IV. Các biện pháp xử lý vớng mắc và phơng hớng sắp tới 1.Về phơng pháp tính thuế GTGT.
4. Về khấu trừ thuế.
Hầu hết các nớc áp dụng phơng pháp khấu trừ thuế đều sử dụng phơng pháp lấy thuế đầu ra trừ thuế đầu vao. Nếu hoá đơn đầu vào không ghi số thuế GTGT thì không đợc khấu trừ. ậ nớc ta trong các văn bản luật mới ban hành đã qui định cho khấu trừ thuế GTGT đầu vào (1% đến 5%) nhng chỉ áp dụng đối với hàng hoá nông, lâm hải sản mua trực tiếp của ngời sản xuất không có hoá đơn, nhng có bản kê. Sau gần 9 tháng thực hiện, Chính phủ ban hành Nghị định 78/1999 - NĐ - CP cho phép khấu trừ thuế đầu vào đôi với cả phế liệu (3% đến 5%), đối với hàng chịu thuế tiêu thụ đặc biệt đầu vào (4%) và tất cả hàng hoá, dịch vụ đầu vào khác có hoá đơn hàng hoá thông thờng đợc khấu trừ 3%. Việc cho khấu trừ thuế đầu vào lại phát sinh những vớng mắc nh: Có nhiều tỷ lệ khấu trừ khác nhau nên rất phức tạp trong quá trình thực hiện và không khuyến khích sử dụng hoá đơn chứng từ. Đối với hàng hoá nông, lâm, hải sản không cần hoá đơn, chỉ cần bản kê dẫn tới có trờng hợp cơ sở sản xuất mua của ngời kinh doanh buôn chuyến, ngời thu gom trốn thuế, các doanh nghiệp không lấy hoá đơn bán hàng, tạo kẽ hở để cơ sở kinh doanh buôn chuyến, ngời thu gom trốn thuế. Các doanh nghiệp mua nông, lâm, hải sản sau đó sơ chế bán hàng trong nớc thì đợc khấu trừ thuế nhng nếu xuất khẩu lại không đợc trừ thuế đầu vào.
Giải pháp trớc mắt khi vẫn còn sử dụng 2 phơng pháp tính thuế và các mức thuế suất nh hiện nay:
Đối với hàng hoá, dịch vụ đầu vào mua của ngời trực tiếp sản xuất kinh doanh không có hoá đơn, chỉ có bản kê, đợc khấu trừ 3% trên giá trị hàng hoá, dịch vụ, kể cả mua để xuất khẩu và chế biến hàng xuất khẩu.
Đối với hàng hoá, dịch vụ chịu thuế GTGT mua của ngời kinh doanh có hoá đơn bán hàng thông thơng, kể cà hàng hoá của cơ sở sản xuất thuộc diện tính thuế tiêu thụ đặc biệt, thì đợc khấu trừ 4% trên giá trị hàng hoá mua vào.
Cho phép khấu trừ hoặc hoàn lại thuế GTGT trong trờng hợp giao hàng hoặc cung ứng dịch vụ bị huỷ bỏ, sau khi đã chấp nhận trả tiền của ngời mua hoặc trờng hợp giảm giá, các khoản thu không đòi, đợc xử lý có đầy đủ chứng tà hợp lệ.
Giải pháp lâu dài: Khi dã áp dụng một phơng pháp tính thuế và 2 mức thuế suất nh kiến nghị ở trên thì toàn bộ giá trị hàng hoá, dịch vụ đầu vào không thuộc diện tính thuế GTGT mà đầu ra tính thuế GTGT thì sẽ đợc khấu trừ 4% giá trị trên bản kê hoặc hoá đơn thông thờng tính cho cả những hàng hoá, dịch vụ bán trong nớc, xuất khẩu hoặc chế biến hàng xuất khẩu.
