Kiểm sốt nội bộ ngân hàng là tổng thể hệ thống các văn bản và các quy định về Ngân hàng, các cơ chế kiểm sốt được cài đặt trong tất cả các nghiệp vụ thuộc hệ điều hành của ngân hàng, hệ thống thơng tin báo cáo để kiểm sốt hoạt động quản lý, điều hành, tác nghiệp và đảm bảo tính tuân thủ nhằm hạn chế và kiểm sốt rủi ro cĩ thể phát
sinh trong quy trình nghiệp vụ và hoạt động của ngân hàng. Kiểm sốt nội bộ cĩ điểm mạnh hơn thanh tra NHNN ở tính thời gian vì nĩ nhanh chĩng, kịp thời ngay khi vừa phát sinh vấn đề và tính sâu sát của người kiểm tra viên, do việc kiểm tra được thực hiện thường xuyên cùng với cơng việc kinh doanh. Kiểm sốt nội bộ cần phải được xem như hệ thống “thắng” của cỗ xe tín dụng. Cỗ xe càng lao đi với vận tốc lớn thì hệ thống thắng này phải càng an tồn, hiệu quả thì mới tránh cho cỗ xe khỏi đi vào những ngã rẽ rủi ro vốn luơn luơn tồn tại thường trực trên con đường đi tới. Nếu làm tốt, cơng tác này sẽ trở thành lá chắn thứ nhất đảm bảo an tồn cho ngân hàng.
Tuy nhiên, hoạt động kiểm sốt nội bộ của các NHTM trong thời gian qua chưa theo kịp với tốc độ tăng trưởng tín dụng. Cơng tác này chưa thực hiện đúng nhiệm vụ của nĩ mà mang nặng tính hình thức. Các báo cáo kiểm sốt nội bộ thường chỉ là tổng hợp, phân tích, thống kê các số liệu từ báo cáo của bộ phận tín dụng nên chưa thể hiện được tính độc lập, tính kiểm tra và cảnh báo của mình.
Nguyên nhân là do lãnh đạo của các NHTM hầu như chưa thực sự chú trọng đến cơng tác này và do thiếu nhân sự cĩ đủ trình độ chuyên mơn để thực hiện.