Nguồn lực đầu tư về vốn cho thực hiện các công trình, dự án còn thiếu: huyện Vị Xuyên thuộc vùng kinh tế trọng điểm của tỉnh Hà Giang, với vị trí địa lý đặc biệt (giáp nước Trung Quốc, thành phố Hà Giang, có cửa khẩu kinh tế Thanh Thủy,...), huyện đang trong quá trình đô phát triển về mọi mặt nên nhu cầu về nguồn kinh phí để đầu tư xây dựng cơ sở hạ tầng, thực hiện các công trình dự án phát triển kinh tế - xã hội lớn, tuy nhiên nguồn vốn trong và ngoài ngân sách Nhà nước không đáp ứng đủ số lượng công trình, dự án cần triển khai dẫn đến việc thực hiện công trình, dự án trong năm kế hoạch được thấp.
Cơ chế chính sách để thu hút đầu tư vào địa bàn huyện còn nhiều hạn chế: Thủ tục về phân vốn đầu tư còn chậm; công tác bồi thường, giải phóng mặt bằng để tạo quỹ đất sạch thu hút các nhà đầu tư còn vướng mắc nên công trình, dự án bị chậm triển khai so với kế hoạch.
Các công trình, dự án trong quá trình xây dựng dự án tiền khả thi để xin chấp thuận chủ trương đầu tư chưa được tính toán đầy đủ nguồn vốn, số vốn để thực hiện, khả năng đáp ứng về đất đai, nguồn nhân lực và kỹ thuật thực hiện nên dù đã có chủ trương đầu tư nhưng nhà đầu tư không thể thực hiện (công trình các trường chuyên nghiệp của tỉnh tại xã Phong Quang) hoặc chưa bố trí đưa vào thực hiện (67 công trình dự án trong kế hoạch sử dụng đất năm 2017 chưa thực hiện chuyển tiếp sang năm 2018).
Việc đăng ký nhu cầu sử dụng đất của các cơ quan, tổ chức, cá nhân còn chủ quan: Các đơn vị đã xác định được nhu cầu sử dụng đất tuy nhiên chưa xác định được công trình cụ thể được thực hiện nên đã đưa toàn bộ công trình, dự án dự kiến thực hiện vào kế hoạch sử dụng đất, do điều kiện thực tế về nguồn vốn hoặc do các nguyên nhân khác, các công trình này không thực hiện được, dẫn đến tỷ lệ các công trình, dự án thực hiện được đạt thấp (19 công trình trạm biến áp và cấp điện, 14 công trình trạm BTS...).
Việc tổ chức thực hiện kế hoạch sử dụng đất đã được phê duyệt chưa được các cấp, các ngành quan tâm sát sao, sự phối hợp giữa các ngành có liên quan chưa đồng bộ: Khi tiến hành lập kế hoạch sử dụng đất hàng năm, cơ quan chuyên môn là phòng Tài nguyên và Môi trường đã tham mưu cho UBND huyện ban hành văn bản tạo điều kiện để các cơ quan, ban ngành đăng ký nhu cầu sử dụng đất, tuy nhiên việc đăng ký nhu cầu này chưa được quan tâm đúng mức, dẫn đến trong năm 2017 phát sinh 1 số công trình, dự án có sử dụng đất không nằm trong kế hoạch, gây khó khăn về thủ tục cho cả nhà đầu tư thực hiện dự án và tạo áp lực trong công tác quản lý Nhà nước về đất đai của huyện.