Bên cạnh những thành tựu đạt được thì công ty vẫn còn những tồn tại cần phải khắc phục và giải quyết.
Một là công ty chưa đa dạng hóa các mặt hàng kinh doanh, cơ cấu nhập khẩu còn khá đơn điệu. Công ty kinh doanh chủ yếu là các mặt hàng săm lốp ô tô chiếm tỷ trọng rất lớn khoảng 70% trong tổng kim ngạch nhập khẩu của công ty. Điều này gây ảnh hưởng không nhỏ tới sức cạnh tranh của công ty vì không đa dạng hóa được các mặt hàng kinh doanh. Mặt hàng chính này có chi phí cao nhưng lợi nhuận mang lại chưa chắc đã bằng những mặt hàng phụ trợ có giá trị thấp hơn nhiều.
Hai là hình thức nhập khẩu chưa đa dạng nên chưa khai thác được những mặt hàng mang lại hiệu quả cao. Công ty mới chỉ áp dụng hai hình thức nhập khẩu là nhập khẩu trực tiếp và nhập khẩu uỷ thác trong đó nhập khẩu trực tiếp chiếm phần lớn. Hiện công ty nhập khẩu chủ yếu theo hình thức nhập khẩu trực tiếp nên chi phí rất lớn, rủi ro cao, gây áp lực đối với nguồn vốn của công ty, chưa tận dụng được nguồn vốn của nhà cung cấp nhằm đem lại lợi nhuận cho công ty.
Ba là thị trường nhập khẩu hàng hóa của công ty chưa đa dạng, mới chỉ tập trung vào một số thị trường truyền thống có quan hệ làm ăn lâu dài rồi
như là Thái Lan, Trung Quốc…dẫn tới chưa tận dụng và khai thác triệt để tiềm năng của những thị trường mới.
Bốn là tuy hoạt động nhập khẩu của công ty hàng năm đều mang lại lợi nhuận cho công ty song lợi nhuận đó chưa tương xứng với tiềm năng phát triển của công ty.
Năm là sức cạnh tranh của công ty so với các công ty kinh doanh cùng lĩnh vực trong thị trường còn chưa cao.
Ba là còn tồn tại nhiều bất cập trong hoạt động nhập khẩu như thời gian giao hàng giữa bên xuất khẩu và công ty không khớp dẫn tới sự lãng phí trong chi phí lưu kho, lưu bãi, một số hạn chế trong khâu thanh toán. Điều này dẫn tới việc tăng chi phí nhập khẩu, giảm lợi nhuận, dẫn tới việc thiếu đồng bộ trong hoạt động kinh doanh của công ty do việc bất ổn định nguồn hàng gây ra.
Bốn là công ty còn gặp phải rất nhiều khó khăn khi phải cạnh tranh hàng hóa của các doanh nghiệp lớn có vốn đầu tư nước ngoài, có sự hỗ trợ từ nước ngoài tại Việt Nam. Trong xu thế hội nhập ngày càng sâu và rộng như hiện nay thì tốc độ cạnh tranh diễn ra ngày càng quyết liệt, nhanh chóng vì vậy đòi hỏi doanh nghiệp phải có những chính sách phù hợp, kịp thời.
Năm là hệ thống trang thiết bị công nghệ thông tin còn lạc hậu, chưa ứng dụng được thương mại điện tử trong kinh doanh, chưa có website riêng…
Sáu là trình độ chuyên môn nghiệp vụ của cán bộ công nhân viên của công ty còn chưa cao, cần phải có kế hoạch đào tạo thêm.