CÁC DẠNG CÂY NGUỒN GỐC CHỦNG LOẠ

• Nguyên lý: dựa trên khả năng xúc tác của enzyme DNA

3.2.2.CÁC DẠNG CÂY NGUỒN GỐC CHỦNG LOẠ

Có hai dạng cây phát sinh chủng loại:

+ Dạng cây không có gốc, chỉ đơn thuần hiển thị mức độ giống nhau không hiển thị nguồn gốc chung của các taxon nghiên cứu (phenogram).

+ Dạng cây hiển thị cả quan hệ tiến hóa và nguồn gốc chung của các taxon (cladogram).

3.2.3. MỘT SỐ CHƯƠNG TRÌNH SỬ DỤNG ĐỂ DỰNG CÂY PHÁT SINH CHỦNG LOẠI ĐỂ DỰNG CÂY PHÁT SINH CHỦNG LOẠI

 Cùng với sự phát triển của khoa học kỹ thuật, nhiều chương trình phần mềm máy tính để dựng cây phát sinh chủng loại đã được công bố và không ngừng được hoàn thiện.

 Một số chương trình thường gặp trên các tài liệu phân loại sinh học phân tử:

 Chương trình NTSYS: sử dụng phương pháp phân tích cụm theo nguyên tắc liên kết trung bình cộng.

 Chương trình PAUP (Phylogenetic Analysis Using Parsimony): phân tích giả định nguồn gốc chủng loại theo nguyên tắc ngắn gọn.

 Chương trình Maximum-likelihood Estimation trên cơ sở giả định: quá trình tiến hóa của sinh vật theo một mô hình ngẫu nhiên đơn giản.

 Chương trình PHYLIP (Phylogeny Inference Package).

3.2.4. KHÓ KHĂN CỦA VIỆC SỬ DỤNG CÂY NGUỒN GỐC CHỦNG LOẠI CÂY NGUỒN GỐC CHỦNG LOẠI

Việc sử dụng cây nguồn gốc chủng loại để minh họa cho các kết quả nghiên cứu gặp một số khó khăn cơ bản về lý thuyết và thực nghiệm: cùng một nguồn dẫn liệu nhưng sử dụng các chương trình máy tính khác nhau, sẽ dựng được nhiều cây phát sinh chủng loại khác nhau, và chưa có nhà phân loại học nào phân tích để xác định xem chương trình nào là tốt nhất, kể cả việc lựa chọn cây nào trong số đó cũng là một khó khăn.

IV. GIÁ TRỊ PHÂN LOẠI HỌC CỦA CÁC ĐẶC ĐIỂM SINH HỌC PHÂN TỬ SINH HỌC PHÂN TỬ

Các kỹ thuật nghiên cứu sinh học phân tử đã bổ sung cho phân loại học sinh vật một loại đặc điểm phân loại hoàn toàn khác với tất cả các đặc điểm đã dùng trong phân loại học truyền thống.

• Phân loại sinh học phân tử có khả năng phát hiện những sai lầm, những điểm chưa hợp lý trong phân loại học truyền thống.

• Các kết quả nghiên cứu của sinh học phân tử cung cấp những thông tin khách quan có độ tin cậy cao, giúp giải quyết những khó khăn mà phân loại học truyền thống không giải thích được.

– Các số liệu phân tích và so sánh protein là những đặc điểm phân loại có giá trị được sử dụng cả trong phân loại vi mô và phân loại vĩ mô.

– Nhiều kỹ thuật phân tích protein được áp dụng để phân loại và xác định các loại nguồn gốc chủng loại của sinh vật kể cả nhân sơ và nhân chuẩn.