và RAPD
- Mồi OPT – 01
Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm PCR sử dụng mồi OPT-01 được thể hiện trong hình 4.5 dưới đây:
Ghi chú:
Giếng M: Marker Giếng 6: CBH1 Giếng M: Marker Giếng 17: CS5 Giếng 1: XĐCP Giếng 7: C36 Giếng12: SO19 Giếng 18: CS4 Giếng 2: CMV Giếng 8: SO1 Giếng 13: SO6 Giếng 19: QN Giếng 3: CC Giếng 9: CHS Giếng 14: SO32 Giếng 20: XĐNA Giếng 4: OC Giếng 10: MVL Giếng 15: CBH5
Giếng 5: HY Giếng11: SO16 Giếng 16: CS1
Kết quả cho thấy, với mồi OPT-01 chỉ có 2 mẫu có hình thành sản phẩm PCR gồm các mẫu C36 và mẫu CS4. Trong đó, mẫu C36 hình thành 4 băng DNA có kích thước 200bp và mẫu CS4 hình thành 2 băng DNA có kích thước 350bp. Các mẫu còn lại không xuất hiện băng DNA vậy mồi OPT-01 không thể hiện tính đa hình với các mẫu trên.
- Mồi OPA – 04
Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm PCR sử dụng mồi OPA-04 được thể hiện trong hình 4.6 dưới đây:
Hình 4.6: Kết quả điện di kiểm tra PCR với mồi OPA – 04
Ghi chú:
Giếng M: Marker Giếng 6: CBH1 Giếng M: Marker Giếng 17: CS5 Giếng 1: XĐCP Giếng 7: C36 Giếng12: SO19 Giếng 18: CS4 Giếng 2: CMV Giếng 8: SO1 Giếng 13: SO6 Giếng 19: QN Giếng 3: CC Giếng 9: CHS Giếng 14: SO32 Giếng 20: XĐNA Giếng 4: OC Giếng 10: MVL Giếng 15: CBH5
Kết quả cho thấy, với mồi OPA-04 có 16 mẫu có hình thành sản phẩm PCR gồm các mẫu XĐCP, CMV, OC, HY, CBH1, C36, SO1, CHS, MVL, SO16, SO19, SO32, CS1, CS5, CS4, XĐNA. Trong đó, các mẫu (C36, SO32, CS4, MVL) hình thành 2 băng DNA có kích thước 200bp; các mẫu (XĐCP, CMV, OC, HY, CHB1, CHS, CS1, SO19, CS5) hình thành 3 băng DNA có kích thước 200bp; các mẫu (SO1, SO16) hình thành 1 băng DNA có kích thước 600bp; mẫu (XĐNA) hình thành 1 băng có kích thước 750bp. Các mẫu còn lại không hình thành băng DNA vậy mồi OPA-04 không thể hiện tính đa hình với các mẫu nghiên cứu trên.
- Mồi OPA – 08
Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm PCR sử dụng mồi OPA-08 được thể hiện trong hình 4.7 dưới đây:
Hình 4.7: Kết quả điện di PCR với mồi OPA – 08
Ghi chú:
Giếng 1: XĐCP Giếng 7: C36 Giếng 12: SO19 Giếng 18: CS4 Giếng 2: CMV Giếng 8: SO1 Giếng 13: SO6 Giếng 19: QN Giếng 3: CC Giếng 9: CHS Giếng 14: SO32 Giếng 20: XĐNA Giếng 4: OC Giếng10: MVL Giếng 15: CBH5 Giếng M: Marker Giếng 5: HY Giếng 11: SO16 Giếng 16: CS1
Giếng 6: CBH1 Giếng M: Marker Giếng 17: CS5
Kết quả cho thấy, với mồi OPA-08 có 12 mẫu có hình thành sản phẩm PCR gồm các mẫu XĐCP, CMV, CC, OC, HY, CH1, C36, SO16, SO19, SO6, CBH5. Trong đó, mẫu (CC, CBH5) hình thành 2 băng DNA có kích thước 300bp; mẫu (XĐCP) có hình thành 4 băng DNA có kích thước 100bp; mẫu (CMV, CBH1, C36) hình thành 3 băng có kích thước 300bp; mẫu (HY) hình thành 3 băng với kích thước 400bp; ở các mẫu (OC, SO16, SO19, SO6) hình thành lên 1 băng DNA với
kích thước của OC là 500bp và các mẫu SO16, SO19, SO6 có kích thước là 300bp; mẫu (SO32) hinh thành 3 băng DNA với kích thước 150bp. Các mẫu (SO1, CHS, MVL, CS1, CS5, CS4, QN, XĐNA) không xuất hiện băng vạch DNA vậy mồi OPA- 08 không thể hiện tính đa hình với các mẫu nghiên cứu trên.
