Việc ứng dụng Công nghệ thông tin vào nghiệp vụ thanh toán liên kho bạc là hết sức cần thiết, tuy nhiên nó cũng đặt ra cho ngành KBNN nhiều vấn đề cần phải giải quyết. Từ nền tảng công nghệ chưa có gì đến ứng dụng thanh toán liên kho bạc bằng các máy tính đơn lẻ đặt tại từng KBNN tỉnh đã là cả một nỗ lực của ngành.
Tới nay, với một hệ thống mạng diện rộng trải khắp các KBNN từ tỉnh đến huyện trên toàn quốc, ngành KBNN đã có trong tay một hệ thống thanh toán liên kho bạc rất mạnh. Tuy nhiên để duy trì và ngày càng phát triển những thành quả đã có, ngành KBNN đã và đang phải quan tâm, giải quyết tốt nhiều yêu cầu đặt ra trong điều kiện hiện nay, có như vậy hệ thống công nghệ thông tin trong thanh toán liên kho bạc mới tiếp tục phát huy được sức mạnh và phát triển trong những năm tới.
Có thể khái quát các yếu tố tác động đến ứng dụng công nghệ thông tin vào nghiệp vụ thanh toán liên kho bạc như sau:
- Về chế độ nghiệp vụ: Tuy đã được xây dựng từ trước với những qui định rất chặt chẽ, đảm bảo yêu cầu về an toàn tiền, tài sản Quốc gia nhưng trong những giai đoạn mới cũng cần phải nghiên cứu làm sao cho chế độ nghiệp vụ vẫn giữ được tính chặt chẽ nhưng vẫn phù hợp và dễ dàng khi kết hợp với công nghệ thông tin.
- Về cơ sở vật chất: Đây là vấn đề rất nan giải với hầu hết các đơn vị có ứng dụng Công nghệ thông tin không riêng với ngành KBNN. Có trong tay một hệ
thống thiết bị hiện đại, mạnh cả về chất lượng va số lượng luôn là vấn đề hết sức chăn chở. Hiện tại sự phát triển rất nhanh của công nghệ làm cho việc trang bị công nghệ mới tại các đơn vị sử dụng ngân sách nhà nước rất khó khăn.
Ngành KBNN những năm qua đã tranh thủ sự hỗ trợ rất nhiều của Bộ Tài chính và các dự án hợp tác với nước ngoài. Qua thời gian ứng dụng Tin học trên 10 năm, vừa sử dụng vừa nâng cấp tới nay số lượng và chất lượng các thiết bị tin học và phần mềm của ngành đã tương đối đầy đủ. Vấn đề đặt ra trong các năm tiếp theo là tiếp tục duy trì và bổ sung thiết bị công nghệ để bắt kịp với sự phát triển Công nghệ và đáp ứng yêu cầu của nền kinh tế.
- Về nguồn nhân lực: Trong những năm qua, để ứng dụng Tin học thành công có sự đóng góp rất nhiều của đội ngũ những người làm Tin học trong ngành KBNN. Với đội ngũ cán bộ hiện có, ngành KBNN đã đầu tư rất nhiều vào công tác đào tạo nâng cao trình độ chuyên môn, đồng thời cũng có nhiều hình thức khuyến khích động viên sự công hiến của đội ngũ cán bộ Tin học cho ngành. Trong những năm tới, để tiếp tục phát triển những gì đã có, KBNN đang xây dựng những chiến lược đào tạo rất sâu và rộng để đội ngũ cán bộ Tin học ngày càng mạnh cả về chất và lượng.