a) Kế toán chi phí NVL trực tiếp:
Do xí nghiệp cho phép đội thi công có thể tự huy động NVL phục vụ thi công công trình nên một thực tế khó tránh khỏi là việc chủ công trình móc ngoặc với nhà cung cấp để làm tăng chi phí NVL trực tiếp lên so với thực tế. hoặc lợi dụng tỷ lệ hao hụt định mức để bớt xén NVL, hay sử dụng NVL kém chất lượng. Dẫn đến chất lượng công trình kém, giảm hiệu quả của hoạt động quản lý vật tư. Bên canh đó, chất lượng công trình kém có thể dẫn tới những trục trặc trong thời gian bảo hành, khiến chi phí bảo hành tăng, giảm hiệu quả kinh doanh trong kì của xí nghiệp hoặc kéo dài thời gian thi công.
b) Kế toán chi phí nhân công trực tiếp:
Theo quy định của xí nghiệp, đơn giá nhân công được quy định rõ trong bản hợp đồng giao khoán, do đó có sự khác nhau giữa tiền lương mà công nhân được hưởng trong mỗi công trình, mỗi đội xây dựng. Hơn nữa, số lượng công nhân của các đội lại khác nhau, lại bao gồm cả lao động dài hạn và lao động thời vụ nên khối lượng công việc của kế toán tiền lương là lớn và thường bị dồn về cuối tháng, khi các đội nộp chứng từ có liên quan như bảng chấm công…
Bên cạnh đó, việc hạch toán lương phải trả cho công nhân thuê ngoài vào TK 335 là chưa hợp lý. Tuy việc này không ảnh hưởng tới khoản mục chi phí NCTT nhưng sẽ khiến công tác kế toán phức tạp và không phù hợp với quy định chung.
c) Kế toán chi phí sử dụng máy thi công:
Việc hạch toán chi phí sử dụng máy thi công hiện nay tại xí nghiệp chưa đạt hiệu quả như mong muốn. Thứ nhất là do đây cũng là một điểm có nhiều chỉnh sửa trong chế độ kế toán mới nhất của Bộ tài chính nên phần mềm kế toán của xí nghiệp mặc dù đã có sự điều chỉnh nhưng chưa thống nhất hoán toàn. Mặt khác, có một số khoản chi phí lẽ ra phải hạch toán vào TK 623 thì xí nghiệp lại hạch toán vào những khoản mục chi phí khác. Tuy tổng giá thành vẫn không đổi nhưng nó làm giảm độ chính xác trong việc tính toán từng khoản mục chi phí.
d) Kế toán chi phí sản xuất chung:
Hiện nay, tại xí nghiệp vẫn chưa có sự tách biệt trong việc phân chia chi phí sản xuất chung biến đổi và chi phí sản xuất chung cố định để phục vụ cho công tác kế toán quản trị. Đây cũng là một hạn chế hiện nay của bộ máy kế toan xí nghiệp. Trong bối cảnh tình hình hoạt động sản xuất kinh doanh diễn biến phức tạp như hiện nay thì việc không có một hệ thống kế toán quản trị hiệu quả là một hạn chế rất lớn của xí nghiệp.
Bên cạnh đó, xí nghiệp vẫn giữ nguyên phương pháp trích BHYT, BHXH theo lương chính còn KPCĐ theo lương khoán như trước là không phù hợp. Ngoài ra, căn cứ để trích trước chi phí cũng không hợp lý đố với những công trình do xí nghiệp quản lý chứ không tiến hành giao khoán như hầu hết các công trình khác.
Theo công thức đã nêu thì xí nghiệp tính giá trị sản phẩm dở dang theo giá dự toán của công trình mà không tiến hành các hoạt động kiểm kê, đánh giá giá trị, khối lượng công việc hoàn thành thực tế là thiếu chính xác.
f) Kế toán tính giá thành sản phẩm:
Công tác tính giá thành sản phẩm là rất quan trọng và phụ thuộc nhiều vào các nội dung hạch toán đã nêu ở trên. Do đó, những hạn chế trên sẽ dẫn đến giá thành tính ra là thiếu chính xác. Vì vậy, hoàn thiện các hạn chế trên sẽ giúp kế toán tính toán giá thành sản phẩm xây lắp một cách hiệu quả hơn.