Theo kế hoạch của Chính phủ đến năm 2005, Nhà nước chỉ còn duy trì khoảng 2000 doanh nghiệp 100% vốn nhà nước tập trung vào các doanh nghiệp hoạt động công ích, các doanh nghiệp thuộc lĩnh vực độc quyền có ý nghĩa lớn đối với nền kinh tế quốc dân. Các doanh nghiệp nhà nước thuộc bộ GTVT không nằm trong các loại hình doanh nghiệp trên thời gian tới cần theo hướng:
Thứ nhất: Tất cả các Tổng công ty, các doanh nghiệp thuộc Bộ GTVT, các DNNN đều phải thực hiện cổ phần hoá. Lập kế hoạch phân loại số doanh nghiệp nhà nước hiện có mà không cần giữ 100% vốn nhà nước thành các loại doanh nghiệp nhà nước giữ cổ phần chi phối doanh nghiệp nhà nước có cổ phần đặc biệt. Doanh nghiệp nhà nước chỉ nắm giữ cổ phần ở mức thấp và DNNN không cần nắm giữ cổ phần. Trên cơ sở kế hoạch hoá đã lập, từng bước triển khai thực hiện CPH 15 đơn vị trong năm 2001 không kể số lượng chuyển tiếp năm 2001.
Thứ hai: Tích cực giải quyết các khoản nợ của các DNNN theo chủ chương xử lý nợ của Chính phủ và phù hợp với các doanh nghiệp. Đối với các doanh nghiệp khó khăn về tài chính mà Nhà nước chưa cấp đủ vốn theo quy định thì cho khoanh một số khoản nợ như: Vay đầu tư chiều sâu, vay vốn kinh doanh do ngân sách nợ tiền thanh toán (nợ khối lượng XDCB hoàn thành chưa thanh toán). Chuyển nợ vay nước ngoài để đầu tư mua sắm tài sản cố định thành nợ trong nước với lãi suất ưu đãi. Những khoản nợ khó đòi hoặc không có khả năng trả cho tính vào kết quả kinh doanh nếu doanh nghiệp làm ăn có lãi, xoá nợ hoặc ghi giảm vốn với doanh nghiệp không có lãi.
Thứ ba: Giải quyết tốt về lao động việc làm, tạo tiền đề cho việc thực hiện thành công chương trình cổ phần hoá. Bảo đảm quyền lợi thoả đáng cho lao động dôi dư về các mặt bảo hiểm xã hội, trợ cấp, đào tạo lại... với phương châm Nhà nước, doanh nghiệp và người lao động đều có trách nhiệm.
Thứ tư: Tăng cường tổ chức chỉ đạo đối với công tác cổ phần hoá cũng như công tác giao, bán, khoán, cho thuê DNNN. Kiện toàn các ban, đổi mới doanh nghiệp từ Bộ đến các Tổng công ty, các đơn vị trực thuộc. Gắn trách nhiệm tổng giám đốc, HĐQT với nhiệm vụ đổi mới, phát triển doanh nghiệp, nhiệm vụ chuyển đổi hình thức sở hữu doanh nghiệp.