Chương 2 : Tổng quan tài liệu
2.3 Khái quát về thực khuẩn thể trong phòng trừ sinh học
2.3.4 Phân loại thực khuẩn thể
Trong tự nhiên, các TKT đa dạng về virion, bộ gen, cách thức tồn tại,… Ủy ban Quốc tế về phân loại virus (ICTV: International Committee on Taxonomy of Viruses) đã phân loại thực khuẩn thể dựa trên hình thái và acid nucleic. Có tất cả 19 họ được ICTV cơng nhận là có khả năng ký sinh trên vi khuẩn và vi khuẩn cổ. Trong số đó, chỉ có 2 họ có bộ gen là ARN, 5 họ được bao bọc bên ngồi (có vỏ ngồi). Trong số những họ có vật liệu di truyền là ADN thì chỉ có hai họ là sợi đơn; 8 họ có bộ gen là dạng vịng trong khi 9 họ cịn lại là ADN dạng thẳng. Có 9 họ khơng gây bệnh trên vi khuẩn cổ, 9 họ chỉ gây bệnh trên vi khuẩn cổ và riêng họ Tectiviridae là gây bệnh trên cả vi khuẩn và vi khuẩn cổ (Hình 2.9) (Grath & Sinderen, 2007).
Hình 2.9: Hình thái các nhóm thực khuẩn thể cơ bản (Ackermann, 2009)
Dựa vào hình thái, thực khuẩn thể có thể có dạng sợi xoắn hay khơng xoắn, khơng đi hoặc có đi, và thậm chí một số thực khuẩn thể với một vỏ bọc chứa lipid hoặc có chứa chất béo trong vỏ hạt. Điều này làm cho thực khuẩn thể là nhóm virus lớn nhất trong tự nhiên với số lượng có khoảng 1032
thực khuẩn thể trong sinh quyển, cao hơn cả mật số vi khuẩn (Kutter & Sulakvelidze, 2004; Kurtboke, 2012). Hiện nay, hơn 5500 thực khuẩn thể đã được kiểm tra trong kính hiển vi điện tử. Trong đó, thực khuẩn thể khơng đi bao gồm khoảng 190 loài đã biết và phân thành 10 họ nhỏ. Thực khuẩn thể có đi chiếm 96% số thực khuẩn thể được biết đến và được tìm thấy ở khắp mọi
nơi, chúng được xếp vào bộ Caudoviriales và được chia thành ba họ (Myoviridae, Podoviridae, Siphoviridae) (Ackermann, 2004) (Hình 2.9 và Hình 2.10), những họ này là đối tượng được nghiên cứu nhiều nhất về sinh hóa và cấu trúc.
Hình 2.10: So sánh 3 họ trong bộ phage đuôi Caudoviriales: Myoviridae,
Podoviridae và Siphoviridae (Nguồn: Harper, 2011; trích dẫn bởi Fariza & Zaman, 2014 )