Về tổng thể, bộ mấy quản lý hành chính về cổ phần hoá tổ chức chỉ đạo cha tập trung, thiếu tính nhất quán giữa trung ơng và địa phơng, giữa các bộ ngành. Ví dụ có những doanh nghiệp đã làm xong thủ tục nhng chính quyền địa phơng vẫn không cho phép hoạt động, gây khó khăn không ít cho doanh nghiệp cổ phần, tạo tâm lý chản nản trong các cổ đông vì trong vòng 2 năm đó
vốn không đợc luân chuyển (nh công ty chế biến hàng xuất khẩu Long An, công ty chế biến thức ăn gia súc VIFOCO...)
Để giải quyết, nhà nớc phải mở rộng quyền hạn cũng nh trách nhiệm của ban chỉ đạo trung ơng cổ phần hoá. Hoặc nhà nớc có thể thành lập một Tổng cục chủ quản hoặc tơng đơng nh vậy chuyên trách về cổ phần hoá để điều chỉnh quá trình cổ phần hoá doanh nghiệp nhà nớc và hoạt động của công ty cổ phần. Cơ quan chuyên trách này sẽ chịu trách nhiệm theo dõi, chỉ đạo và có đủ thẩm quyền để giải quyết các vấn đề liên quan đến cổ phần hoá cũng nh phối hợp hoạt động của các Bộ, ngành và các cơ quan hữu quan, đồng thời cũng phải quy định rõ quyền hạn và nhiệm vụ của các cấp cơ quan này, tránh sự “chồng chéo, lấn sâu” của nhau, tránh tình trạng cấp trên “bàn vào”, cấp dới “bàn ra” nh trong thời gian vừa qua, dẫn tới sự chán nản của các doanh nghiệp Nhà nớc muốn cổ phần hoá. Một yêu cầu quan trọng nữa là phải tập trung về đây các cán bộ có năng lực chuyên môn, có trình độ, quy định rõ rằng về trách nhiệm của từng ngời.
Tăng cờng hơn nữa vai trò chủ đạo của trung ơng. Chính phủ phải đẩy mạnh việc kiện toàn tổ chức bộ máy chỉ đạo cổ phần hoá từng trung ơng đến địa phơng theo hớng gọi nhẹ, thiết thực, đồng thời tăng cờng sự kiểm tra, giám sát của Nhà nớc trong quá trình cổ phần hoá để đảm bảo đúng chủ trơng, đờng lối, chính sách của Đảng và Nhà nớc.