- Mồi OPG – 17
Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm PCR sử dụng mồi OPT-01 được thể hiện trong hình 4.8 dưới đây
Hình 4.8: Kết quả điện di PCR- mồi OPG – 17
Ghi chú:
Giếng M: Marker Giếng 6: CBH1 Giếng M: Marker Giếng 17: CS5 Giếng 1: XĐCP Giếng 7: C36 Giếng12: SO19 Giếng 18: CS4 Giếng 2: CMV Giếng 8: SO1 Giếng 13: SO6 Giếng 19: QN Giếng 3: CC Giếng 9: CHS Giếng 14: SO32 Giếng 20: XĐNA Giếng 4: OC Giếng 10: MVL Giếng 15: CBH5
Giếng 5: HY Giếng11: SO16 Giếng 16: CS1
Kết quả cho thấy, với mồi OPG-17 có 19 mẫu có hình thành sản phẩm PCR gồm các mẫu (XĐCP, CMV, CC, OC, HY, CBH1, C36, SO1, CHS, MVL, SO16, SO19, SO6, SO32, CBH5, CS1, CS5, CS4, QN). Trong đó, mẫu (CMV, CC) hình thành 3 băng DNA có kích thước 400bp; mẫu (CS1) hình thành 2 băng DNA có kích thước 350bp; các mẫu (CBH1,C36, CHS, MVL) hình thành 7 băng DNA với kích thước 300bp; các mẫu (HY, SO1, SO16) hình thành lên 8 băng DNA với kích thước 320bp; các mẫu (SO32, CS4) hình thành 4 băng DNA với kích thước 500bp; các mẫu (SO19, CBH5, QN) hình thành 2 băng DNA với kích thước 800bp; mẫu (SO6) hình thành 1 băng DNA với kích thước 1000bp; mẫu (CS5) hình thành 5
băng DNA với kích thước 550bp; mẫu OC hình thành 3 băng DNA với kích thước 300bp; mẫu XĐCP hình thành 6 băng với kích thước 300bp. Mẫu XĐNA không xuất hiện băng DNA vậy mồi OPG-17 không thể hiện tính đa hình với các mẫu nghiên cứu trên.
- Mồi OPM – 13
Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm PCR sử dụng mồi OPM- 13 được thể hiện trong hình 4.9 dưới đây.
Hình 4.9: Kết quả điện di PCR- mồi OPM – 13
Ghi chú:
Giếng M: Marker Giếng 6: CBH1 Giếng M: Marker Giếng 17: CS5 Giếng 1: XĐCP Giếng 7: C36 Giếng12: SO19 Giếng 18: CS4 Giếng 2: CMV Giếng 8: SO1 Giếng 13: SO6 Giếng 19: QN Giếng 3: CC Giếng 9: CHS Giếng 14: SO32 Giếng 20: XĐNA Giếng 4: OC Giếng 10: MVL Giếng 15: CBH5
Giếng 5: HY Giếng 11: SO16 Giếng 16: CS1
Kết quả điện di PCR của 20 mẫu cam, quýt với mồi OPM-13 cho ta thấy 0 có phân đoạn DNA nào được khuếch đại. Với kết quả thu được ta thấy mồi OPM-13 không thể hiện tính đa hình với các mẫu nghiên cứu trên.
- Mồi OPC – 08
Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm PCR sử dụng mồi OPC-08 được thể hiện trong hình 4.10 dưới đây:
Kết quả cho thấy, với mồi OPC-08 có 8 mẫu có hình thành sản phẩm PCR gồm các mẫu XĐCP, CMV, HY, CBH1, C36, MVL, CS4, QN. Trong đó, mẫu XĐCP hình thành 3 băng DNA có kích thước 750bp; mẫu CMV hình thành 1 băng DNA có kích thước 750bp; mẫu HY hình thành 5 băng DNA có kích thước 150bp; mẫu CBH1 hình thành 2 băng DNA có kích thước 300bp; mẫu C36 hình thành 1
vạch có kích thước 500bp; mẫu MVL hình thành 4 vạch có kích thước 200bp; mẫu CS4 hình thành 3 băng có kích thước 200bp; mẫu QN hình thành 1 băng có kích thước 400bp. Các mẫu còn lại không xuất hiện băng vạch, mồi OPC- 18 không thể hiện tính đa hình với các mẫu nghiên cứu trên.
