Luật quản lý thuế cĩ hiệu lực từ ngày 01/07/2007 là đã cĩ phân định trách nhiệm của người nộp thuế, cơ quan chi trả thu nhập, cơ quan thuế và các ban ngành liên quan. Tuy nhiên, do mới bắt đầu áp dụng, chưa trải qua nhiều thực tế nên cũng chưa bộc lộ các nhược điểm. Thuế thu nhập là một loại thuế trực thu, người chịu thuế cũng là người nộp thuế nên cơng tác quản lý khá phức tạp. Để hồn thiện quản lý thuế thu nhập, cần xem xét thực hiện các vấn đề sau:
- Mã số thuế, mã số cơng dân: Bên cạnh việc cấp mã số thuế cho các doanh nghiệp, tất cả những người cĩ thu nhập dưới bất cứ hình thức nào nào phải đăng ký mã số thuế, mọi người dân đều được cấp mã số cơng dân để thuận tiện cho việc theo dõi mức giảm trừ người phụ thuộc của các đối tượng nộp thuế.
- Vấn đề mấu chốt hiện nay trong cơng tác quản lý thu thuế là khơng xác định được thu nhập của người dân. Thanh tốn khơng dùng tiền mặt là điều kiện đầu tiên được kể đến để giải quyết vấn đề này. Tiếp theo là cơng khai thơng tin về khách hàng của các ngân hàng và các tổ chức tín dụng. Đây là nhiệm vụ rất nặng nề và cấp thiết của nhà nước ta.
- Nâng cao trách nhiệm, xác định rõ nhiệm vụ của các các đơn vị và cá nhân liên quan. Trách nhiệm của các đối tượng liên quan cần phải được xác định rõ ràng, chi tiết nhằm giúp họ thực hiện đúng cơng việc của mình và xử lý nghiêm minh các trường hợp vi phạm.
- Các hình thức chế tài phải đủ sức răn đe các hành vi trốn thuế, gian lận thuế. Từ trước đến nay, các hình thức chế tài ở nước ta quá nhẹ nên tình trạng vi phạm các quy định của thuế của đối tượng nộp thuế cũng như các tiêu cực của các cơ quan chức năng xảy ra quá nhiều. Cần phải xác định rõ chức năng, nhiệm
vụ của các đối tượng liên quan và hình thức chế tài thích đáng. Chẳng hạn, cá nhân, cơ quan chi trả thu nhập khơng kê khai và đĩng thuế thu nhập đúng quy định sẽ bị đền bù gấp nhiều số thuế gian lận. Cán bộ thuế, đơn vị thanh tra cấu kết với đối tượng nộp thuế để gian lận về thuế sẽ bị xử lý kỷ luật và đền bù gấp nhiều lần số thuế gian lận,…