Hệ thống cơ sở hạ tầng kinh doanh điện tử và thương mại điện tử của Trung tâm chưa tương xứng và đồng bộ gây khó khăn không nhỏ cho việc ứng dụng. Việc truy cập Internet thông qua mạng điện thoại đã làm gia tăng chi phí đó là tiền điện thoại phụ trội, bên cạnh đó tốc độ đường truyền còn chậm việc download thông tin tốn nhiều thời gian.
Hoạt động giao dịch mới chỉ ở mức độ trao đổi thông tin, chào chương trình du lịch, giới thiệu…và các hoạt động này cũng chưa được khai thác triệt để phục vụ cho hoạt động kinh doanh của Trung tâm.
Công ty vẫn chưa có các thống kê phân tích đầy đủ và chi tiết về hiệu quả kinh doanh bằng hình thức kinh doanh điện tử và thương mại điện tử để phục vụ cho hoạt động kinh doanh của Trung tâm trong thời gian tới.
Thực tế cho thây việc quảng cáo trến Website vẫn chưa đem lại hiệu quả cao, do Trung tâm không tích cực quảng cáo Website của mình, và thông tin không được cập nhật.
Nhân lực phục vụ cho hoạt động kinh doanh bằng kinh doanh điện tử và thương mại điện tử còn thiếu nhiều và chưa được đào tạo. Ngoài những kiến thức thông thường về Internet như gửi và nhận email, tìm kiếm thông tin trên mạng thì đội ngũ nhân viên của Trung tâm chưa có sự am hiểu sâu sắc về lợi ích và nghiệp vụ của kinh doanh điện tử và thương mại điện tử .
Trung tâm vẫn chưa có tiến trình ứng dụng kinh doanh điện tử và thương mại điện tử một cách có hệ thống bài bản và có hiệu quả