HND huyện cần làm tốt chức năng kiểm tra, kiểm soát nội bộ đảm bảo cho Quỹ HTND hoạt động lành mạnh, an toàn. Ban điều hành Quỹ HTND huyện tăng cường công tác kiểm tra, hướng dẫn nghiệp vụ đối với hoạt động của Quỹ HTND các xã, thị trấn. Tăng cường công tác kiểm tra, hướng dẫn các cán bộ cơ sở về công tác vận động tăng trưởng quỹ, quản lý tài chính, sử dụng vốn và hiệu quả vốn vay đối với các cá nhân, tổ chức được hỗ trợ vốn.
Xử lý nghiêm các trường hợp cán bộ Hội làm trái Điều lệ và Quy chế hoạt động của Quỹ HTND, các trường hợp người vay sử dụng vốn sai mục đích, chiếm dụng, xâm tiêu vốn, phí.
Trước khi quyết định cho vay, cán bộ thực hiện thẩm định cần đến từng hộ gia đình, kiểm tra thực tế khả năng trả nợ, năng lực SXKD của hộ cũng như các điều kiện đảm bảo tính khả thi, tính hiệu quả trong SXKD của hộ.
Sau khi cấp vốn vay, Quỹ HNDT và HND cơ sở theo dõi giám sát việc sử dụng vốn vay tại các hộ. Hoạt động kiểm tra cần hướng vào việc xem xét liệu vốn vay đã được dùng đúng mục đích, liệu nông dân nắm được kỹ thuật sử dụng vốnvay có hiệu quả? có thể rủi ro nào sẽ xảy ra? có các biện pháp nào cần điều chỉnh? chỉ có trên cơ sở như vậy, cán bộ nghiệp vụ mới kịp thời giúp đỡ khắc phục những khó khăn phát sinh trong quá trình sử dụng vốn vay của Quỹ HTND. Cần kết hợp chặt chẽ với các tổ chức chính quyền, đoàn thể địa phương trong việc hướng dẫn kiểm tra, sử dụng vốn vay và thu hồi vốn vay Quỹ HTND.
Công tác kiểm tra của Quỹ HTND phải đạt được những yêu cầu kiểm tra, phối hợp với Ban kiểm tra của Hội, hàng năm phải xây dựng kế hoạch kiểm tra riêng biệt, không lồng ghép với kiểm tra công tác HND, trình Thường trực Hội phê duyệt thực hiện. Tăng cường công tác kiểm tra, kiểm soát nhằm phát hiện những thiếu sót, kịp thời uốn nắn sai phạm, hạn chế thấp nhất các hành vi tiêu cực, để góp phần lành mạnh hoá hoạt động Quỹ HTND. Công tác kiểm tra phải bằng nhiều hình thức như kiểm tra tại chỗ, kiểm tra định kỳ, kiểm tra đột xuất, cụ thể:
kiểm tra để xác minh đối tượng vay, tình hình sử dụng vốn vay của người vay. - Kiểm tra đột xuất khi phát hiện người vay có dấu hiệu sử dụng vốn sai mục đích, làm ăn thất thoát vốn vay hoặc hoạt động của chi, tổ Hội vi phạm nguyên tắc như thu phí của người vay nhưng không nộp lên cấp trên.
- Kiểm tra của Ban Điều hành Quỹ HTND tổ chức tiến hành, nhằm thực hiện sự giám sát, kiểm tra trong hệ thống, đảm bảo tính nghiêm minh khách quan.
Sau kiểm tra, nếu có sai phạm như: xâm tiêu, chiếm dụng, sử dụng vốn sai mục đích... nghiêm túc xử lý.