Hình 4.10: Kết quả điện di PCR- mồi OPC–08
Ghi chú:
Giếng M: Marker Giếng 6: CBH1 Giếng M: Marker Giếng 17: CS5 Giếng 1: XĐCP Giếng 7: C36 Giếng12: SO19 Giếng 18: CS4 Giếng 2: CMV Giếng 8: SO1 Giếng 13: SO6 Giếng 19: QN Giếng 3: CC Giếng 9: CHS Giếng 14: SO32 Giếng 20: XĐNA Giếng 4: OC Giếng 10: MVL Giếng 15: CBH5
Giếng 5: HY Giếng 11: SO16 Giếng 16: CS1
- Mồi OPG – 16
Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm PCR sử dụng mồi OPG- 16 được thể hiện trong hình 4.11 dưới đây.
Hình 4.11: Kết quả điện di PCR- mồi OPG – 16
Ghi chú:
Giếng M: Marker Giếng 6: CBH1 Giếng M: Marker Giếng 17: CS5 Giếng 1: XĐCP Giếng 7: C36 Giếng12: SO19 Giếng 18: CS4 Giếng 2: CMV Giếng 8: SO1 Giếng 13: SO6 Giếng 19: QN Giếng 3: CC Giếng 9: CHS Giếng 14: SO32 Giếng 20: XĐNA
Giếng 4: OC Giếng 10: MVL Giếng 15: CBH5 Giếng 5: HY Giếng 11: SO16 Giếng 16: CS1
Kết quả cho thấy, với mồi OPG-16 có 12 mẫu có hình thành sản phẩm PCR gồm các mẫu XĐCP, OC, HY, C36, SO1, MVL, SO16, SO19, SO6, CS1, CS5, CS4. Trong đó, mẫu (XĐCP) hình thành 2 băng DNA có kích thước 300bp; các mẫu OC, HY, C36, hình thành 4 băng DNA có kích thước 300bp; mẫu SO1 hình thành 4 băng có kích thước 270bp; mẫu MVL hình thành 3 băng có kích thước 270bp; mẫu SO16 hình thành 2 băng có kích thước 300bp; mẫu SO19, SO6 hình thành 1 băng với kích thước 300bp; mẫu CS5, CS1 hình thành 2 băng với kích thước 300bp; mẫu CS4 hình thành 3 băng có kích thước 600bp. Các mồi còn lại không xuất hiện băng vạch DNA, vậy mồi OPG-16 không thể hiện tính đa hình với các mẫu nghiên cứu trên.
- Mồi OPO – 04
Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm PCR sử dụng mồi OPO- 04 được thể hiện trong hình 4.12 dưới đây.
Hình 4.12: Kết quả điện di PCR- mồi OPO – 04
Ghi chú:
Giếng M: Marker Giếng 6: CBH1 Giếng 12: SO19 Giếng 18: CS4 Giếng 1: XĐCP Giếng 7: C36 Giếng 13: SO6 Giếng 19: QN Giếng 2: CMV Giếng 8: SO1 Giếng 14: SO32 Giếng 20: XĐNA Giếng 3: CC Giếng 9: CHS Giếng 15: CBH5 Giếng M: Marker Giếng 4: OC Giếng 10: MVL Giếng 16: CS1
Giếng 5: HY Giếng 11: SO16 Giếng 17: CS5
Kết quả cho thấy, với mồi OPO -04 có 6 mẫu có hình thành sản phẩm PCR gồm các mẫu XĐCP, CMV, HY, SO1, SO32, CS1. Trong đó, các mẫu XĐCP và
HY hình thành 3 băng DNA có kích thước 500bp; mẫu CMV hình thành 2 băng DNA có kích thước 1000bp; mẫu SO1 hình thành 4 băng với kích thước 300bp; mẫu SO32 hình thành 2 băng với kích thước 1000bp; mẫu CS1 hình thành 4 băng với kích thước 500bp. Các mẫu còn lại không xuất hiện băng sáng vậy mồi OPO- 04 không thể hiện tính đa hình trên các mẫu trên.
