Cũng nh các công ty xây dựng khác , do dặc điểm của nghành xây dựng cơ bản là sản phẩm xây dựng có tính đơn chiếc, thời gian xây dựng dài và có tính thi công nhiều địa điểm khác nhau.... nên việc tổ chức sản xuất ,tổ chức bộ máy ở công ty cũng mang những đặc thù riêng và ngày càng hoàn thiện, đổi mới đáp ứng yêu cầu quản lí phù hợp với chính sách chế độ qui định. Mô hình tổ chức sản xuất, tổ chức bộ máy quản lí của công ty đợc tổ chức theo hình thức trực tuyến chức năng: công ty-> Phòng chức năng -> Đội xây lắp -> tổ-> ngời lao động theo tuyến kết hợp với các phòng ban chức năng .
Đứng đầu là Giám đốc công ty: ngời giữ vai trò chủ đạo, lãnh đạo chung toàn công ty, là đại diện pháp nhân của công ty trớc pháp luật và cũng là ngời chịu toàn bộ kết quả hoạt động sản xuất kinh doanh của công ty .
Để giúp cho Ban giám đốc quản lí đợc tới đội, công trình, các tổ sản xuất một cách hiệu quả thì công ty thành lập các phòng ban chức năng . Các phòng ban chức năng có nhiệm vụ theo dõi, hớng dẫn đôn đốc việc thực hiện chế độ thi công đảm bảo chất lợng công trình thực hiện các định mức kinh tế, kĩ thuật , các chế độ quản lí của công ty , đồng thời thực hiện việc lập kế hoạch nghiên cứu tìm hiểu thị trờng , tìm bạn hàng, cung cấp thông tin số liệu cần thiết, phân tích tình hình sản xuất kinh doanh giúp cho lãnh đạo của công ty có biện pháp giám sát, quản lí thích hợp. Mặt khác, giải quyết mọi liên quan đến tổ chức nhân sự, chính sách lao động tiền lơng ... cho cán bộ công nhân viên chức trong công ty .
Đặc biệt phòng tài chính kế toán có nhiệm vụ tổ chức thực hiện công tác tập hợp chi phí sản xuất trong toàn công ty và các đơn vị trực thuộc , theo dõi và hạch toán các khoản chi phí phát sinh. Căn cứ vào số liêu của từng khoản mục đợc phòng kế hoạch kĩ thuật lấy ra từ dự toán , kiểm tra ,giám sát các khoản chi phí đã hợp lí cha ,từ đó có biện pháp khắc phục . Đồng thời phải chịu trách nhiệm lo thanh toán vốn đảm bảo cho công ty đợc hoạt liên tục, mặt khác cũng phải chịu trách nhiệm về các thông tin do kế toán cung cấp
Do các công trình thi công xây dựng khác nhau , thời gian xây dựng dài ,mang tính đơn chiếc nên lực lợng lao động công ty đợc tổ chức thành các Đội xây lắp. Trong mỗi Đội xây lắp lại chia thành các tổ sản xuất( tổ mộc, tổ nề ....). Theo yêu cầu thi công và tuỳ thuộc vào nhu cầu sản xuất thi công của từng công trình mà số Đội xây lắp đợc tổ chức và thay đổi phù hợp với điều kiện cụ thể .
Sơ đồ tổ chức bộ máy quản lí Công ty vật liệu xây dựng và xây lắp Thơng Mại