Tổ chức quản lý sản xuất của doanh nghiệp sản xuất nông nghiệp cũng ảnh hưởng đến tổ chức kế toân. Tổ chức quản lý sản xuất ở doanh nghiệp sản xuất nông nghiệp bao gồm: bộ phận quản lý chung toăn doanh nghiệp vă đội (phđn xưởng) sản xuất.
Câc đội (phđn xưởng) sản xuất của doanh nghiệp thường được tổ chức theo chuyín ngănh trồng trọt, chăn nuôi, chế biến hoặc câc đội sản xuất phụ thuộc như đội mây căy, đội lăm phđn, đội sửa chữa…. Ngoăi ra, cũng có thể được tổ chức thănh đội sản xuất hỗn hợp như vừa trồng trọt, vừa chăn nuôi. Mỗi đội sản xuất đều có một ban quản lý đội thường gồm một đội trưởng, đội phó, nhđn viín hạch toân đội…
Đội sản xuất được giao cho một số ruộng đất, cơ sở vật chất, kỹ thuật vă quản lý một số lao động nhất định để tiến hănh sản xuất sản phẩm theo nhiệm vụ của rừng đội.
Trong điều kiện thực hiện cơ chế khoân sản phẩm thì người lao động có thể nhận khoân theo đội sản xuất hoặc nhận khoân trực tiếp với doanh nghiệp.
Nếu nhận khoân theo đội sản xuất thì mỗi đội sản xuất lă một đối tượng hạch toân. Nếu người lao động nhận khoân trực tiếp với doanh nghiệp thì mỗi hộ nhận khoân lă một đối tượng theo dõi thanh toân của doanh nghiệp.
Từ đặc điểm năy, yíu cầu công tâc quản lý phải tăng cường việc hạch toân kinh tế nội bộ. Kế toân phải tổ chức phản ânh, theo dõi chi phí phât sinh theo từng đơn vị sản xuất, theo từng bộ phận khoân, theo từng hình thức sản xuất, loại sản phẩm cụ thể để có cơ sở giâm đốc dự toân chi phí theo từng đơn vị sản xuất, hộ nhận khoân, đồng thời có số liệu để tính giâ thănh sản phẩm vă tính định mức giao khoân sản phẩm.