- Một số trục đƣờng trên địa bàn có hệ thống thoát nƣớc thải, nƣớc mƣa nhƣng chƣa hoàn chỉnh. Một số khác chủ yếu thoát nƣớc bằng rãnh khơi hoặc chảy tự nhiên. Về mùa mƣa lũ, hầu hết các trục đƣờng chính của thị xã bị ngập úng cục bộ. Nƣớc thải sinh hoạt chủ yếu tự thấm vào lòng đất hoặc chảy chung với cống thoát nƣớc mƣa nên gây ô nhiễm cho nguồn nƣớc mặt. Sông Thạch Hãn tiêu thoát nƣớc mƣa và nƣớc thải sinh hoạt của thị xã, CLN sông về mùa hè bị nhiễm mặn. Các ao hồ khu vực nội thị cũng là nơi tiêu thoát nƣớc và chƣa đƣợc nối với nhau thành hệ thống, CLN bắt đầu ô nhiễm.
- Các cơ sở sản xuất, kinh doanh đã nâng cao trách nhiệm và tự giác hơn trong công tác BVMT. Nhiều cơ sở đã đầu tƣ hệ thống XLNT, tuy nhiên vẫn còn một số cơ sở sản xuất, doanh nghiệp chƣa thực sự quan tâm đến công tác BVMT, chƣa đầu tƣ XLNT hoặc chậm đổi mới, thay thế các công nghệ sản xuất hiện đại hạn chế ô nhiễm môi trƣờng.
- Phần lớn nƣớc thải nông nghiệp chƣa đƣớc thu gom, xử lý và kiểm soát ô nhiễm. Hầu hết nƣớc thải ở từ bệnh viện, các trung tâm y tế và trạm xá chƣa đƣợc xử lý triệt để đảm bảo vấn đề xả thải theo quy chuẩn cho phép.
- Thị xã Quảng Trị đang khởi động dự án xây dựng cải tạo hệ thống cấp nƣớc và xử lý nƣớc thải đô thị (ODA). Dự án hoàn thành sẽ góp phần quan trọng trong việc thoát nƣớc thải đô thị và đảm bảo vệ sinh môi trƣờng trên địa bàn.