Công ty Điện tử Sao Mai đợc tổ chức theo kiểu trực tuyến chức năng: Ban giám đốc lãnh đạo và chỉ đạo trực tiếp đến từng đơn vị sản xuất kinh doanh và các phòng ban chức năng nghiệp vụ.(hình vẽ)
Ban giám đốc: gồm 4 ngời
Giám đốc: là ngời đứng đầu, phụ trách chung về tất cả các mặt hàng sản xuất kinh doanh của Công ty, là ngời chịu trách nhiệm trớc Nhà nớc, cấp trên về toàn bộ hoạt động của công ty, đồng thời là ngời đại diện cho quyền lợi của toàn thể cán bộ công nhân viên.
Phó giám đốc phụ trách hành chính và đời sống. Phó giám đốc phụ trách kỹ thuật và nghiên cứu.
Các phòng ban chức năng:
Văn phòng Công ty: có nhiệm vụ tổ chức thực hiện và quản lý các công tác nghiệp vụ hành chính, đời sống hậu cần, xây dựng cơ bản, doanh trại, đối ngoại và an ninh.
Phòng kế hoạch tổng hợp: có nhiệm vụ tham mu quản lý các mặt công tác kế hoạch, giá thành, lao động, nhân sự, tiền lơng, chế độ, chính sách đào tạo, cơ điện, kỹ thuật công nghệ, sáng kiến, an toàn, chất lợng, tiêu chuẩn hoá, tổ chức bảo quản kho, tiêu thụ vật t thiết bị ứ đọng, đảm bảo và quản lý công tác vận tải, điện nớc cho toàn đơn vị.
Phòng tài chính: có nhiệm vụ tham mu và đảm bảo tài chính cho các hoạt động của Công ty, theo dõi, kiểm tra, giám sát các hoạt động tại chính kế toán của Công ty, hỗ trợ các công tác kế toán tài chính của các đơn vị thành viên, đảm bảo đúng pháp luật và đạt hiệu quả kinh tế.
Phòng thị trờng - hợp tác - đầu t: có nhiệm vụ tiếp cận thị trờng trong và Ngoài nớc, tham mu cho Giám đốc khả năng sản xuất kinh doanh cũng nh phát triển mặt hàng mới, giới thiệu quảng cáo sản phẩm, tổ chức liên doanh, liên kết với các đơn vị trong và Ngoài nớc trong phạm vi lĩnh vực hoạt động của Công ty.
Ban chính trị: có nhiệm vụ tổ chức công tác Đảng, công tác chính trị, dân vận và công tác quần chúng.
Công ty còn có 6 đơn vị thành viên hạch toán độc lập:
• Viện nghiên cứu điện tử
-Nghiên cứu, phát triển, tiếp nhận, chuyển giao công nghệ điện tử.
-Chế thử và sản xuất loại nhỏ các vật liệu, linh kiện gốm áp điện, bán dẫn, thiết bị điện tử phục vụ quốc phòng và kinh tế quốc dân.
-Thực hiện các dịch vụ về khoa học kỹ thuật.
• Xí nghiệp khí công nghiệp 81: sản xuất kinh doanh các loại khí công nghiệp phục vụ quốc phòng và kinh tế quốc dân.
• Xí nghiệp linh kiện điện tử: sản xuất kinh doanh vật liệu linh kiện, các sản phẩm điện máy điện tử phục vụ quốc phòng và kinh tế quốc dân.
•Xí nghiệp thiết bị điện tử: sản xuất kinh doanh lắp ráp các sản phẩm điện tử, điện lạnh, điện dân dụng.
•Xí nghiệp trang thiết bị công trình: xây lắp, chuyển giao công nghệ trang thiết bị công trình đờng dây và trạm đến 35KV.
•Xí nghiệp nhựa xốp Sao Mai: sản xuất các mặt hàng nhựa xốp phục vụ quốc phòng và kinh doanh của Công ty.
Các đơn vị trực thuộc khác
Phân xởng cơ khí điện tử: có nhiệm vụ tổ chức thực hiện các hoạt động sản xuất dịch vụ kỹ thuật, cơ khí, điện tử, cơ khí hoá và lắp ráp xe máy cũng nh các sản phẩm cơ khí khác.
Phân xởng hoá chất: nghiên cứu, sản xuất các sản phẩm hoá chất phục vụ yêu cầu sản xuất kinh doanh của Công ty.
Ngoài ra, để đảm bảo công ăn việc làm cho cán bộ công nhân viên trong Công ty, Công ty Điện tử Sao Mai còn có các tổ cơ khí T1, T3, phân xởng sản xuất kinh doanh quạt điện, đồng hồ (T2), và phân xởng chuyên sản xuất kinh doanh hàng nội thất.