Bệnh viện Y Dược cổ truyền Sơn La là Bệnh viện hạng III có quy mô 360 giường bệnh. Tổng số cán bộ, y, bác sỹ và nhân viên là 149 người; trong đó, người có trình độ đại học 60, bác sĩ (số bác sỹ có trình độ sau đại học là: BS.CKII 2, BS.CKI: 14). Hàng năm, Ban Giám đốc Bệnh viện đều cử các bác sỹ, điều dưỡng viên đi học Chuyên khoa II, Thạc sĩ, Chuyên khoa I và Chuyên khoa định hướng tại các trung tâm đào tạo và các bệnh viện đầu ngành ở Hà Nội, Thái Bình, Nam Định...Cùng với việc nâng cao chất lượng chuyên môn. Bệnh viện không ngừng nêu cao tinh thần, thái độ phục vụ, giảm phiền hà cho người bệnh. Bệnh viện đã tăng cường thêm 4 bàn khám tại Khoa khám bệnh. Năm 2017, bệnh viện đã thành lập tổ “Chăm sóc khách hàng” để đón tiếp và hướng dẫn các thủ tục cho người bệnh và người nhà người bệnh nhờ đó làm tăng sự hài lòng của người bệnh. Số lượt người bệnh đến khám và điều trị ngày càng tăng, trung bình mỗi năm bệnh viện có khoảng 5.800 lượt người đến khám và điều trị bệnh. Năm 2018 bệnh viện tự chủ hoàn toàn về tài chính, đã tiến hành cải tạo cơ sở vật chất, mua sắm trang thiết bị y tế hiện đại để phục vụ công tác khám, chữa bệnh.
Bên cạnh việc nâng cao chất lượng khám chữa bệnh, bệnh viện còn quan tâm đến nâng cao chất lượng chăm sóc người bệnh. Trong những năm gần đây bệnh viện cử cán bộ đi học đại học điều dưỡng và điều dưỡng chuyên khoa I tại trường Đại học Điều dưỡng Nam Định.
Bệnh viện khám điều trị và chăm sóc cho người bệnh THA, bệnh tim mạch, bệnh đột quỵ, và cấc bệnh về cơ xương khớp...Bằng phương pháp Y Học cổ truyền kết hợp điều trị Y học hiện đại.
Thực hiện theo quyết định số 86/QĐ-KCB ngày 15 tháng 7 năm 2014 của Cục trưởng cục quản lý, khám chữa bệnh, Bộ y tế về tiêu chuẩn chất lượng và xử trí đột quỵ não áp dụng thí điểm trong bệnh viện ở Việt Nam. Thực hiện tiếp nhận khám bệnh cho đối tượng người bệnh vào viện, khám và điều trị cho người bệnh trong khoa theo quy định của bệnh viện, nhằm phát hiện và kịp thời đưa ra phác đồ điều trị. Phối hợp cùng với bác sỹ, điều dưỡng là người trực tiếp chăm sóc và thực hiện
thuốc cho người bệnh. Mỗi người bệnh có một bệnh án, mỗi diễn biến trong đợt bệnh đều được ghi chép đầy đủ.