Trái phiếu đấu thầu qua Ngân hàng Nhà nước( được thực hiện tại Kho bạc Nhà nước trung ương). Từ giữa năm 1995, Kho bạc Nhà nước đã phối hợp với
Ngân hàng Nhà nước thành lập và đưa vào hoạt động thị trường đấu thầu trái phiếu Kho bạc, tạo thêm một kênh huy động vốn mới cho ngân sách Nhà nước, đồng thời góp phần thực hiện chính sách tiền tệ của Ngân hàng Nhà nước.
Với vai trò là tổ chức đại lý đấu thầu, thanh toán trái phiếu Chính phủ cho Bộ Tài chính, từ năm 1995 đến nay, NHNN đã tổ chức thành công hàng trăm phiên đấu thầu TPCP. Đặc biệt năm 2002 và 2003 TPCP phát hành qua Ngân hàng Nhà nước đã đạt được kết qua khích lệ với khối lượng huy động ngày một tăng. Cụ thể năm 2002 phát hành 8.410 tỷ đồng và năm 2003 phát hành 15.901 tỷ đồng và 9 triệu USD. Trong đó đối với trái phiếu bằng đồng Việt nam, tổng khối lượng trúng thầu của các Ngân hàng Thương mại Nhà nước năm 2002 là 7.527 tỷ đồng và năm 2003 là 14.963 tỷ đồng tương ứng chiếm 99,1% và 99,6% tổng khối lượng trái phiếu phát hành. Các Ngân hàng thương mại cổ phần tham gia đấu thầu rất hạn chế (năm 2002 có 2 ngân hàng thương mại tham gia, năm 2003 có 4 Ngân hàng thương mại tham gia). Các Ngân hàng thương mại đã căn cứ vào chỉ tiêu hoạt động tín dụng được cho phép và mức độ huy động vốn của nhà nước, dùng nguồn vốn nhàn rỗi của mình đầu tư vào trái phiếu. Mặt khác, các ngân hàng đã thực sự quan tâm đến việc đầu tư vào trái phiếu Kho bạc vì đây là hình thức đầu tư an toàn, có lãi. Hơn nữa khi có nhu cầu về vốn, trái phiếu kho bạc có thể sử dụng linh hoạt tại các nghiệp vụ thị trường mở, cho vay có đảm bảo bằng cầm cố giấy tờ có giá, chiết khấu, tái chiết khấu giấy tờ có giá và cho vay qua đêm với ngân hàng nhà nước để đảm bảo đủ khả năng thanh toán. Đối với các chi nhánh Ngân hàng nước ngoài, Ngân hàng liên doanh, do bị hạn chế về huy động đồng tiền của dân cư và chưa chú trọng đến đầu tư vào TPCP nên trong thời gian qua việc tham gia của các Ngân hàng này là không đáng kể. Các công ty bảo hiểm là các thành viên tham gia tích cực trong các năm với khối lượng trúng thầu đạt 10% - 20% khối lượng phát hành nhưng trong những năm gần đây các thành viên này chuyển sang đầu tư vào TPCP trung , dài hạn và đầu tư vào các loại hình khác nên không tham gia vào thị trường đấu thầu trái phiếu kho bạc. Các Ngân hàng thương mại đã bám sát tình hình thị trường và đưa ra mức lãi suất đấu thầu phù hợp. Việc Bộ Tài chính đưa ra khung lãi suất chỉ đạo trong từng thời kỳ và uỷ quyền cho KBNN Trung ương, Ban đấu thầu quyết định lãi suất trong từng phiên đã tạo ra sự chủ động trong việc xét thầu.
Lãi suất trúng thầu được hình thành thông qua đấu thầu đã phản ánh sát hơn quy luật cung cầu của thị trường tiền tệ. Khi vốn khả dụng của các ngân hàng thương mại dư thừa nhiều, lãi suất trái phiếu Kho bạc thấp và ngược lại, khi vốn khả dụng khan hiếm lãi suất trái phiếu kho bạc tăng.
Việc phát hành trái phiếu đấu thầu qua Ngân hàng Nhà nước có nhiều ưu thế: có khả năng huy động một khối lượng vốn lớn trong thời gian ngắn, lãi xuất thấp hơn hình thức bán lẻ trái phiếu trực tiếp cho công chúng; mặt khác, nghiệp vụ quản lý phát hành và thanh toán tương đối đơn giản, thuận lợi cho cả người phát hành và các nhà đầu tư.