Nhà tài trợ:
OUCRU (Quỹ Wellcome) Đại học Leiden, Hà Lan
Nghiên cứu viên chính:
PGS. Ronald Geskus, TS. Lê Thanh Hồng Nhật,
TS. Marc Choisy (thuộc Nhóm mơ hình COVID-19 của OUCRU)
Cộng tác cùng:
TS. Phạm Quang Thái, Khoa Kiểm soát Bệnh Truyền nhiễm, Viện Vệ Sinh Dịch Tễ Trung Ương (NIHE),
Vera Arntzen và TS. Marta Fiocco (Đại học Leiden).
Địa điểm nghiên cứu:
Hà Nội và Thành phố Hồ Chí Minh, Việt Nam.
Thời gian từ khi nhiễm bệnh đến khi có khả năng truyền bệnh (thời gian tiềm ẩn) và phát triển triệu chứng (thời gian ủ bệnh) là đặc điểm chính của bất kỳ nhiễm trùng nào. Với SARS-CoV-2, dữ liệu để có thể ước tính cả hai đại lượng này khơng được thu thập một cách hệ thống. Do đó, thơng tin khơng đầy đủ và có nguy cơ sai lệch cao. Đối với hầu hết các ca bệnh, chúng ta không biết thời gian nhiễm bệnh chính xác. Nhiều nhất là chúng ta có thơng tin về khoảng thời gian phơi nhiễm của một người bị nhiễm bệnh. Ngồi ra, có một tỷ lệ lớn người bệnh khơng có triệu chứng, và những người này có nhiều khả năng bị bỏ sót trong q trình thu thập dữ liệu.
Thiết kế nghiên cứu:
Từ khi bắt đầu đại dịch đến tháng 7/2021 , Việt Nam đã thực hiện truy vết chủ động với người tiếp xúc của tất cả những người nhiễm bệnh trong cộng đồng và cách ly những “người tiếp xúc F1” này tại các địa điểm được giám sát. Từ tháng 3/2020, tất cả các cá nhân nhập cảnh vào Việt Nam đều được cách ly. Việt Nam đã trải qua bốn đợt bùng phát dịch lớn do ít nhất ba biến thể khác nhau gây ra - biến thể ban đầu, biến thể Alpha và biến thể Delta. Chúng tôi phối hợp với NIHE và Trung tâm Kiểm soát bệnh tật Thành phố Hồ Chí Minh để tổng hợp dữ liệu từ các nguồn khác nhau và các đợt dịch để thiết lập bộ dữ liệu duy nhất chứa thông tin đại diện về các giai đoạn đầu nhiễm SARS-CoV-2 và quá trình phát triển bệnh. Dữ liệu truy vết người tiếp xúc cung cấp thông tin về khung thời gian tiếp xúc. Đối với thời gian tiềm ẩn, chúng tôi giả định rằng các cá nhân trở nên lây nhiễm khi SARS-CoV-2 RNA có thể phát hiện được. Thơng tin này có được nhờ kết quả thử nghiệm phản ứng chuỗi polymerase (PCR).
Đối với thời gian ủ bệnh, chúng tôi sử dụng thời gian bệnh nhân báo cáo các triệu chứng gợi ý nhiễm SARS-CoV-2 lần đầu tiên, những cá nhân khơng có triệu chứng sẽ bị loại trừ. Dữ liệu về thời gian tiềm ẩn được chặn khoảng kép. Không chỉ mốc thời gian đầu (nhiễm bệnh) mà cả thời gian có khả năng truyền bệnh (RNA có thể phát hiện) nằm trong một khoảng thời gian: có thể phát hiện RNA mỗi khi thực hiện xét nghiệm PCR. Đối với thời gian ủ bệnh, chúng tơi có thơng tin chính xác về thời gian bệnh nhân bắt đầu có triệu chứng của hầu hết các bệnh nhân, vì thế, chỉ có mốc thời gian đầu được chặn. Chúng tơi ước tính cả hai phân phối bằng cách tối đa hóa khả năng xảy ra đối với dữ liệu được chặn khoảng kép. Chúng tơi so sánh các ước tính cho các biến thể khác nhau.
Tác động:
Thời gian cách ly được tính tốn dựa trên các ước tính về phân bố thời gian ủ bệnh vì thiếu dữ liệu về thời gian tiềm ẩn. Dự án của chúng tôi sẽ giải quyết lỗ hổng này bằng cách ước tính phân bố thời gian tiềm ẩn. Hơn nữa, thời gian tiềm ẩn và thời gian ủ bệnh là những thành phần quan trọng trong các mơ hình tốn học định lượng và dự đoán sự lây lan của SARS-CoV-2.
Kết quả cho đến nay:
Pham Quang Thai, Rabaa M, Duong Huy Luong et al. The First 100 Days of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Control in Viet Nam. Clinical Infectious Diseases [Internet] 2020,72(9):e334-e342. Available from: https://doi.org/10.1093/cid/ciaa1130
Danh mục các Dự án Nghiên cứu và Kết nối trong Ứng phó với Đại dịch COVID-19 | Tháng 2/2022
52