2.1. Công cụ của EMBI/EBI ( Viện tin sinh học của châu Âu):2.1.1. Similarity và Hemology: 2.1.1. Similarity và Hemology:
Phân tích mức độ giống nhau và tương đồng giữa các trình tự.
Các công cụ như FASTA, BLAST,MPSRCH và SCANPS. Dạng tìm kiếm kết quả trả về email cũng được phát triển.
2 chương trình thường được dùng cho chức năng này là BLAST và FASTA
Chương II. TÌM KIẾM CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC
2.1. Công cụ của EMBI/EBI ( Viện tin sinh học của châu Âu):2.1.1. Similarity và Hemology: 2.1.1. Similarity và Hemology:
Chương II. TÌM KIẾM CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC
2.1. Công cụ của EMBI/EBI ( Viện tin sinh học của châu Âu):2.1.1. Similarity và Hemology: 2.1.1. Similarity và Hemology:
2.1.2. Phân tích chức năng protein:
Chương II. TÌM KIẾM CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC
2.1. Công cụ của EMBI/EBI ( Viện tin sinh học của châu Âu):
Phân tích trình tự protein: xác định được các vùng mã hóa
protein của một trình tự DNA. ClustalWso sánh trình tự DNA hoặc protein để xác định mối quan hệ cũng như nguồn gốc tiến hóa
của chúng.
Chương II. TÌM KIẾM CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC
2.2. Công cụ của NCBI:
2.2.1. Các công cụ phân tích trình tự:
Công cụ quan trong là Tìm khung đọc mở (ORF Finder): Một công cụ phân tích hiện thị dưới dạng đồ hoạ cho phép tìm các khung đọc mở của một đoạn trình tự hoặc một trình tự có trong CSDL.
Chương II. TÌM KIẾM CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC
2.2. Công cụ của NCBI:
2.2.1. Các công cụ phân tích trình tự:
Chương II. TÌM KIẾM CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC
2.2. Công cụ của NCBI:
Chương II. TÌM KIẾM CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC
Blast homepage: Cho phép truy cập vào chương trình và công cụ của Blast, các trợ giúp…
2.2.2. Phân tích trình tự tương đồng:
Chương II. TÌM KIẾM CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC
2.3. Các trình duyệt Entrez:
Chương II. TÌM KIẾM CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC
Các trình duyệt Entrez cũng cung cấp khả năng tìm kiếm
MEDLINE ( http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi), một cơ sở dữ liệu trên xuất bản phẩm sinh học và y tế có thể truy cập tại Thư viện Y khoa Quốc gia. Trích dẫn bao gồm cả thông tin về (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});
protein hay trình tự nucleotide được liên kết đến các mục trình tự cơ sở dữ liệu tương ứng và các trích dẫn liên quan khác. Cơ sở này cho phép tìm thấy một số lượng lớn các trích dẫn thuộc vào khu vực của bạn quan tâm một khi bạn đã tìm thấy một vài trích dẫn có liên quan, và làm tăng đáng kể sức mạnh của tìm kiếm của bạn.
Chương II. TÌM KIẾM CƠ SỞ DỮ LIỆU SINH HỌC