- Mồi OPQ – 18
Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm PCR sử dụng mồi OPT-01 được thể hiện trong hình 4.13 dưới đây.
Hình 4.13: Kết quả điện di PCR- mồi OPQ – 18
Ghi chú:
Giếng M: Marker Giếng 6: CBH1 Giếng M: Marker Giếng 17: CS5 Giếng 1: XĐCP Giếng 7: C36 Giếng12: SO19 Giếng 18: CS4 Giếng 2: CMV Giếng 8: SO1 Giếng 13: SO6 Giếng 19: QN Giếng 3: CC Giếng 9: CHS Giếng 14: SO32 Giếng 20: XĐNA Giếng 4: OC Giếng 10: MVL Giếng 15: CBH5
Giếng 5: HY Giếng 11: SO16 Giếng 16: CS1
Kết quả cho thấy, với mồi OPQ-08 có 8 mẫu có hình thành sản phẩm PCR gồm các mẫu XĐCP, CMV, OC, CBH1, MVL, SO6, CBH5, CS5. Trong đó, mẫu XĐCP hình thành 1 băng DNA có kích thước 500bp; các mẫu CMV, CBH1 hình thành 3 băng DNA có kích thước 150bp; mẫu OC hình thành 1 băng với kích thước 500bp; mẫu MVL hình thành 1 băng với kích thước 800bp; mẫu SO6 hình thành 1 băng vơi kích thước 150bp; mẫu CBH5 hình thành 1 băng với kích thước 700bp và mẫu CS5 hình thành 2 băng với kích thước 150bp. Các mẫu còn lại không xuất hiện băng DNA vậy mồi OPQ-08 không thể hiện tính đa hình trên các mẫu này.
- Mồi OPB – 18
Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm PCR sử dụng mồi OPB-18 được thể hiện trong hình 4.14 dưới đây.
Hình 4.14: Kết quả điện di PCR- mồi OPB – 18
Ghi chú:
Giếng M: Marker Giếng 6: CBH1 Giếng M: Marker Giếng 17: CS5 Giếng 1: XĐCP Giếng 7: C36 Giếng12: SO19 Giếng 18: CS4 Giếng 2: CMV Giếng 8: SO1 Giếng 13: SO6 Giếng 19: QN Giếng 3: CC Giếng 9: CHS Giếng 14: SO32 Giếng 20: XĐNA Giếng 4: OC Giếng 10: MVL Giếng 15: CBH5
Giếng 5: HY Giếng 11: SO16 Giếng 16: CS1
Kết quả cho thấy, với mồi OPB -18 chỉ có 2 mẫu có hình thành sản phẩm PCR gồm các mẫu C36 và mẫu MVL. Trong đó, mẫu C36 hình thành 4 băng DNA có kích thước 200bp và mẫu MVL hình thành 6 băng DNA có kích thước 120bp.Các mẫu còn lại không xuất hiện băng DNA vậy mồi OPB-18 không thể hiện tính đa hinh trên các mẫu này.
- Mồi ISSR- T1
Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm PCR sử dụng mồi ISSR- T1 được thể hiện trong hình 4.15 dưới đây.
Kết quả cho thấy, với mồi ISSR- T1 có 19 mẫu có hình thành sản phẩm PCR gồm các mẫu XĐCP, CMV, CC, OC, HY, CBH1, C36, SO1, CHS, MVL, SO16, SO19, SO6, SO32, CBH5, CS1, CS5, CS4, XĐNA. Trong đó, các mẫu XĐCP, OC, C36 hình thành 2 băng DNA có kích thước 300bp; các mẫu CMV, CC, CBH1 hình thành 3 băng DNA có kích thước 300bp; mẫu SO1 hình thành 4 băng với kích thước 300bp; các mẫu CHS, MVL, SO16 hình thành 4 băng với kích thước 300bp;
mẫu HY hình thành 5 băng với kích thước 300bp; các mẫu SO19, CS1, CS5, CS4 hình thành 2 băng DNA với kích thước 300bp; các mẫu SO6, SO32, CBH5 hình thành 1 băng với kích thước lần lượt là 450bp, 300bp, 1000bp ; mẫu XĐNA hình thành 4 băng với kích thước 180bp. Mẫu QN không xuất hiện băng vạch vậy mồi ISSR- T1 không thể hiện tính đa hình trên các mẫu.
