Bên cạnh những thành tựu đạt được hoạt động tín dụng ĐTPT cũng bộc lộ một số hạn chế sau:
* Nguồn vốn huy động chưa đa dạng, chưa ổn định, chưa thực sự đáp ứng đầy đủ nhu cầu ĐTPT của toàn xã hội. Các nguồn truyền thống như vay của các TCTC, TCTD giảm đáng kể. Hình thức huy động mới như chứng chỉ tiền gửi, huy động ngoại tệ chưa được thực hiện.
Nguyên nhân :
- Cơ chế và phương thức huy động vốn chưa đa dạng, chưa thực sự gắn với thị trường.
- Tính thanh khoản của trái phiếu Chính phủ còn thấp do thị trường thứ cấp chưa phát triển.
- Tổ chức thực hiện chưa được phép huy động bằng ngoại tệ do vậy không thu hút được ngoại tệ trong nước cho hoạt động tín dụng ĐTPT nhằm giảm bớt áp lực huy động vốn bằng VNĐ.
- Công tác chăm sóc khách hàng cũng chưa được chú trọng do cán bộ thực hiện chưa có tính chuyên nghiệp cao trong công tác huy động vốn.
* Quản lý và đảm bảo an toàn vốn tín dụng ĐTPT vẫn chưa được thực hiện tốt gây ra tình trạng thất thoát, lãng phí và mất ổn định nguồn vốn.
Nguyên nhân :
- Các quy định về đảm bảo tiền vay của tổ chức thực hiện được ban hành nhưng lại không có văn bản hướng dẫn để thực hiện các quy định này.
- Các ràng buộc pháp lý về trách nhiệm của khách hàng vay vốn chưa được thiết lập đồng bộ và chặt chẽ, đặc biệt trong việc trả nợ gây khó khăn cho việc thu hồi nợ.
- Lượng vốn tín dụng ĐTPT chiếm phần đáng kể trong tổng lượng dư tín dụng của toàn nền kinh tế nhưng chưa nhận được sự giám sát, hỗ trợ thường xuyên của cơ quan quản lý Nhà nước về tiền tệ, tín dụng.
* Hoạt động cho vay ĐTPT tuy đã có nhiều khởi sắc nhưng nhìn chung doanh số cho vay chưa ổn định và tốc độ tăng trưởng tín dụng vẫn còn thấp so với tốc độ tăng trưởng tín dụng của toàn ngành ngân hàng. Đặc biệt là chất lượng nợ còn rất thấp đang là vấn đề bất cập đặt ra đối với tổ chức thực hiện.
Nguyên nhân:
- Cơ chế chính sách ban hành chưa đồng bộ. Văn bản hướng dẫn ban hành chậm gây ra sự lúng túng cho tổ chức thực hiện và chủ đầu tư.
- Công tác thu hồi nợ còn nhiều bất cập mà nguyên nhân chủ yếu là do công tác dự đoán, dự báo, thông tin tín dụng và khả năng phân tích đánh giá thị trường còn bị động.
- Chất lượng thẩm định dự án của tổ chức thực hiện còn yếu kém. Báo cáo thẩm định chưa có kết luận và kiến nghị đầu tư thực sự rõ ràng đối với từng nội dung được yêu cầu thẩm định; chưa đưa ra được những nhận xét, đánh giá về các chỉ tiêu về năng lực của chủ đầu tư nên dẫn đến tình trạng lựa chọn dự án cho vay không được khả thi. Đây là một tồn tại lớn của hoạt động tín dụng ĐTPT.
* Hoạt động cho vay ngắn hạn hỗ trợ xuất khẩu chưa thực sự được đẩy mạnh. Doanh số cho vay xuất khẩu chỉ chiếm tỷ lệ nhỏ trong tổng kim ngạch xuất khẩu của cả nước.
Nguyên nhân:
- Chính sách tín dụng ĐTPT có sự điều chỉnh theo hướng cắt giảm đối tượng cho vay để phù hợp với thực tiễn nên một số mặt hàng cho vay truyền thống đã không thuộc đối tượng vay vốn, làm ảnh hưởng đến doanh số cho vay.
- Lãi suất cho vay được điều chỉnh theo hướng tiếp cận dần với lãi suất thị trường. Điều này làm ảnh hưởng đến hoạt động cho vay của tổ chức thực hiện. Bởi vì lãi suất
nghiệp trong hoạt động nghiệp vụ của tổ chức này so với các ngân hàng thương mại thì còn thua kém.
- Hệ thống thanh toán quốc tế chưa có và việc mua bán bằng ngoại tệ cũng chưa được thực hiện đã gây ra các khó khăn cho hoạt động này. Bên cạnh đó tính chuyên nghiệp trong công tác phục vụ khách hàng còn yếu. Trong tương lai với cơ chế cho vay thông thoáng cộng với các dịch vụ trọn gói các ngân hàng thương mại sẽ có nhiều lợi thế hơn trong việc thu hút khách hàng. Điều này sẽ đẩy tổ chức thực hiện vào vị trí tụt hậu hơn so với các ngân hàng khác.
* Hoạt động hỗ trợ lãi suất sau đầu tư và bảo lãnh tín dụng vẫn chưa được tăng cường. Điều đó cho thấy hình thức cho vay vẫn là hình thức chủ yếu trong hoạt dộng tín dụng ĐTPT.
Nguyên nhân :
- Hồ sơ để xem xét dự án được hỗ trợ lãi suất sau đầu tư còn phức tạp. - Đối tượng được hỗ trợ lãi suất sau đầu tư hẹp
- Uy tín của tổ chức thực hiện đối với các tổ chức tín dụng khác chưa cao cũng là nguyên nhân hạn chế hoạt động bảo lãnh tín dụng.
- Các chủ đầu tư vẫn có tâm lý chung thích vay vốn tín dụng ưu đãi hơn là bảo lãnh tín dụng hay hỗ trợ lãi suất sau đầu tư vì thế nhu cầu của các dự án với hai hình thức này còn hạn chế.