cục trưởng gồm có:
1.Ban Hỗ trợ Người nộp thuế;
2.Ban Kê khai và kế toán thuế;
3.Ban Quản lý nợ và cưỡng chế nợ thuế;
4.Ban Thanh tra;
5.Ban Pháp chế;
6.Ban Tuyên truyền - Thi đua;
7.Ban Cải cách và hiện đại hoá;
8.Ban Chính sách thuế; 9.Ban Kiểm tra nội bộ;
10.Ban Dự toán thu thuế; 11.Ban Quản lý thuế Thu nhập cá nhân;
12. Ban Hợp tác quốc tế; 13.Ban Tổ chức cán bộ; 14.Ban Tài vụ - quản trị; 15.Văn phòng; 1.Phòng Tuyên truyền - Hỗ trợ; 2.Phòng Kê khai và kế toán thuế; 3.Phòng Quản lý nợ và cưỡng chế nợ thuế; 4.Một số Phòng kiểm tra giám sát
kê khai thuế;
5.Một số Phòng Thanh tra;
6.Phòng Tổng hợp - Nghiệp vụ - Dự toán;
7.Phòng Quản lý thuế Thu nhập cá nhân;
8.Phòng Kiểm tra nội bộ; 9.Phòng Tổ chức cán bộ; 10.Phòng Hành chính - Quản trị - Tài vụ (có cả ấn chỉ). + Có số thu trên 300 tỷ/năm trở lên
1.Đội Tuyên truyền và hỗ trợ Người nộp thuế;
2.Đội Kê khai, kế toán thuế và tin học;
3.Đội Quản lý nợ và cưỡng chế nợ thuế;
4.Đội Kiểm tra thuế 5.Đội Quản lý thu lệ phí trước bạ và thu khác;
6.Đội Quản lý Thuế thu nhập cá nhân; 7.Đội Nghiệp vụ - dự toán (gồm cả chức năng pháp chế); 8.Đội Hành chính - Nhân sự - Tài vụ - Quản trị-Ấn chỉ
9. Đội kiểm tra nội bộ 10.Một số Đội thuế liên xã, phường.
+ Có số thu dưới 300 tỷ/năm trở lên : không có Đội Kiểm tra nội bộ
16.Cục ứng dụng Công nghệ thông tin.
17.Đại diện Tổng cục Thuế tại thành phố Hồ Chí Minh;