Hình 4.15: Kết quả điện di PCR- ISSR mồi T1
Ghi chú:
Giếng M: Marker Giếng 6: CBH1 Giếng M: Marker Giếng 17: CS5 Giếng 1: XĐCP Giếng 7: C36 Giếng12: SO19 Giếng 18: CS4 Giếng 2: CMV Giếng 8: SO1 Giếng 13: SO6 Giếng 19: QN Giếng 3: CC Giếng 9: CHS Giếng 14: SO32 Giếng 20: XĐNA Giếng 4: OC Giếng 10: MVL Giếng 15: CBH5
Giếng 5: HY Giếng 11: SO16 Giếng 16: CS1
- Mồi ISSR- T2
Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm PCR sử dụng mồi ISSR-T2 được thể hiện trong hình 4.16 dưới đây.
Hình 4.16: Kết quả điện di PCR- ISSR mồi T2
Ghi chú:
Giếng M: Marker Giếng 6: CBH1 Giếng M: Marker Giếng 17: CS5 Giếng 1: XĐCP Giếng 7: C36 Giếng12: SO19 Giếng 18: CS4
Giếng 2: CMV Giếng 8: SO1 Giếng 13: SO6 Giếng 19: QN Giếng 3: CC Giếng 9: CHS Giếng 14: SO32 Giếng 20: XĐNA Giếng 4: OC Giếng 10: MVL Giếng 15: CBH5
Giếng 5: HY Giếng 11: SO16 Giếng 16: CS1
Kết quả cho thấy, với mồi ISSR-T2 chỉ có 9 mẫu có hình thành sản phẩm PCR gồm các mẫu CMV, HY, CBH1, C36, SO1, SO32, CS1, CS5, CS4. Trong đó, các mẫu mẫu CMV, HY, CBH1, C36, SO1, SO32, CS1, CS5, CS4 hình thành 1 băng DNA có kích thước 400bp. Các mẫu còn lại không xuất hiện băng DNA vậy mồi ISSR-T2 không thể hiện tính đa hình trên các mẫu còn lại.
- Mồi ISSR- T3
Kết quả điện di kiểm tra sản phẩm PCR sử dụng mồi ISSR- T3 được thể hiện trong hình 4.17 dưới đây.
Hình 4.17: Kết quả điện di PCR- ISSR mồi T3
Ghi chú:
Giếng M: Marker Giếng 6: CBH1 Giếng M: Marker Giếng 17: CS5 Giếng 1: XĐCP Giếng 7: C36 Giếng12: SO19 Giếng 18: CS4 Giếng 2: CMV Giếng 8: SO1 Giếng 13: SO6 Giếng 19: QN Giếng 3: CC Giếng 9: CHS Giếng 14: SO32 Giếng 20: XĐNA Giếng 4: OC Giếng 10: MVL Giếng 15: CBH5
Giếng 5: HY Giếng 11: SO16 Giếng 16: CS1
Kết quả cho thấy, với mồi ISSR-T3 có 15 mẫu có hình thành sản phẩm PCR gồm các mẫu XĐCP, CMV, CC, OC, HY, CBH1, C36, SO1, CHS, MVL, SO19, SO6, SO32, CS5, CS4. Trong đó, mẫu XĐCP, CMV, CC, HY, CBH1, C36, SO1, CHS, SO19, CS5, CS4 hình thành 3 băng DNA có kích thước 400bp; mẫu OC hình thành 4 băng DNA có kích thước 400bp; các mẫu MVL, SO6, SO32 hình thành 1
băng với kích thước lần lượt là 1000bp và 350bp. Các mẫu còn lại không xuất hiện băng DNA vậy mồi ISSR-T3 không thể hiện tính đa hình trên các mẫu còn lại.
Từ các kết quả nghiên cứu tính đa hình bằng 3 mồi ISSR và 10 mồi RAPD cho thấy, mồi OPM-13 không hình thành sản phẩm PCR ở tất cả các mẫu nghiên cứu. Mồi này không sử dụng để đánh giá đa hình của các dòng/giống cam nghiên cứu. Các cặp mồi còn lại đều tạo ra tính đa hình sản phẩm PCR cho phép sử dụng để đánh giá đa dạng di truyền của các dòng/giống cam nghiên cứu.