của đường đều hình thành liên kết hydrogen với phân tử nước
Đặc tính của base nitơ ảnh hưởng lên cấu trúc 3 chiều của acid nucleic
• Purin và pyrimidine tự do là base yếu
• Có đặc tính liên hợp cao cấu trúc, phân bố ion, hấp thụ ánh sáng UV (260 nm) của acid nucleic
• Cộng hưởng giữa các nguyên tử trong
vòng làm cho các liên kết có đặc tính liên kết đôi 1 phần
• Pyrimidine là phân tử có cấu trúc phẳng
• Purin thì hơi phẳng vì có 1 chút gấp khúc
• Base kị nước nên khó tan ở pH 7 tế bào.
• Tăng, giảm pH thì acid nucleic tan trong nước dễ hơn
Đặc tính của base nitơ ảnh hưởng lên cấu trúc 3 chiều của acid nucleic
Tương tác kị nước xếp chồng (hydrophobic stacking interaction)
• Các base trong cấu trúc acid nucleic xếp chồng lên nhau như xếp chồng các đồng xu
• Các chồng base liên quan đến tương tác
Van der Waals và tương tác lưỡng cực giữa các base
• Xếp chồng ít tiếp xúc với nước và ổn định cấu trúc 3 chiều của acid nucleic.
Các lực liên kết giúp hình thành DNA xoắn đôi
• Trục liên kết phosphat
• Tương tác xếp chồng (stacking interaction)
• Tương tác kị nước: trục phosphat mang
điện tích âm cao đối lại với các base không phân cực
• Liên kết hydro: duy trì khoảng cách giữa hai trục đường phosphat
DNA• Gồm 2 chuỗi