Tạo bảng chứa dữ liệu

Một phần của tài liệu Xây dựng cư sở dữ liệu SSRs từ ESTs cuả cây dứa (Trang 56 - 58)

 Theo các mô tả trong mô hình đối tượng, ta chuyển từ mô hình đối tượng sang mô hình quan hệ như sau:

Mỗi đối tượng trong mô hình đối tượng là một quan hệ trong mô hình quan hệ.

Mỗi thuộc tính trong mô hình đối tượng là thuộc tính trên quan hệ tương ứng.

Khóa của đối tượng là khóa của quan hệ tương ứng. Tạo các quan hệ 1: , được trình bày hình 4.2

 tblStrain: chứa thông tin về các giống Ananas comosus, được trình bày ở bảng 3.1.

Bảng 3. 1. Nội dung tblStrain Tên trƣờng Kiểu dữ

liệu

Chú thích

StrainID Text Mã số quy định giống. StrainName Text Tên của giống.

DT339790.1 DT339790 JBW102H10.b_066.abi Pineapple root tip cDNA library Ananas comosus cDNA clone JBW102H10 similar to actin capping protein beta-2 -related, mRNA sequence

DT339789.1 DT339789 JBW102H08.b_050.abi Pineapple root tip cDNA library Ananas comosus cDNA clone JBW102H08 similar to thioredoxin -like protein, mRNA sequence

 tblMotifLengthGroup: chứa nội dung quy định mã các đoạn SSR

Bảng 3. 2. Nội dung tblMotifLengthGroup Tên trƣờng Kiểu dữ

liệu Chú thích

MotifLengthGroupID Text Mã số quy định chiều dài đoạn SSR MotifLengthGroup Text Chiều dài đoạn SSR.

MotifDescription Text Chú thích.

 tblEST, tblGenBank: nội dung chính của trình tự do NCBI quy định.

Bảng 3. 3. Nội dung tblEST Tên trƣờng Kiểu dữ

liệu Chú thích

dbESTID Text Mã số EST do NCBI quy định. ESTName Text Tên của EST.

GenbankAcc Text Chứa số truy cập trên NCBI. Genbank_gi Number Mã số gi do NCBI quy định. StrainID Text Mã số quy định giống.

Address Hyperlink Liên kết đến NCBI cho người dùng biết thêm thông tin.

SequenceLength Text Chiều dài của đoạn nucleotide. Sequence Text Trình tự.

Bảng 3. 4. Nội dung tblGenBank Tên trƣờng Kiểu dữ

liệu Chú thích

GenbankAcc Text Chứa số truy cập trên NCBI. Version Text Phiên bản của đoạn trình tự Date Text Ngày cập nhật mới nhất Definition Number Thông tin về đoạn trình tự.

 tblSSR: chứa thông tin về đoạn Microsatellite

Bảng 3. 5. Nội dung tblSSR Tên trƣờng Kiểu dữ

liệu Chú thích

SSRID Text Mã số của đoạn SSR.

GenbankACC Text Chứa số truy cập trên NCBI. SSRVersion Text Phiên bản của đoạn SSR dựa vào. MotifLengthGroupID Text Mã số quy định chiều dài đoạn SSR Motif Text Đoạn SSR. (adsbygoogle = window.adsbygoogle || []).push({});

NoOfRepeat Number Số lần lập lại. SSRSequence Text Trình tự đoạn SSR SSRStart Number Vị trí bắt đầu. SSREnd Number Vị trí kết thúc.

ShortSequence Text Đoạn trình tự ngắn dựa vào đoạn trình tự chính để người xem có thể dễ nhận ra vị trí đoạn SSR.

Một phần của tài liệu Xây dựng cư sở dữ liệu SSRs từ ESTs cuả cây dứa (Trang 56 - 58)